清末的农业改革虽然使中国农业开始了向近代的转变，但从当时情况看，由于时间、精力、财力等方面的原因，这种转变才刚刚起步，还没有能够取得实质性的进展。以财力而言，大规模的农业改革需要巨额的资金，但清政府的财政状况却是捉襟见肘。1901年财政赤字3000余万两，与财政危机同时出现的是财改支出日益加大，各项改革都需要财改拨款。据1911年预算，清政府岁入29696万两，岁出38135万两，赤字8439余万两。就各省财政状况看，也大多支大于收。1907年浙江岁入包括所借外债436万两，支出449万两。山东每年亏空150余万两。奉天、吉林、黑龙江入不敷出也十分严重。1909年奉天岁入580万两，岁出940万两。吉林岁入180余万两，岁出450万两。黑龙江岁入90万两，岁出200万两。支大于收在百万两以上的有贵州、江苏、安徽、福建、广西、湖南、云南、江西、湖北、四川（注：彭雨新：《辛亥革命前清王朝财政的崩溃》，《辛亥革命论文集》。）。几乎所有的省份都受到财政窘迫的困扰，严重的财政赤字使“几乎没有一个地方官在论及财政问题时不用‘支绌’二字的”（注：张玉法：《中国现代化的区域研究》山东省，第346页。）。这就严重影响了农业改革的顺利展开。
    在财政状况不断恶化的同时，清政府对农业改革虽相当重视，但维护其统治的本能又使其将主要精力放在军事改革上。据1911年预算，清政府军事改革的费用占财政开支的一半以上。军事改革的庞大支出，相应地亦减少了对其它项目的投资，从而使农业的发展受到制约。
    此外，农业改革是一项庞大工程，不可能在短期内完成，清末新政仅存在短短的十年时间，随着辛亥革命的爆发和清政府的垮台，清末新政随之终结，因而难以取得突破性进展。
    但是，不论怎样，清末农业改革的发生表明它已将改革的触角伸向最基本也是丞需改革的行业上，它开启了中国农业近代化的历程。清末农业改革的构思与做法，对我们今天的农业改革仍不无鉴意义。