2－3月间马步芳、韩起功勾结甘州地方民团，将西路军被俘人员中老弱病伤残或反抗者2000余人，先后惨杀活埋。同一时期，马步芳将河西解往西宁的红军被俘人员6000人中，除编入"补充团"者外，有2000余人被杀害。
    4月3日毛泽东、朱德等致电叶剑英，向顾祝同提出严令"二马"不得残害西路军被俘人员，对西路军余部不得再行追击。
    4月5日西路军工作委员会及所部在肃州以南祁连山中，致电中央，报告情况并建议中央实施营救。
    4月7日军委主席团指示西路军工委："你们可以向新疆去，已电彼方设法援接"。
    4月16日李卓然、李先念支队850余人，经过31天的艰苦行程，从安西东南走出祁连山到达石包城。到安西后稍作休整，即向星星峡行进。
    4月22日李卓然、李先念支队进至安西蘑菇台，受到万佛峡道士郭元亨的接济资助。
    4月24日李卓然、李先念支队攻打安西城，因敌情变化，攻城未克且战且退，又遭敌包围。
    4月26日李卓然、李先念支队突围向西，与追敌在白墩子激战后，继续西进。在红柳园又被敌包围，几经拼杀突围后直奔星星峡。
    4月27日李卓然、李先念支队经过47天艰苦跋涉，行程1500多里，所剩420余人终于进抵甘新交界地--星星峡，随后张荣支队的10多人也抵达星星峡。
    是月底周恩来通过回族爱国人士马德涵先生做国民党青海省前主席马麟的工作，让其以叔侄关系制止"二马"对被俘红军人员的杀害。
    5月1日中共中央代表陈云、滕代远到星星峡迎接慰问西路军指战员。
    5月4日李卓然、李先念支队休整几天后，从星星峡乘车赴迪化（今乌鲁木齐）。
    5月7日李卓然、李先念支队抵迪化后组成"新兵营"。
    是月中旬周恩来再派张文彬以中共党代表身份，到兰州探望慰问被关押西路军被俘人员，并同国民党甘肃省政府就遣返西路军人员问题进行交涉。
    是月下旬九军军长孙玉清在西宁英勇就义。
    6月初被关押在兰州的1300多名红军被俘人员，在押往西安途经平凉时，被援西军营救。
    6月上旬被俘后编入甘州敌营中的西路军人员刘德胜、邱均品、蔡文良秘密成立张掖地下党支部。开展对敌斗争。后与王定国、武杰等20多名同志取得了联系。
    7月在新疆的420余名西路军人员分编4个大队学习汽车、坦克驾驶及炮兵、无线电、航空、兽医等技术和文化知识。
    同月关押在甘州监狱的刘瑞龙、魏传统等8名西路军干部成立狱中秘密党支部，坚持斗争。
    8月1日谢觉哉、彭加伦等在兰州五泉山与民主爱国人士高金城会晤，磋商去河西营救被俘、失散的西路军人员问题。
    8月8日高金城以"甘肃省甘、凉、肃抗敌（日）后援会"主任的身份，到达张掖并重开福音堂医院，接收被俘红军伤病员住院治疗，开展营救工作。通过高金城大量积极工作，先后营救出200余名西路军失散、伤病人员回到党的怀抱。高金城的活动引起了敌人的注意和恐慌。1938年2月，高金城被敌韩起功秘密杀害。
    8月18日刘德胜从甘州到兰州，找到谢觉哉同志汇报情况。
    8月25日"国民革命军第八路军驻甘办事处"（简称兰"八办"）在兰州正式成立。中共中央代表谢觉哉根据中央指示，开展营救西路军人员的工作。
    9月22日西路军被俘干部刘瑞龙、魏传统、徐明山等10多人被党营救回到兰"八办"。
    9月25日"甘州中心县委"书记吴建初到兰"八办"，后回延安。
    是月1500名被俘红军战士被"二马"送往西安顶替青海省壮丁，途中由西安"八办"营救回延安。
    11月初由被俘红军组成的敌骑五师补充旅一个团1000多人，押送到西安后，被西安"八办"营救回到延安。
    11月23日西路军干部团政治处主任徐一新，经肃南当地牧民营救，到达兰"八办"后转赴延安。
    是月下旬"中共甘州中心县委"成员李天义与新发展的几名党员离开张掖到兰"八办"，后回延安。
    12月14日西路军的一批领导干部李卓然、李先念、程世才、李天焕、郭天明、曾传六等离开迪化去延安。其他人员除留少数继续学习外，大部分于1940年2月5日回到延安。