后生小辈李森科也是瓦维洛夫把他介绍给苏联生物学界的。1929年，瓦维洛夫邀请李森科参加在列宁格勒举行的全苏遗传学家和育种家代表大会，并作报告。李森科在会上作了关于"春化法"的学术报告，没有引起什么反响。有的学者提出："春化法"就是早已有的"冷冻催芽"和光周期现象，作为一种农业技术方法早已有人做过，并写过文章；并说李森科在学术上不够诚实。瓦维洛夫为李森科作解释，说李森科的实验有自己的特点，应当谅解青年人的不成熟。
    此时，农业集体化运动正在猛烈地开展起来，李森科凭着他的政治嗅觉，胡吹"春化法"能奇迹般地提高农作物的产量，缩短农作物的生长期，对寒冷地区尤有奇效。李森科说：在播种前浸泡过的种子，每公顷至少可以提高100公斤的收成。如果在1亿公顷土地上播种浸泡过的种子，那就能多收获100亿公斤的谷物。
    瓦维洛夫作为一位严谨的科学家提醒说："春化法"是正在试验中的事，需要检查。李森科不仅不听瓦维洛夫善意的劝告，反而在报纸和电台上宣布：最好的检查是将"春化法"直接在田野里，在数百万公顷的土地上接受考验，"只有在千百万集体农庄庄员从事试验工作的我们的国家中，才可能有这样的新鲜事物。"解密的苏联历史档案表明，李森科与其说是一名科学工作者，不如说是一名拿学术做阶梯的投机家；他正好投斯大林所好，大喊"瓦维洛夫反对米丘林学说，是资本主义在苏联科学界的危险代理人"。
    1935年2月， 李森科应邀出席全苏集体农庄突击队员第二次代表大会。斯大林在会上讲富农破坏集体农庄的新手段；李森科在会上说："富农暗害分子不仅在你们的集体农庄生活中可以遇到。你们对他们在集体农庄的活动了解得很清楚。但是，对于科学来说，他们并非不危险，并非不凶狠。在和一些所谓的学者就'春化法'进行的各种各样的争论中，在创立这种方法的斗争中，没有少费心血，在实践中不得不经受不少的打击。同志们，难道在春化法战线上没有过，现在也不存在阶级斗争？"李森科在讲了一通"春化法战线上的阶级斗争"之后，进一步蛊惑性地煽动说："在集体农庄里有富农和富农的帮手，他们不止一次地对农民们搬弄是非……'不要浸泡种子。要是这样干，种子会毁掉的'。而当在学者中间人们不是去帮助集体农庄庄员，而是搞破坏活动时，也出现了这样的事，这样的搬弄是非，这样的富农式的胡说八道。阶级敌人永远是敌人，不管他是不是个学者。"讲到这里，斯大林插进来喊道："好极了，李森科同志。好极了！"带头鼓起掌来。于是整个大厅也响起暴风雨般的掌声。（注：马克·波波夫斯基著，闻一译《瓦维洛夫案件》第113-14页， 1993年3月东方出版社。）就这样， 瓦维洛夫和"春化法"之间从学术上的分歧，变成了"马克思主义和反马克思主义"、"革命和反革命"之间的斗争。那几年，从事农业、作物研究的大批科学家被作为"农业科学战线上的富农分子"逮捕，充作大饥荒的替罪羊。
    1940年8月6日，瓦维洛夫在外出考察的途中，被作为"反苏破坏活动的积极参加者和外国情报机构的间谍"逮捕。批准逮捕瓦维洛夫的文件是人民委员会主席莫洛托夫和内务部长贝利亚签发的。他们两人都清楚，所有的指控全是置瓦维洛夫于死地的多余的装饰性东西，关键是瓦维洛夫执拗地不承认李森科的"发现"；瓦维洛夫作为一名严肃的、真正的科学家，不肯俯首听命，不能容忍苏联的农业科学界让一名拉斯普廷式的人物来发号施令。瓦维洛夫的正直和倔强，触怒了斯大林，给斯大林的巴不得一夜之间获得成千上万吨粮食的幻想泼了冷水，这才是全部问题的实质。
    1941年7月9日，苏联最高法院军事法庭装模作样地审判瓦维洛夫，宣读早已准备好的判决书，宣布：瓦维洛夫早在1925年就是反苏组织"劳动农民党"的领导人之一，1930年起是农业人民委员部系统和苏联科研机构系统中右倾反苏组织的积极成员。瓦维洛夫为了破坏和消灭集体农庄制度，使苏联的社会主义农业陷于混乱和崩溃，为了追求反苏的目的，竟和逃亡国外的白俄小组保持联系，把苏联的国家机密情报转交给国外的间谍组织。瓦维洛夫被判处死刑，没收个人财产。
    接着，全苏的所有遗传学研究机构、作物栽培研究机构，统统被解散，全国的遗传学研究瘫痪了。相关的各研究机构的研究人员成批成批地被放逐，相关的著作被查封、禁止出版。
    此时，卫国战争已经爆发，幸存的科学家们不顾个人的一切，为挽救瓦维洛夫的生命而奔走；包括直接给斯大林写信，建议在监狱里让瓦维洛夫继续他的研究工作，这对苏联有用处。苏联科学院院士、卓有声望的农业化学家、社会主义劳动英雄称号和斯大林奖金获得者普里亚尼什尼科夫曾为此直接找过贝利亚。这一要求被贝利亚断然拒绝。事后，普里亚尼什尼科夫谈起为瓦维洛夫奔走而失败时说："贝利亚和那些想靠剥夺农业、让农民贫穷来积累资金的人是一伙的。瓦维洛夫妨碍了他们，所以他不能存在。而要反对这伙人，我们又无能为力。"
    1942年6月13日，瓦维洛夫被改判20年监禁。1943年1月26日，瓦维洛夫因被折磨死于萨拉托夫一号监狱。斯大林时期的马克思主义不仅不能指导和促进苏联遗传学、植物学的研究和发展，反而极大地摧残了这些学科的发展。
    到勃列日涅夫时代，马克思主义只是被用作某种包装。勃列日涅夫出兵占领捷克斯洛伐克和介入阿富汗战争，举着"马克思主义国际主义"的旗帜，实际上是占领别国领土，武装干涉别国内政，干的是霸权主义、侵略扩张的行径。教条主义和实用主义地对待马克思主义，是斯大林模式的一大特征，在总结苏联剧变的经验教训时，不能不直面这一现实。
    20世纪是人类社会飞速发展、变化的世纪。世纪之末，俄罗斯发生了再一场剧变，苏联历史档案解密，为研究剧变的苏联历史，为总结20世纪的文明发展史，开创21世纪的新文明构筑了新环境。