猪湾事件后，推翻卡斯特罗政权的军事失败并不意味着美国放弃推翻卡斯特罗政府的目标，肯尼迪从这件事中吸取的教训是重新考虑美国对古巴的政策[1]。肯尼迪总统渴望一个新的途径来破坏卡斯特罗控制古巴，防止古巴革命扩散到拉丁美洲。5月5日国家安全委员会的一份报告“古巴和在西半球的共产主义”，记录了美国在猪湾失败之后，对古巴政策框架及其政策的基本目标。美国对古巴的政策目标还是使卡斯特罗政权的灭亡。[2] 猪湾入侵后， 美国政策的主要目标仍然是将卡斯特罗从古巴驱除，主要手段是秘密行动和禁运、孤立和限制古巴革命。孤立部分是削弱和颠覆古巴政府，部分是限制古巴革命对其他国家的影响。[3] 为此美国不惜一切代价重新考虑推翻卡斯特罗政权的军事计划，1961年11月3日， 美国批准了“猫鼬计划（Operation Mongoose）”军事行动计划。
    一、“猫鼬计划”（Operation Mongoose）的提出
    猪湾入侵后，肯尼迪决定对古巴执行比较谨慎的政策，他认为这项政策的主要目的应该在于防止卡斯特罗的“共产主义颠覆活动”在西半球蔓延开来，为此肯尼迪政府一面继续对卡斯特罗政权施加压力，另一方面把他的希望都寄托于“猫鼬计划”军事行动上。他是1961年末到1962年导弹危机前，美国对古巴军事遏制的重要部分。尽管“冥王星”计划彻底失败，但“冥王星”计划与其非常相似，他们都是在秘密中进行的。两者都是基于极大的反对卡斯特罗在古巴的领导地位并利用美国的优势为目的，两者最终目的都是推翻卡斯特罗政权，两者不同之处是“冥王星”计划是军事行动，而“猫鼬计划”是袭击古巴政府、蓄意对其经济进行破坏，同时采取直接军事力量在古巴发起反卡斯特罗的运动。
    尽管猪湾登陆的惨败招致国内外不少人的批评，但是美国政府并未就此放弃对古巴的“秘密军事行动”。[4] 相反，这种图谋推翻卡斯特罗政权的努力加强了，早在猪湾登陆失败不久就开始了。1961年5月19日，中央情报局就向肯尼迪总统提出一份计划“推翻卡斯特罗政府的秘密行动计划”，这一计划的目的是要利用经济、政治和心理等方面攻击卡斯特罗政权，这一计划的任务是在军事上进行情报收集，对卡斯特罗政权进行蓄意破坏，支持当地的游击战等。[5] 6月13日，泰勒小组给总统的报告中提到如果美国要想挫败卡斯特罗的阴谋，美国就必须扩展情报行动。[6]肯尼迪为此建立了对外情报咨询委员会，并将所有秘密军事行动从中央情报局转移到国防部。
    1961年11月13肯尼迪批准了一项新的反对古巴的秘密行动计划“猫鼬计划”。这一计划包括：1.在古巴地区获得较高级的情报；2.通过其他政治、经济和隐秘的行动，在古巴引起叛乱，或发展成为需要美国提供武力干涉的行动；3.美国公开的政策保持一致，极力减少美国的经济损失和名誉地位的下降；4.继续进行中央情报局的行动计划和美国可能干涉的初步行动。这一计划的目标是要通过古巴流亡分子的“准军事行动”，对卡斯特罗等领导人的暗杀，在古巴国内从事其他破坏活动等达到最终推翻卡斯特罗政权的目的。为了实施这一计划，重新组建一个特别小组。（比NSC5412特别小组稍有扩大）其目的是监督秘密活动。肯尼迪任命泰勒将军为特别小组主席，罗伯特·肯尼迪是小组的主要活动力量，也是小组与总统之间的纽带。[7] 由于中央情报局所负责实施的“冥王星”计划使美国惨败，因此，这次是由美国国防部负责实施“猫鼬”计划。国防部的爱德华·兰斯德尔上校任总指挥，负责为该计划的执行提供必要的军事支持，并就执行情况向特别小组做不定期的汇报。
    1961年12月1日，总统召集国务院官员讨论“猫鼬”计划， 兰斯德尔报告说他已经考查所有这个项目的可获得的资源，并认为有相当大的积极的、有潜力、可获得资源，但有一个严重的问题，即在卡斯特罗政权之后未来的古巴达成一个协议的重要性，因此呼吁特别小组准备一个更有把握的长期计划。[8]
    1962年1月，兰斯德尔又提出在古巴建立一个政治行动组织有重要作用的建议。兰斯德尔注意到猪湾登陆失败后，削弱了在美国古巴抵抗运动的能力和目的、信心，他呼吁重新恢复那种信心。兰斯德尔设想，或是在古巴来自于人民内部的叛乱或者来自于领导组织的分裂，都可导致信心的加强，兰斯德尔认为这是一个主要的计划目标，他呼吁各机关包括国务院、政府、中央情报局等草拟计划，开始向这个目标活动（在古巴挑起暴动）。[9]
    2月20日，兰斯德尔发布了关于“猫鼬计划”的再次评估， 他说时间正在远离我们，古巴人民感到无助，而且正在失去希望，因此他建议把原来计划的时间表提前。要求最初的计划应主要在3月，领导游击行动是在8月-9月， 而公开的暴乱是在10月以后，他再次强调，如果条件和资金允许在古巴完成暴乱，如果美国被要求支持暴乱，美国将迅速地扩大军事力量推翻卡斯特罗政权。[10] 这是肯尼迪政府在整个“猫鼬”计划中面临的基本问题。
    二、“猫鼬计划”的实施
    第一阶段：1962年3月，开始了“猫鼬计划”的第一阶段实施。3月14日，肯尼迪总统批准了“猫鼬计划”行动指导方针，确定美国在随后的几个月内的优先目标将是在目标地区的情报的获得，此后再根据情报结果对形势进行评估，再做下一阶段的计划。[11] 美国设想在目标地区鼓励一次暴动，或是其他要求美国武装干涉的行动。尽管在指导方针上表明了这种态度，但总统一直没有决定美国是否使用军事力量推翻卡斯特罗政府。
    3月21日，情报委员会发表了一份情报评估（NIE85-62）“在古巴的形势和前途”。这个情报评估认为：部分地区有积极的抵抗运动，但古巴政府拥有镇压权利，他有能力对目前的抵抗活动进行抑制。古巴大多数人民既不支持政府也不抵制他。他们有抱怨和不满，但在外表是消极的。[12] 为实施“猫鼬计划”，中央情报局扩大了当初为执行“冥王星”计划而在迈阿密建立指挥中心，这个中心建立在迈阿密大学南校区一幢具有殖民地建筑风格的大楼内，对外被说成是一家电子仪器厂。他的年预算资金超过了5000万美金，拥有三千人以上的美国雇员，并掌握着几千名古巴流亡者。