有关蒙古近代史的历史档案资料，除了以上介绍的几部档案汇编之外，还出版了《清末蒙古史地资料荟萃》（其中《三多库伦奏稿》为档案资料）、《清代青海蒙古族档案史料辑编》、《额济纳旧土扈特旗札萨克塔旺嘉布郡王文电集》（蒙文）、《日本帝国主义侵华档案资料选编》（1-14）、《黑龙江少数民族档案选编》等数种。另外中国近现代史、民国史、沙俄侵华史、日本侵华史以及一些地区史、专门史的资料汇编中，程度不同地收录、公布了相当多的有关蒙古近代史的档案，如《筹办夷务始末》、《清季外交史料》和《近代史资料》（总第88号）等等。
    历史档案是历史的重要记录，记载着纷纭复杂的社会历史现象，记载着各种典章制度和各种重要人物、各种社会团体的活动，以及各种政制兴革、内政外交、阶级斗争和生产斗争、物质建设和文化建设。档案史料在历史研究中具有无可争辩的权威性和可靠性。所以古今中外的历史学家都十分重视利用档案史料。但就目前状况而言，与蒙古近代史有关的档案资料在各个档案馆中收藏的数量很多，然而在蒙古近代史研究中这些档案的利用率却很低。这里面一个重要原因就是整理出版可供人们方便利用的档案史料较少，另外也有档案管理部门的各种限制以及科研人员缺乏相应的经费等原因。这就使得史料价值极高的大量历史档案不能发挥其应有的作用。综观蒙古近代历史档案，具有数量多、收藏地多、文种多、整理出版少的特点。蒙古近代史档案资料这种“三多一少”的现状，严重影响着该学科整体研究水平的提高。所以说，为了使蒙古近代史的研究进一步拓展和深入，档案管理部门和科研机构应通力合作，下大力量，采取不同形式，系统地收集、整理、出版历史档案资料是当务之急。