１９３８年４月，晋冀鲁豫军区成立，把在太行山发展起来的数支游击武装划分成５个军分区，秦赖支队改称第一军分区，司令员、政委仍分别由秦基伟和赖际发担任。１９４０年８月，百团大战期间，第一军分区领导人有了变动，司令员秦基伟，政委高扬，副司令员胡震，副政委兼政治部主任郭峰，政治部副主任杨克冰。
     由秦基伟拉起来的这支武装队伍，番号几经变更，最后改称为“秦向支队”，即司令员是秦基伟，副司令员是向守志。１９４５年１０月，晋冀鲁豫军区决定组建晋冀鲁豫野战军第六纵队，“秦向支队”编为第六纵队序列，称“第十八旅”。到了１９４９年２月，十八旅改称中国人民解放军第十二军三十六师。
    他给邓小平一份检查，邓小平给了他一个处分
     抗日战争胜利后，秦基伟被任命为太行军区司令员。接着，解放战争开始，形势的发展有利于加快解放事业的步伐。１９４７年８月，晋冀鲁豫野战军第九纵队在河南省博爱县正式组建。纵队司令员由秦基伟担任，政委由黄镇担任，参谋长由何正文担任，政治部主任由谷景生担任。
     新建的九纵一直把自己当“小弟弟”看待，听从老大哥陈赓和谢富治率领的第四纵队指挥。用秦基伟的话来讲，“九纵成立的晚，是继三纵和六纵之后，在太行山诞生的太行人民的第三个儿子。虽然打了不少仗，但多为偏师，主攻的少，配合的多。在指挥关系上，也自觉退让，甘心接受四纵首长指挥”。
    九纵真正改变“小弟弟”角色，是在郑州战役中，一仗扬名，一跃成为主力部队。
     １９４８年下半年，辽沈战役、平津战役相继打响，捷报频传。９月２５日，中央军委批准华东野战军举行淮海战役的建议。刘伯承、邓小平指挥部队加强西线行动，配合华东野战军作战。１０月９日，刘邓决心集中第一、第三、第四、第九纵队相聚攻取南阳、郑州，策应华野在徐州战场上即将展开的淮海战役。
     郑州战役不是孤立的，可以说是淮海战役的序幕。当时，刘邓发给中央军委的电报中，就明确了攻打郑州的企图：“吸引孙元良全部回援甚至可能更吸住邱清泉兵团一部向西，以达到协助华野作战的主要目的。”
    当然，九纵在最初的部署中不是重要角色，依然是“小弟弟”跟在“老大哥”后面受“保护”。
     秦基伟自然也想得开，想得明白。攻坚也好，配合也罢，主要目的就是消灭敌人。但秦基伟判断，郑州守军有可能会逃跑。于是，他命令九纵做好阻逃打援的一切准备工作。
     果真不出所料，“老大哥”部队一纵、三纵、四纵逼近郑州时，守在郑州的国民党军第十二绥靖区第四十四军一○六师、第九十九军二六八师，见势不妙，弃城北逃。
    郑州守军的行动突变，打乱了作战部署。邓小平和陈毅都在四纵指挥所里。邓小平只好打电话给北面的秦基伟：“不能让它跑掉。”
    秦基伟回答：“政委放心，我的网已经形成，它跑不掉。”
    陈毅接过话筒：“秦基伟，这一回就看你的了。打得好，我到你那里给你唱《借东风》，打不好，是要打屁股的。”
     部队上下都知道秦基伟爱看戏，这是不争的事实。这不，连陈毅都知道这一点呢！秦基伟笑了：“陈司令员，你等着吧，打完郑州，我们还是进城听梆子吧！”
    陈毅说：“好。一言为定，你请客。”
    秦基伟谋事在先，率九纵在郑州以北的老鸦陈地区，歼灭逃跑的国民党军１。１万余人。１９４８年１０月２２日，郑州宣告解放。
    １０月２５日晚，陈毅到达郑州，说了一句“九纵成熟了，可以打大仗了”的话，让秦基伟高兴得当场表态要请客。
    陈毅说：“我们俩说话都是算话的嘛！”
    秦基伟说：“去看戏，《借东风》。”
    陈毅摆了摆手：“此一时彼一时，现在进城了，阔了，你给我找个大饭店。总不能让肚子饿了嘛！”
     就这样，秦基伟亲自开着吉普车——可见秦基伟的玩车水平——带着陈毅上街请客，满大街转悠，却找不到一家开业的大饭店。最后，他俩降低标准，在一家小饭店切了半斤牛肉，打了三两老白干。
     正当秦基伟和陈毅喝酒吃肉时，郑州警备司令部值班室电话铃骤响。值班参谋桑临春一听，电话那头是邓小平：“找你们秦司令员！”