25日上午，各组继续讨论。反映华北组讨论情况的全会第六号简报也发到各组。简报上写有这样的话：大家“认为林副主席的讲话，对这次九届二中全会具有极大的指导意义”。还说：大家听了陈伯达等发言后，“知道了我们党内竟有人妄图否认我们伟大领袖毛主席是当代最伟大的天才，表示了最大、最强烈的愤慨”。“这种人就是野心家、阴谋家，是极端的反动分子，是地地道道的反革命修正主义分子，是帝修反的走狗，是坏蛋，是反革命分子，应该揪出来示众，应该开除党籍，应该斗倒斗臭，应该千刀万剐，全党共诛之，全国共讨之。”一时间，会议的气氛骤然紧张起来。
     叶剑英意识到会议气氛的诡异、紧张，因此非常低调、冷静。他很注意从会议简报中观察会议的动向。据他的随从人员王守江回忆说：“有一次，叶帅说：‘你看看这几份简报。’我看了感到很意外。因为开这次全会，毛主席本来说主要是研究经济问题。但从简报上看，各小组发言的却都是大讲‘天才论’，‘国家应设主席’。这同主席召开这次会议的主题完全不一样。于是，我向叶帅汇报了我对简报中发言的看法。叶帅说：‘你也看出问题了。看来这股风还不小！以后要注意看简报！’”
     从8月26日到30日，全会各小组一直休会，休会这几天，毛泽东、周恩来不分昼夜地找人谈话或开小会，进一步了解情况。在这期间，毛泽东每天工作达十二三个小时，有时到凌晨两三点钟才返回住所。经过几天的调查研究，毛泽东心里已大体明白了。
     8月30日，毛泽东召见了叶剑英。王守江回忆说：“晚上10点多钟，周恩来总理打电话给我，问：‘叶帅睡了没有？’我告诉总理，他刚睡下。总理说：‘你把他叫起来，在家等着，我派车去接他。’我答应了。把叶帅叫起来后10多分钟，中央警卫局的两位同志就到了。总理为什么要派车接叶帅呢？因为这天晚上天阴，雾特别大，人与人相距一两米都看不清。庐山的路很狭窄，两旁又有水沟、大树，雾天行车很危险。”
     从叶剑英的住处到毛泽东所住的芦林一号，短短的两公里，开车却花了40分钟的时间。毛泽东看到叶剑英进来，站了起来，问他近来身体可好，湘潭习惯不习惯？叶剑英没有讲下放湘潭的种种苦衷，只是笑着说，去年11月他和曾山等一起从湘潭去韶山的事情。毛泽东开玩笑地说：“你一去再去韶山，不要把我搞成什么天才哦！”“不，您是我们的领袖和导师。”叶剑英发自肺腑地说。毛泽东认真地说：“还是那句话，群众是真正的英雄。林彪和陈伯达说我是天才，其实发现天才的人，才是天才。我多次说过不设国家主席，别人偏偏要设国家主席。这个国家主席，哪个想当就当，他们想设国家主席嘛，搞突然袭击。”叶剑英频频点头，表示坚决拥护毛泽东的意见。这次深夜召见，是毛泽东即将重新对叶剑英付以重任的一个信号。
     毛泽东在党的九届二中全会后采取的包括批陈整风运动在内的一系列措施，使林彪集团的权势遭到削弱，也打乱了他们的阵脚，使他们陷于被动的境地。林彪集团眼见形势对他们不利，决心铤而走险，策划武装政变。事情败露后，1971年9月13日，林彪夫妇和儿子林立果乘飞机北逃，在蒙古温都尔汗机毁人亡。9月24日，根据毛泽东的决定，叶剑英重新主持中央军委工作。