入光绪朝后，梅毓欲续纂江藩《汉学师承记》，其《商例》中曰：“此次续纂较江氏为难，江氏所处之时，讲汉学者实不乏人，今则同志寥寥，而书籍零落。非四方有好学之友襄助蒇事，敢信其无脱漏乎？”（注：梅毓：《续汉学师承记商例》，《国粹学报》第2期“撰录门”。）可见其时朴学式微之状。至光绪九年止，扬学中梅毓、刘寿曾、刘恭冕、成孺等相继而殁。扬学遂衰微不振。李详论个中原因曰：
    光绪以来，唯仪征刘氏，尚守矩知，其馀五县两州，未有奋自树立，毅然以前辈为师者，盖骛于功令文字，冀其速化。为书院院长者，率多巧宦隳官，据为窟穴。其无学术，不知提倡，谬种流传，递扇无已。禄利之途广，苟简之习成，凌夷衰微，遂有今日不绝如线之势。（注：李详：《药裹慵谈》卷3《论扬州学派》，《李审言文集》，第656-657页，江苏古籍出版社1989年版。）
    综上所述，扬学兴起于乾隆中叶，受吴、皖二派影响，至嘉庆间融会贯通，形成通学的特色。道咸而下为扬学守成时期，能维系朴学传统不坠。扬州学派式微与清代嘉道而下的政治、社会的全面衰败及由此导致的扬州地位的衰落有关。