由于中亚细亚的河中地区与中国新疆毗邻相望，地理环境相似，经济文化互补性较强，所以很早以前，乌孜别克人的祖先们就从中亚迁入中国新疆地区。
    14世纪时，金帐汗国与大元中央政府有大规模的商业往来。到了明朝(与北元)时期，双方的商业往来更趋繁荣，经常互派使者和官家商队。16世纪至17世纪，从布哈拉、撒马尔罕等地东来的中亚商人以中国新疆的叶尔羌为中转地，经营丝绸、茶叶、瓷器、皮张、大黄和各种土特产，有的还途经阿克苏、吐鲁番至肃州(今甘肃酒泉)，将货物转销中国内地。在这段时期，来自中亚的一些商人开始留居新疆一些城市。
    18世纪初，从中亚陆续迁入新疆定居的乌孜别克人日益增多，其居住地也由南疆扩展到了北疆。18世纪50年代，清政府在平定准噶尔统一新疆后，与以乌孜别克人为主的浩罕汗国、希瓦汗国、布哈拉汗国建立了外交关系，并且一直友好往来了六七十年。这一时期，社会相对稳定，社会生产得到一定的恢复和发展，从而也就从客观上为乌孜别克商人与中国新疆地区的贸易往来创造了有利条件。
    
        在经商过程中，乌孜别克人足迹所到之处，形成了大小不同的居留地。他们长年累月往返于同一路线上，自然而然地形成了许多落脚点，有些商人还由于偶然原因不能够返回遥远的故乡，便滞留该地，置产安家，娶当地女子为妻，成为当地的居民。当时，乌孜别克人较集中地居住在喀什、噶尔、叶尔羌、阿克苏以及北疆的乌鲁木齐、伊犁、塔城、奇台、木垒、英吉沙等地。19世纪中叶，乌孜别克人迁居新疆的除商人外，还有农牧民、手工业者、知识分子、宗教职业者和一些贫民。
    19世纪70年代后期，浩罕、希瓦、布哈拉等汗国先后并入俄国。乌孜别克商人的贸易活动也被纳入沙皇俄国对中国新疆的贸易活动中。
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