1908年7月，清廷谕令达赖“来京陛见”，10月达赖至京，清廷加封他为“诚顺赞化西天大善自在佛”，年俸1万两白银。达赖希望获得不经过驻藏大臣直接向清廷上奏章的权利，他曾就此事征询柔克义的意见，柔克义认为达赖的请求完全正确，怂勇他向清廷提出，清廷却拒绝达赖这一请求，谕令达赖回藏后，“所有事务，依例报明驻藏大臣随时转奏，恭候定夺”。使达赖深感失望，更加坚定了他投靠英国的决心，在京期间，他不断派人去英国驻华使馆联系，表示今后愿同印度建立最友好的关系，请求英国驻华公使朱尔典转达他对英王陛下的敬意，朱尔典也往达赖寓所拜会达赖。10月22日，英外交大臣格雷指示朱尔典“通知中国人……我们无意在达赖喇嘛返回西藏方面设置障碍”，表明英国对达赖集团的政策已有根本转变。陪同锡金王储来北京旅游的前英国驻江孜商务专员欧康诺，同达赖接触频繁，他向达赖集团保证“英国政府并未对达赖喇嘛怀有恶意，如他回至拉萨，英国准备同他建立友好关系。”达赖除同英、美、俄驻华使节紧密勾结外，还派人同法国驻华外交官联络，他宣称将准许传教士进藏传教，愿派宗教使团去印度支那访问佛教寺庙，委托法国架设打箭炉与拉萨之间的电报线，向法国献媚讨好，谋求支持。清廷对达赖的分裂主义野心已有所觉察，表面优礼有加，暗中防范甚严，意图将他的权力限制在宗教领域。清统治者与达赖矛盾重重，貌合神离，加以英国等西方帝国主义国家从旁煽惑，推波助澜，两者最终决裂只是时间问题，据柔克义说达赖是怀着对中国政府“强烈不满的心情离开北京的”。
     1909年，清廷谕令四川知府钟颖率两千新军进藏，企图依靠武力，加速在西藏推行各项新政，进一步激化了清廷与达赖集团的矛盾，达赖在返藏途中命令其心腹夏扎·边觉夺吉等人组织藏军抗拒川军入藏。1909年12月，达赖一行回至拉萨，继续派藏军赶往昌都，阻止川军进藏，断绝对驻藏大臣的一切供应，派使者进京面见日、法、俄、英驻华公使，请求给予军事或外交支持。川军冲破重重阻挠，进入藏境，1910年2月12日，前锋进抵拉萨，达赖一伙于当晚逃离拉萨，流亡印度，吁请英国帮助他“反抗中国人”。2月25日，清廷谕令革除达赖名号。英国驻华代办穆纳（MüLLer）奉命向清廷递交抗议照会，威胁说英国对西藏境内的和平遭到破坏，“不能漠不关心”。3月5日，穆纳再次就川军入藏与清廷罢黜达赖问题向外务部交涉，公开干涉中国内政。英国原以为川军进藏，达赖叛逃，定会在西藏境内引起支持达赖集团的大规模叛乱，英印政府已派兵进驻哲藏边境，准备侵入西藏。孰料西藏政局较为平静，清廷在西藏的统治日益巩固。英国考虑到贸然进行武装干涉，必将激起全中国人民反抗，损害英国在华政治与经济利益。此外，根据1907年《英俄协约》，英、俄双方均承担了不干涉西藏内政的义务，英国对派军进藏不能不有所顾虑，鉴于武装干涉时机远未成熟，1910年5月，英国政府通知达赖，英国“不能干涉他和中国政府之间的事务，”达赖转而乞求沙俄援助，亦无结果，只得仍在英国卵翼下等待时机。
    三
     1911年，四川保路风潮扩大，10月武昌起义爆发，革命烽火迅速蔓延西藏，驻藏川军中的哥老会发动士兵起义，囚禁驻藏大臣联豫，原川军统领钟颖利用其在军队中的影响，杀害起义领导人，释放联豫，窃取藏中军政大权，驻拉萨川军同色拉寺与甘丹寺发生武装冲突，西藏政局混乱，四川亦不安宁，英国驻华使馆向英国政府报告说：“赵尔丰已在四川首府成都被公开处决……四川省一向负责处理西藏事务，但在1912年初该省人民已四分五裂，5个军政府在四川各地行使管理权，四川内部行政机构与税收体系已经瓦解，以致该省既不能提供钱财也不能出动兵员保持至拉萨的道路畅通，看来1800名驻藏川军很可能被切断归路，全被屠杀，藏人将成功地摆脱其宗主国的统治，有效地重建他们的自治权力机构。”英国政府认为中国内部战乱不已，中央政府权力空前削弱，不可能出军支援边疆地区；沙俄正向蒙古伸出魔爪，导演外蒙“独立”丑剧，一时还无力顾及西藏，正可乘机将西藏从中国分裂出去。1912年2月，英国印度事务部拟定了新形势下英国侵藏的指导方针，内容有如下三点：
     “1.中国在西藏有宗主权，而无主权，也即他们可派驻藏大臣驻拉萨，但不能干涉西藏内政。2.除驻藏大臣拥有纯属礼仪性的小型卫队外，中国军队不得驻在西藏。3.除驻藏大臣及其属员外，中国文职官员不得驻在西藏。”从上述内容看，中国对西藏的主权被完全剥夺。英国外交部在一份备忘录中对英国侵藏方针作了进一步的解释：“西藏名义上仍保持中国拥有宗主权的自治国地位，实际上，应使其处于完全从属于印度政府的地位”，也即最终使西藏沦为英属印度的一个邦。基于这一侵略方针，英国侵略者向达赖暗示“中国暂不敢进兵”，鼓动他们回藏“收复主权”。在英国唆使下，达赖派其心腹达桑占东回藏，组织藏军，发动叛乱。6月，达赖一伙从噶伦堡动身返藏领导所谓“独立运动”，命令叛军向拉萨等地发动总攻，并向川边进犯，相继攻陷理塘、江卡、贡觉等地，进而围攻巴塘和昌都。英国怂恿达赖集团分裂中国西藏的活动，激起全国各族人民愤慨。云南都督蔡锷认为“藏卫西藩，关系大局，一有破裂，则滇、川有覆亡之虞”，四川都督尹昌衡更进一步指出：“藏亡则边地不守，边失则全国皆危”，一致要求袁世凯政府出军平叛。袁政府在社会舆论压力下，命令尹昌衡进军西藏，蔡锷派军支援。尹昌衡指挥川军，在川边击败西藏叛军，解除西藏叛军对巴塘和昌都的围攻，收复理塘、贡觉与江卡等地，滇军亦攻克盐井，使达赖集团的分裂主义活动遭致沉重打击，英国向川边扩张侵略势力的阴谋彻底破产，充分显示出中国人民维护祖国统一的坚强意志和决心。尹昌衡在组织和领导川边战役的胜利中功绩卓著，应予肯定。