于是盛怒和震惊之下的武帝不再犹豫，立即派刘屈牦率军去剿灭太子的“叛乱”。卫子夫和刘据到此时已是骑虎难下，只能跟刘彻动起刀兵。但是他们没有兵符，只能持节调兵，姜还是老的辣，武帝早已暗中派人通知了精兵胡骑。刘据又持节前往监北军调任安的军队，但是武帝已经抢先更改了节杖的规格，在原来的赤节上加上了黄旄任安也同样拒绝了刘据的要求。调动不了正规军，卫子夫和刘据只得释放狱中囚犯、发动市民出来作战。八天后，长据大败，只带着两个随同作战的儿子从复盎门逃亡。

获胜的武帝刘彻一面派人追捕儿子，一面派宗正刘长乐、执金吾刘敢前往未央宫，向皇后卫子夫宣布诏令，收缴她的皇后玺绶，等待制裁。卫子夫已经无儿无女，更了解丈夫的无情无义，她拒绝再受任何羞辱，自杀身亡。卫子夫的年龄史书没有详细的记载，估计她和刘彻的年纪相差不大，死的时候大约在60岁左右。

卫子夫死后不久，亡命于河南的刘据父子也在八月辛亥日死于追捕。刘据死后，被称为“戾”太子。

在卫子夫和刘据死后，卫氏家族尽数被诛，刘据的幕僚与眷属也全被杀光(只有一个数月大的婴儿刘询幸免于难流落民间)，平阳公主的孙儿平阳侯曹宗也没有幸免。而凡与卫氏沾亲带故有交情的侯爵、将领，包括不肯出兵帮助刘据的任安(他曾经也是卫青的部属)，都被抄家杀头，数以十万计的人死于非命。在这场大混战中为刘据出力的兵丁和市民则举族流放敦煌，这一路拖老带少的颠沛流离，死的人数只会比十万更多。(这次事件里唯一幸存的卫氏家族的一脉便是霍去病的家人，武帝刘彻对霍去病偏爱有加，因此饶恕了霍去病的家人)

太子刘据

自认为大功告成的苏文心花怒放，找来另一名宦官姚定汉作帮手，将卫子夫的尸首拖到小空房里，装进一具平民使用的小棺材，胡乱埋到长安城南桐柏地方。

第二次“巫蛊之祸”结束，这次“巫蛊之祸”的影响极大极坏，不仅皇后卫子夫和太子刘据被冤致死，而为刘彻，为刘家，为大汉王朝开疆扩土，稳定国家的卫氏家族尽数被诛灭，而受牵连者不下数十万，因此丧命者也不下于十万数，这给汉朝的统治带来了非常大的负面影响。汉朝也由此开始衰落。而一段帝王与女奴的传奇爱情故事就以这样的方式收场，真让人心里感到唏嘘不已。

第三次“巫蛊之祸”—卫氏家族的冤屈得到昭雪

公元前91年由于李广利想扶助妹妹李夫人所生昌邑王为太子，恰好匈奴进犯，刘彻就再次任命李广利为将军，出征匈奴，因此他把这件事情交给了刘屈牦，但刘屈牦不精计谋搞得太紧，不禁又动用起了巫蛊之术。而这样的消息居然都走漏了出去，被宦官郭穰得知并报告了武帝。

公元前90年武帝立案加以追查，而看守汉高祖刘邦陵墓的田千秋更在此后不久上书武帝，说自己梦见一个白发老者，坚持要他田某人上书皇帝，陈述戾太子刘据的冤屈。刘彻此时气头已过，恢复了冷静，开始对卫子夫和刘据之死满怀疑窦。在看到田千秋在奏章之后他的脑筋更深受触动，认为这梦中老者定然是自己的祖宗刘邦显灵。于是他任命田千秋为大鸿胪，开始调查卫子夫和刘据谋反的前因后果。一查之下刘彻目瞪口呆，发觉此事背后的内幕黑底，李广利，刘屈牦有脱不了的干系。

同年六月，刘屈牦被装进厨车游街，腰斩于东市，其妻也被斩首华阳街。田千秋被任命为丞相。

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