延至民国2年(1913年)正月，胸腹更隆然高起，日渐肿胀，经御医佟质夫、张午樵二人诊治，稍微渐轻。正月初十日，适逢她的“万寿节”(生日)，循例于御殿受贺，见民国大总统袁世凯的专使梁士诒，用着外国使臣觐见的礼节祝贺，不免悲从中来，且宗室王公大臣多半回避，不肯入贺，殿上不过寥寥数人，昔年权柄在握时的盛景全非。

因此，愁病交加，再加上“万寿节”内，天气晴暖，殿中所用素炉热气过高，感受炭气，致使病情加剧，从此，卧床不起。史书记载 “二月二十一日，隆裕太后已是弥留，到了夜间，回光返照，开眼瞧见宣统帝在侧，不觉呜咽道：“汝生帝王家，一事未喻，国已亡了，母又将死，汝尚茫然，奈何奈何?”说至此，喉间又哽咽起来，好一歇复发最后的凄声道：“我与汝要永诀了。沟渎道涂，听你自为，我不能照顾你了。”言讫，已不能言。

世续入省数次，但见隆裕后双目直视，口中很想说话，偏被痰塞住喉中，只用手指着宣统帝，眼眶间尚含泪莹莹，霎时间阴风惨栗，烛焰昏沉，有清末代的隆裕太后，竟两眼一翻，撒手归天去了。1913年2月22日晨2时，终日忧愁、积郁成疾的隆裕太后病逝，仅享年46岁。

民国二年正月十七日(1913年2月22日)，隆裕太后在西六宫之一的长春宫病逝，享年46岁。上谥曰孝定隆裕宽惠慎哲协天保圣景皇后，中华民国政府以国丧规格处理丧事，与光绪帝合葬崇陵(河北易县清西陵)。

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