在刘师培看来，史家确立进化的历史观，还须打破两种传统观念：一是打破以帝王为中心的观念。"中国史书之叙事，详于君臣，而略于人民"，⑧即以封建帝王为中心；而事实上，君由民立，人民才是社会历史进化的主体。因之，著新史当反其道而行之，着重考察群体进化的大势。这主要有五："一历代政体之异同；二种族分合之始末；三制度改革之大纲；四社会进化之阶级，五学术进退之大势。"具体讲，当突出中国历史上的以下重要事件：黄帝、唐尧、商汤、周武即位；周民逐厉王；周避犬戎东迁；古哲学家孔子生；秦始皇即帝位；陈涉起革命军、晋避五胡南迁；隋文帝一统南北；沙陀夷李克用主中国，宋南迁；蒙古入主中原；满洲入关；洪秀全起义金田村；联军入北京。⑨与此相应，新史书还必须改变依王朝更迭铺陈史实的传统体例，改用"西人新历史的体裁，"⑩而以时代区先后，注重彰显历史进化的阶段性发展。在《中国历史大略》中，他从民族主义出发，将中国历史划分为以下四个时代：上古（三皇五帝至周），"汉族增势的时代"；中古（秦至唐），"汉族扩张的时代"；近古（梁至明），"汉族衰弱的时代"；近世（满清），"异族窃国时代"。（11）同时，刘师培还首倡以黄帝纪年。这固有与康有为立宪派的孔子纪年相颉顽，以利排满宣传的一面，但同时也是为了进一步打破人们的以帝王为中心的传统观念。所以他在《黄帝纪年说》中指出："中国政体达于专制极点，皆由于以天下为君主私有也。今纪年用黄帝，则君主年号徒属空文，当王者贵之说将不攻而自破矣"。（12）
    二是打破封建的正统观念。刘师培认为，旧史家一方面歌颂帝王、圣人，另一方面则极力贬抑农民起义的领袖，这里体现的封建正统观念，与进化的历史观格格不入。他特别指出，司马迁著《史记》，在做完《孔子世家》后，便做《陈涉世家》，人以为不伦，实则是为史家卓识。他说：政治与教育是群治进化的两大要素，"如若没有孔子，就不能集学术大成，这教育就不能完全了。如若没有陈涉，就不能起革命风潮，这政治就不能改革了。所以陈涉共孔子，是个一样看重的"。（13）孔子、陈涉所以都值得史家立传，是因为他们在不同的领域里，都为群体进化作出了重要贡献。所以他称陈涉为"中国革命家"，在做了《孔子传》后，更撰《陈涉传》。同样，刘师培以为洪秀全的业绩不逊于朱元璋，但史官"一则崇之如帝天，一则目之为潜窃"，（14）是一种可悲的历史偏见。他称颂洪秀全、扬秀清等太平天国领袖，都是民族"绝大的英雄"，在《攘书》中特辟《帝洪篇》。需要指出的是，刘师培对郑成功的评价尤具深意。其时《浙江湖》、《江苏》等革命派刊物多刊有郑成功传，颂扬其反清业绩，但刘师培以为这些文章都未能说清"郑成功的特色。"他将之归结为六点：一"保种的功业"，反清坚决而卓著功勋；二"辟地的功业"，从荷兰殖民者手中收复台湾。"中国到了现在，天天受白种的欺侮，没有一椿敢与他抗，仿佛白种的势力都非黄种所能及的。他那里晓得二百年前还有一个战胜白种的大英雄呢"；三"没有奴隶的性质"，他的奋斗是为民族的，"不是为一姓的"；四"实行家族的革命"，与降敌的父亲决裂，破家族观念，"为民族尽力"；五"晓得内政"，开发台湾；六"晓得外交"，联络日本。（15）这里刘师培高度评价郑成功以民族国家利益为重，收复、开发台湾的丰功伟绩，其识见不仅超越了封建正统观念，而且超越了狭隘的排满宣传，表现出近代民族民主主义更为开阔的视野。
    刘师培反对封建正统观念，在学术领域，便是反对儒学独尊，主张学术平等，即降孔子与诸子同列。他写的《孔学真论》一文，就是将孔子视为先秦九流之一，并指出其儒家学说自身的不足。
    由上可知，尽管囿于排满宣传，刘师培对中国历史进化大略的概括有失偏颇；但他强调新史家当摆脱循环论和封建传统观念，在进化的历史观指导下，重新研究中国历史和着意表彰为旧史家长期贬抑埋没的民族英雄人物，其视野、情感，即史学研究的价值取向，无疑已与旧史家判然相异。
    二、强调史学方法论的更新
    20世纪初年，随着社会学传入我国，近代西方以近化论为基础的资产阶级社会科学研究的一些理论和方法，也渐为士人所熟知。刘师培对西方社会学尤为关注，自谓"予于社会学研究最深"。（16）因之，他颇多心得，以为中国新史家应借鉴西学，在方法论上也要有所更新，这至少可以提出以下几方面：
    （一）加强史家的逻辑思维。刘师培认为西方社会学所以能成为藏往察来的"精微之学"，说到底，是得益于它有一套健全的逻辑思维方法："大抵集人世之现象，求事物之总归，以静观而得其真，由统计而徵其实。凡治化进退之由来，民体合离之端委，均执一以验百，播始以验终，使治其学者克推记古今变迁，穷会通之理，以证宇宙所同然。"（17）集诸多现象，由统计而徵其实，是为归纳法；执一以验百，则为演绎法。他指出，这两种逻辑思维的方法，中国古代原本有之。例如，荀子所谓的"大共"，道德家言"由经验而反玄虚"，讲的就是社会学的归纳法；荀子所谓的"大别"，阴阳家言"执一理以推万事"，讲得的就是社会学的演绎法。（18）但可惜，经久湮没无闻。旧史家所以侈陈往迹而不明进化之理，除了囿于循环论的历史观外，还在于"史官不明社会学之故也"，即不懂得逻辑思维的方法。所以刘师培主张，欲治新史，史家不能不加强自己的逻辑思维训练。例如，他在《拟编辑乡土志序例》中论及如何编"风俗志"时就曾指出："今编此志，宜搜集人世之现象，推记古今迁变，以验人群进化之迹。"（19）这里强调的便是归纳法的运用。