然而到了1978年10月17日，靖国神社竟然以极其秘密的行动，把在东京审判中处以死刑的以东条英机为首的14名甲级战犯“合祀”进去。此事一经媒体披露，立即引起了国际舆论的愤慨。靖国神社辩解说：“不能让为国尽忠的昭和的殉难者们连安息的地方都找不到。”⑨这样一来，参拜靖国神社的行为就更加敏感了。
    1985年，日本首相中曾根康弘以“内阁总理大臣”身份参拜了靖国神社，中曾根强调这一行径是“慰灵”，他要求内阁们为此找出“正式参拜”符合宪法的理由。同年，日本首相等内阁政要又明确宣布“正式参拜”靖国神社。这些举动立即受到了来自包括中国在内的亚洲邻国乃至世界各国的强烈谴责。高桥认为，这是日本政府对于战后公开承认有罪的一个态度上的转变。“参拜靖国神社，即表示不承认发动战争以及战犯的罪恶。这牵涉到怎么认识历史和战争责任的问题。”
    在今天的日本，有一种较为普遍的看法，认为“甲级战犯合祀”问题是日本和中、韩两国之间的“外交问题”。由于日本政府歪曲历史的长期灌输，造成对于历史真实的“集体遗忘”，许多当今的日本人不能够理解包括中、韩在内的亚洲人民对于首相参拜靖国神社行径的强烈愤慨。高桥教授指出，这些看法是无视历史的错误认识。
    中国政府一直主张把日本的军国主义者和日本人民相区别，和被加害国人民一样，日本人民也同样是战争的受害者。“日本人对此也不乏认同”高桥说，“而且他们认为，那些被军国主义所动员的战犯也受害于他们的信仰。”
    在高桥教授看来，“事实上，中国政府因为‘甲级战犯的合祀’对日本首相参拜靖国神社的举动进行批判，是很有限度的。”因为靖国神社里还祭祀着1000多个乙级、丙级战犯，他们是侵略战争中的直接“杀戮者”，靖国神社称那些被处以死刑的人为“昭和殉难者”。乙级、丙级战犯和甲级战犯一样，都犯有“破坏和平罪”，同样都负有战争责任。
    高桥教授认为，提到战争责任，一个“更复杂”、“更广泛”、“更为重要的问题”，有待于进一步地追究，那就是作为日本天皇的战争责任。众所周知，天皇是日本人制造出来的日本国的象征，但日本国民更多地为其所利用。靖国神社是“天皇的神社”，专门祭祀“为天皇而战死者”。战后的东京审判中“甲级战犯”虽然受到了惩罚，但是，对他们的君主、从头至尾担任了帝国陆海军“大元帅”的昭和天皇却未予以任何起诉。对于这个历史的缺失，高桥教授认为，日本天皇没有被追究责任，但他作为国家元首和大元帅，对于战争负有不可推卸的责任。
    历史地看，靖国神社与近代日本国家进行的每一次战争都密不可分。认识靖国神社问题，必须追究靖国神社与日本近代殖民主义、军国主义之间的联系。高桥教授认为，今天，日本政要“把参拜靖国神社的问题正常化”，“并希望强制亚洲各国“习惯”、“接受”，“反映出了日本最高统治者对整个殖民战争、侵略战争的认识态度。”
    三、靖国神社与“国家神道”的勾结
    靖国神社在日本被看作是宗教设施，但它与一般的宗教设施不同，是作为“战争意识形态”的象征而存在的，参拜靖国神社宣彰为天皇牺牲的“靖国精神”，在日本社会生活与政治生活中的影响非同一般。
    当初，明治政府建立它的意图也是希望强化“神道”在日本至高无上的地位，将“日本神道”确立为“国家宗教”即“国家神道”。
    在日本的传统社会，早就存在着“佛教”和“基督教”等宗教团体。按照日本政府的理解，这些宗教都是“舶来品”，不能直接地更有力地用来为天皇为国家服务。因此，明治政府选中了信仰天皇和“日本神”的“土生土长”的“神道教”，并希望推崇它一跃而成为具有统治地位的“国家宗教”。这种想法在当时一经提出，即遭到了日本宗教界的强烈反对。
    “可以说，日本政府在当时是失败了”。高桥教授认为，但是明治政府对此并不甘心，它采取了更为狡猾的“两面安抚”的做法。并提出，“神道教”是以日本人为主旨的民族宗教。每一个日本人都必须崇拜天皇和“日本神”，有义务信仰“神道教”，因为日本民族是他们的子孙，而这也是日本民族不同于其他民族的独特之处。这样，所谓“国家神道”就被日本政府一手炮制出来。在“神道教”中，对于天皇的崇拜和效忠是尤其重要的，在这方面靖国神社发挥了巨大而重要的作用。
    二战结束后，美军提出解体代表军国主义的日本“国家神道”。几经周折，日本宪法将“政教分离”一条写入其中。日本宪法第20条明确规定，“任何宗教团体都不得从国家接受特权或行使政治上的权利”；“国家及其机关都不得进行宗教教育以及其它任何宗教活动”。通过这一原则规定，战前曾是官办神社的靖国神社，战后成了在东京都登记的一般宗教法人团体。政府不得参与有关靖国神社的任何宗教行为。
    “显而易见，首相参拜靖国神社是违反宪法的”，高桥教授指出，“但是日本很多人并没有认识到宪法的重要性”。他用战后以来的诸多事实说明问题的严重。
    20世纪60年代以后，日本政要多次参拜靖国神社，但日本媒体并没有及时地对其言论和行动进行公开报道。从60年代后期开始，自民党屡屡提出靖国神社保护议案，意欲把靖国神社再次明确提升为作为“国家宗教”的神社。当时由于日本共产党、公明党和其他宗教团体的强烈批判和反对，议案被搁置下来，但是自民党通过靖国神社煽动军国主义复活的企图却并没就此作罢。