为了预备立宪，1906年，清廷对中央官制作了大规模的调整，史称“丙午改制”。经此厘定，中央文官行政体制设置如下：
    改巡警部为民政部；户部改称度支部（以财政处、税务处并入）；礼部照设（以太常寺、光禄寺、鸿胪寺并入）；兵部改为陆军部（以练兵处、太仆寺并入）；刑部改为法部；设邮传部（负责轮船、邮政、电线、铁路事务）；工部并入商部，改称农工商部；理藩院改为理藩部；外务部、吏部、学部均照设。这样中央行政有11个部，两院（大理院、都察院）。官员的设置，除外务部堂官和制度照旧外，其他各部堂官均设尚书一人，侍郎二人，丞、参各若干人，且明确规定不分满汉。
    此次厘定官制的特点，是集中于中央行政部门的调整，各部基本按西方近代行政的模式操作和划定权限，并反映了精简、效率的原则，这对于后来的文官体制改革有重要影响。
    1911年4月，清廷成立责任内阁，废军机处，内阁会奏官制， 中央文官制度再度调整，内容包括：
    第一，中央各部长官均改为大臣、副大臣（尚书改为大臣，左右侍郎改为副大臣），下设左右丞、参议、参事等官，历史上沿用已久的郎中、主事、员外郎等名称，至此取消。各部还根据需要实行分司办事制，内部职权划分较清晰。
    第二，裁吏部，改礼部为典礼院，改盐政处为盐政院，不久并入度支部，改军谘处为军谘府。
    第三，为保证皇帝的权威，牵制国会和内阁，增设弼德院为顾问机构，称该院“权限与内阁相为维系，所关重要，必须同时并设，用备顾问”，“上备顾问，参议国务，密翊君上帷幄之谋，隐匡政府措置之用”。[10]（P570）弼德院官员奏事不具正折，单片或面奏，而且所奏事情以特旨咨询为限，不登官报。弼德院设院长1人，副院长1人，顾问大臣32人，实际上并无独立权力。
    第四，海军部和军谘府。
    海军部的前身是海军处。在此之前，还设有海军衙门，由于甲午战争中清朝海军覆没而裁撤。1903年，清廷设练兵处，编练新军，以求统一军政。1906年，兵部改为陆军部，兼理海军事务。1907年陆军部内设海军处。海军处设正、副使各一员，下辖六司，实设三司。宣统三年（1911年），设海军部，海军处取消。海军部设大臣、副大臣各一人，下设参谋官、参事官、秘书官若干。
    军谘府的前身是军谘处。“丙午改制”时，即有成立军谘处的动议，但直到1907年才成立。宣统元年脱离陆军部独立，初具参谋部的规模。宣统三年，清廷成立责任内阁，军谘处正式更名为军谘府。军谘处初设正副使各一人，后设管理大臣二人，由五大臣中特简，总领全处，其下设有七厅，各厅置厅长、副厅长等官职。军谘处改军谘府后，原管理大臣改称军谘大臣，仍由五大臣中简派，反映了清廷控制军权的目的。
    2.关于内阁的改组
    清代的内阁是辅佐皇帝处理政务，备皇帝顾问的机构，位尊而权弱，与军机处无法比拟。丙午官制改革中，主持者曾计划将它与军机处合并，建设成为西方意义的责任内阁，但最终被慈禧否决。直到1908年，清政府颁布宪法大纲，决定九年后实行立宪，这意味着必须重组内阁。宣统继位后，迫于形势和内外舆论压力，在宣布召开国会前，先行组织内阁。1911年5月8日，朝廷任命国务大臣，内阁成立。其阁员组成：总理大臣为奕劻（皇族，兼管外务部），协理大臣那桐（满族）、徐世昌（汉族），各部大臣是外务梁敦彦（汉族）、民政善耆（皇族）、度支载泽（皇族）、学务唐景崇（汉族）、陆军荫昌（满族）、海军载洵（皇族）、司法绍昌（皇族）、农工商溥伦（皇族）、邮传盛宣怀（汉族）、理藩寿耆（皇族）。此即所谓的“皇族内阁”，遭到朝野上下的一致谴责和攻击。奕劻不得不奏辞，说：“诚不欲开皇族内阁之端，以负皇上者负天下臣民之望。”[11]（P597）1911年11月16日，在辛亥革命已爆发之际，清廷授袁世凯组织责任内阁，共任命正、副大臣20人。但该内阁仅存在了两个月，清朝便寿终正寝了。
    3.关于资政院和咨议局
    1906年9月1日，清廷在宣布仿行宪政的诏谕中说：“时处今日，惟有及时详晰甄核，仿行宪政，大权统于朝廷，庶政公诸舆论，以立国家万年有道之基。”[12]但同时又说“规制未备，民智未开”，无法遽行立宪，因而先成立资政院、咨议局以主持宪政预备工作，为将来立议院开国会奠定基础。