整个战争持续近9个月，依据战场转换及双方作战态势的变化，大致分为三个阶段。
    第一阶段，清军陆军自平壤败退鸭绿江，日海军夺得黄海制海权。
    8月上旬,总兵卫汝贵、马玉?、左宝贵和副都统丰升阿等四部援朝清军万余人先后抵达平壤。其时占据汉城之日军为混成第9旅，共8000余人。
    8月中旬,日本大本营根据海军主力决战时间难以预料，并以年内已无法实行直隶平原决战，乃修改其"作战大方针"第一期作战计划，除已派第5师余部赴朝外，又增遣第3师参战，两师合编为第1集团军。将陆军在朝鲜的牵制作战改为攻势作战,由第1集团军执行平壤之战,相机进攻奉天(今沈阳)的任务。同时,决定组建第2集团军，待机攻占辽东半岛，为尔后直隶平原决战建立前进基地。
    

    9月初，日军第5师和第3师一部由汉城等地出发,分四路向平壤推进，对平壤清军取包围之势。新近由成欢败退的提督叶志超奉命总统平壤各部清军，因其战守无策,各部心志不齐。9月15日，日军分三路总攻平壤，战斗至为激烈。午后，玄武门失守。入夜后，叶志超等弃城而逃，至26日全部退至鸭绿江以北中国境内。
    在陆军争夺朝鲜半岛的同时，日本海军联合舰队亦前出至黄海西部,甚至闯到威海卫和旅顺军港挑战,企图寻机与北洋舰队进行主力决战。北洋舰队在丰岛海战后拘于"保船制敌"之令，主要巡弋于威海、旅顺之间，将黄海制海权让给日本海军。9月上旬，清廷鉴于平壤将有大战，拟由海路迅速运兵赴援，北洋舰队奉命护航。9月17日，北洋舰队在完成护航任务后正准备由大东沟口外返航，突与搜索前进的日联合舰队遭遇，随即爆发了著名的黄海海战。战斗历时5个多小时，北洋舰队沉毁5舰，伤4舰，日本联合舰队伤5舰。
    日军在第一阶段作战中，适时调整作战计划，海陆同时出击。平壤之战不但击败在朝清军，且一举将战线推进至鸭绿江边，直接威胁中国本土。清军由于平壤迅速败退,不仅使"海守陆攻"的总计划归于失败,且来不及在鸭绿江一线组织坚固防线，以致在第二阶段作战中仍然陷于被动。在海战方面，北洋舰队实力被严重削弱，日本联合舰队达到了控制黄海制海权的目的，使尔后的战局能朝着其二期作战计划的第一案方向发展。
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