公元1307年3月，海山率3万精兵到达和林（今额尔德尼召南），5月至上都，废成宗皇后卜鲁罕之后并赐死。立其弟爱育黎拔力八达为“皇太子”。海山即位后，下令存恤征戍之士及供给繁重州郡的役卒，免除大都、上都和隆兴那里的三年差税；对云南、八番、田杨等地免除一年的差发；对逃移复业者给予免三年。并允许民间冶铁，以此恢复和发展生产。对受灾地区，作出停止征收山场湖泊税，听任贫民就地采取。勉励兴办学校，免除儒户的差役等措施。

为了巩固其统治，海山大量任用自己的亲信执掌要枢，将旧朝文武大臣一概更换，正是实施“一朝天子，一朝臣”之举措。他很想因循汉制，重儒尊道。他遣使阙里，以太牢之礼祭祀孔子，且加号“大成至圣文宣王”，对全国遵行儒教者予以优赦。由于他尊崇儒教，宫廷内外，习经成风。海山性格易喜易怒，故有时表现得宽大为怀，有时却酷暴残忍。他耽于享乐，奢侈挥霍，挥金如土，大赏诸王、宗族。又大兴土木，建筑中都城，致使财政困难重重。为摆脱财政危机，便开始发行“至大银钞”，导致至元钞大为贬值。不久又颁铜钱法诏谕天下，以铜钱和至大银钞并行，又滥发纸钞，如此做法，使财政赤字更为严重，物价上涨，百姓大受其害。

海山虽有众妃，但很晚才册立皇后。公元1310年（至大三年），封弘吉剌氏真哥为后；真哥的从妹速哥失里也被封为皇后。海山的妃子中，亦乞烈氏生了和世琼（后为明宗）；唐兀氏生了图帖眭尔（后为文宗）。三宝奴曾劝说武宗重新立自己儿子为太子，因右丞相康里脱脱的反对，才维持原状。

海山十分尊奉西僧，建造兴圣宫，常请僧侣人内祷佛祈福。他还派军士1500人及大量民工修建五台山佛寺，并令其弟爱育黎拔力八达（皇太子）主持在大都城南建佛寺。令喇嘛翻译佛经。他下诏凡是民众殴打西僧者截其手，骂西僧者断其舌，致使西僧胡作非为，蠹害百姓，成为当时一大祸害。海山又重用小人，南宋的一个小太监李邦宁，后成了元宫内太监，他阿谀奉承，竟被封为大司徒兼左丞相。

海山宠幸众妃，由于沉耽淫乐，酗酒过度，身染重病。公元1311年元旦，海山病倒，七天后庚辰日病死于大都宫中玉德殿，终年31岁，葬于先祖安息处起辇谷。5月，文武百官也先帖木儿等上尊谥为仁惠宣孝皇帝，庙号武宗，蒙古语称为曲律可汗。

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