至于清军与准部作战，仅仅是准部突袭，清军严密防卫，略予反击，使准部不得逞而已。准部来袭三次，八月十五日在博克河（一作卜克河）、八月二十日在齐暖郭尔（绰诺果尔）、八月二十二日在楚玛拉（绰马喇），三地都在西藏北部黑河地区内。据延信上报，对方死亡二百余人。（注：《允禵奏稿》卷11，第5-17页，康熙五十九年十月十二日奏引延信禀文。）三次袭击都是策凌敦多卜指挥，因胁从之藏军不肯卖命，后方拉萨已于八月二十三日落入南路清军之手，接应断绝，策凌敦多卜遣散藏军后西遁。
    因为众多军队及马匹一时涌入西藏农业区，使西藏人民负担太重，所以延信留下相当多的军队在藏北达木水草地放牧，仅用1600人护送达赖喇嘛灵童向拉萨前进。（注：《允禵奏稿》卷11，第5-17页，康熙五十九年十月十二日奏引延信禀文。）终于九月十四日（1720年10月15日）到达拉萨，（注：《允禵奏稿》卷11，第17-21页，康熙五十九年十一月初四日折。）已晚于南路军入拉萨21天，全部行程约四个半月。
    南路军的统帅是满洲镶红旗噶尔弼。（注：《清国史》（中华书局影印嘉业堂钞本1993年版）大臣画一传档正编，卷105《噶尔弼传》， 有噶尔弼入藏前的履历。 ）在朝廷决定遣军西征时， 康熙五十八年（1719），他以护军统领的官职，在从北路军去西宁的中途调至四川辅佐四川总督年羹尧治理军事。他与年羹尧相处约一年间，甚受年的称赞。（注：年羹尧在上奏中称赞噶尔弼云：“熟于军旅，不避烦劳，每月教练在省满兵，肃然改观，非复昔比，且言动合礼，宽严互用，不志温饱，足以服众，使统兵进剿，臣以身家保其前往。”见《康熙朝汉文朱批奏折汇编》第八册，第2845件，康熙五十九年正月二十六日年羹尧奏；第2853件，同年三月初三日年羹尧奏。）
    关于南路军入拉萨经过，现存记载仅有噶尔弼的《平定西藏疏》、《平定西藏碑记》。（注：《卫藏通志》卷13上，碑文又见《西藏碑文》，较《卫藏通志》多出立碑者四人即噶尔弼、伍格、赵坤、岳钟琪官衔姓名，又云碑文乃噶尔弼所撰并书。）此后在嘉庆年间修的《四川通志·岳钟琪传》、由岳钟琪的曾孙重刻的《岳襄勤公行略》（注：嘉庆《四川通志》卷195，《岳襄勤公行略》，见《清史资料》第4辑，中华书局1983年版。）则专门记述了当时在噶尔弼麾下任副将职的岳钟琪在进藏途上的功绩。两种材料互相对照，当可了解一些事实。
    前文说过，在康熙五十九年二月，清正式封在西宁的灵童为“第六世达赖喇嘛”时，北路大军方组织就序，而南路川军已经在年羹尧的策划下，西进抵达里塘、巴塘并招抚了乍丫、昌都、察哇等处。约在同年四月，噶尔弼交给岳钟琪兵四千名驻守昌都。在行军途上侦知准部将要调遣藏兵据守嘉裕桥（昌都西南），岳钟琪乘对方兵力未集，先发制人，四月九日抵洛隆宗，擒获准部差来的寨桑等，（注：据《岳襄勤公行略》。参照《抚远大将军允禵奏稿》卷9， 康熙五十九年七月初十日查询出藏员情形折（此折汉译误作耀钟琪），北线也得到有关洛隆宗等消息，可以证实。）于是迤西的硕般多、打笼宗以及今比如境内的藏族头人纷纷来投，岳钟琪在六月中与继来的噶尔弼的主力会合，七月收拉里（今嘉黎）。以上是岳钟琪一方的记述。
    据噶尔弼一方所言，噶尔弼在四月十六日（1720年5月22 日）自成都启程，经过理塘、巴塘，在昌都与自云南北上的入藏部队会师，来到拉里。他在奏疏中说：“暂且在拉里地方喂养马匹驻扎，与平逆将军（延信）约会，再行进取昭地（拉萨）”。当时北南两路军队曾经约定在七月底、八月初到拉萨。（注：《允禵奏稿》卷8， 康熙五十九年六月二十二日大军已行抵木鲁乌苏折，六月二十九日分催各路兵马迅速前进折。）看来，噶尔弼在拉里住了一段时间，其间他接到从青海来的抚远大将军允禵的指令，意谓青海蒙古诸部未能如期与延信率领的部下会合，所以北路大军尚未进发，叫他即在拉里停顿，当另订会师入拉萨的日期。噶尔弼在拉里侦得敌方的动静，据说准部将领吹木丕勒（一译车木伯尔）宰桑带领准兵六百名、藏兵二千名扼拉萨河一支流，坚守墨竹工卡，准备前来应战。（注：噶尔弼：《平定西藏疏》。）另据北路大军八月中打听到的消息却是吹木丕勒和他的准部部下被调回来支援北方。（注：《允禵奏稿》卷10，康熙五十九年八月二十九日移队前进诛杀获俘得悉贼情折中俘虏济木巴的供词。）如此，南方仅剩下藏兵了。可是一部分藏兵的指挥者噶伦阿尔布巴，佯称身故，从拉萨潜逃北上，六月六日到抚远大将军兵营投诚，随从者七十人，其中即有硕般多、洛隆宗各地派来的使者四名。（注：《允禵奏稿》卷10，康熙五十九年六月初七日第巴阿尔布巴由藏投诚详情折，又六月初九日第巴阿尔布巴呈递硕般多等处首领来禀译出奏闻折。七十人数字见李彩《藏纪概》。又参见《康熙朝满文朱批奏折全译》第3515页。）这样，为了抵抗南路清军而从西藏东部征调来的藏兵，缺少了指挥者，地方首领动摇涣散，噶尔弼面临的是毫无战斗意愿的藏人。
    然而，噶尔弼在七月中并没有完全了解对方的虚实，据岳氏行状和传记，岳钟琪私下向噶尔弼建议，军队久久停顿，恐损斗志，工布地区藏兵较能战斗，先派人去招抚，可能转向清方。噶尔弼乃遣千总赵儒、藏族头人吉果儿（一作济果尔）持檄前往，不到十天，工布头目三人、兵二千余名即诣营归附（工布地区是阿尔布巴的属地和故乡，阿尔布巴自记此事云塔布工布军二千五百名及阿尔布巴之子随噶尔弼军入拉萨。（注：参见陈金钟：《阿尔布巴阐述平定准噶尔之战》，《中国藏学》1989年第4期。）岳钟琪又劝噶尔弼说，从昌都西进的军队， 须轻装才能取胜，依规定只准携带两个月量的粮秣，现在已经过去了四十多天，余粮仅支半月，若等待与北路大军会齐，一旦粮尽，进退失据，极为不利；若乘胜昼夜兼行，十天工夫可抵拉萨。噶尔弼仍然顾虑重重，打算召集麾下将官会议，岳钟琪说，事在必行，不用议论，明日即可出发，并愿以身殉此役，噶尔弼才下了决心。总之，噶尔弼是违令西进的。