但是关于秦王子婴究竟是谁的儿子，历史上也并没有定论，但是史学家们基本认定子婴是秦始皇长子公子扶苏的儿子，所以称之为秦三世。因为在《史记》中有过这样的记载，“立二世兄之子公子婴为秦王”，历史学家把这句话翻译成现代汉语就是，立秦二世的哥哥的儿子子婴为秦王，也就是说子婴是公子扶苏的儿子。所以子婴就是秦始皇的孙子了。而且当时胡亥是私自篡改了秦始皇遗诏，所以原本可以做皇帝的是扶苏，这也就说明了为什么子婴能够第一个被选来立为秦王，因为如果子婴是扶苏的儿子，那么子婴被拥立为秦王这一切都是名正言顺的。
    之所以存在争议是因为还有另外一种说法，另外一种说法，说子婴是秦始皇的弟弟。在《李斯列传》中也有记载，说赵高看群臣都不同意自己的想法，所以就只能把秦始皇的弟弟子婴给叫来，给他传国玉玺，立他为皇帝。但是秦始皇的弟弟，名字叫成蟜，而并不是叫子婴，所以这个说法也就没能得到后世的普遍认可。其他也有两外的一些说法，也都只是后世的猜测和讨论罢了。
    所以我们基本上就能够达成一个共识，就是子婴是公子扶苏的儿子，也就是秦始皇的孙子。
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