莫雷洛斯懂得，当百分之九十以上的起义者只有长矛、投石器、弓箭、砍刀等武器的时候，是不能与装备精良，训练有素的殖民军进行大规模阵地战的；因而他一方面主张采取游击战和运动战，另一方面积极采取措施，加强起义队伍的组织性，纪律性和军事技术的训练，并认真改善装备，征集骑兵。
    由于莫雷洛斯采取了正确的战略战术，革命军队迅速壮大起来，而且不断取得军事胜利。1811年2月，莫雷洛斯曾决定围攻阿卡普尔科港， 但是当地发现西班牙殖民军可以从海上不断取得增援时，他便毅然改变计划，不进行强攻，而挥师转入内地，攻击敌人的薄弱环节，直指奇尔潘辛戈，一路上歼灭了分散的西班牙殖民军，壮大了自己的力量。他运用游击战术，在墨西哥南部到处袭击西班牙殖民军的据点，切断交通，夺取军火和殖民者的银车。革命军以农村和山区为基地，当西班牙殖民军的主力军团来到时，他们很快改变成农牧民，而当殖民军一旦分散，霎那之间平地又出现反西班牙殖民者的大军。革命军用这种神出鬼没的游击战术，使殖民军深陷于被动挨打的境地。
    1812年初，殖民军将领卡雷哈统率主力五千人向南部革命军进行疯狂反扑，攻占并焚毁了墨西哥最高民族委员会所在地锡塔夸罗城，并宣布剥夺该地区印第安农民的财产权利，最高民族委员会被迫迁至苏尔特佩克。
    面对敌人的大规模进攻，莫雷洛斯不与殖民军主力正面相撞，采取迂回战术和运动战。当卡雷哈侵占锡塔夸罗时，莫雷洛斯率革命军主力向殖民统治的中心墨西哥城推进，革命军骑兵队直插墨西哥城近郊，切断墨西哥城的粮食供应和对外交通，断绝墨西哥城与周围的联系。殖民当局大为恐慌。1812年2月， 卡雷哈慌忙从锡塔夸罗回师墨西哥城，妄图抓住革命军主力，一举消灭之。但是，莫雷洛斯机灵地避开了殖民军的正面冲击，于3月上旬伏兵于库阿鸟特拉等待时机。 莫雷洛斯利用库阿乌特拉形势险要，城防坚固，时近雨季等有利因素，固守城堡来消耗敌人。4 月末，革命军从库阿乌特拉城突围，转向奇尔潘辛戈。同年秋，墨西哥土生白人地主、知识分子和市民在西班牙1812年宪法的影响下，掀起争取自由平等权利的高潮，莫雷洛斯应势而起，迅速集结革命军，回师库阿乌特拉城，打败了卡雷哈，重新解放了这座重要城堡。对于莫雷洛斯在库阿乌特拉城战役中的军事才能，拿破仑也为之惊叹。他说：“我要是有五个莫雷洛斯，就可以征服全世界”⑤。
    随后，革命军乘胜前进，解放了特华坎，并在此设置革命军总部。1812年11月25日，又解放了南部重镇瓦哈卡；1813年4月12日， 重要海港阿卡普尔科也获得解放。这样，从西海岸的科利马到东海岸坦皮科以南的广大地区，除墨西哥城和几个州府（省城）外，都已处于莫雷洛斯革命军控制之下了。
    莫雷洛斯还善于把当时分散的反西班牙的爱国武装力量，联合协调为有统一领导、统一指挥和共同政治目标的革命军。在希达尔戈牺牲以后，独立战争实际上失去了统一的领导中心。当时出现了许多大小不等、各行其是的反西班牙武装力量，它们彼此之间很少联系，有时内部还争权夺利，胜败无常。莫雷洛斯耐心地团结一切反西班牙的武装力量，他与出身农民的混血种人盖雷罗、乡村神甫马里阿诺·马塔莫罗斯、小农伽里亚诺、地主出身的布拉沃兄弟所领导的反西班牙革命军，协调一致，统一指挥，共同作战。1812年11月，在瓦哈卡地区作战时，当地的萨波蒂克人和其他印第安部族都积极援助莫雷洛斯革命军。为了团结一切反西班牙殖民者的力量，莫雷洛斯尽力防止印第安农民与土生白人地主之间的冲突。1811年10月13日，他在告民众书中指出：“既然我们不压迫富人本身，包括有钱的土生白人在内，任何人就不得因为他们很有钱而蓄意侵犯他们的财产。”⑦与此同时，他又规定，凡经最高革命领导机关或他本人批准，可以没收西班牙人和土生白人地主中反革命者的财产⑧。
    莫雷洛斯忠诚于革命，而且为人谦和。一位历史学家如此描述他：“作为一个将军来说，莫雷洛斯的外表还象当学生时那样貌不惊人。一套军装显得又肥又大，而且往往不干不净，就好象他是穿着这套制服睡觉似的。他不戴帽子，头上包着一条白头巾，但是他身体结实，精力充沛，有自我牺牲精神，从而赢得了部下的衷心爱戴。”⑨忠诚革命的品德和严肃认真的办事作风，使他不仅赢得联合一切革命力量的威望，而且逐渐组成了革命力量的军事政治中心。1813年9月14日，根据莫雷洛斯的倡议，在奇尔潘辛戈召开了墨西哥独立战争参加者代表会议，与会代表来自全国各州，这实际上是一次临时国会。会议推举莫雷洛斯为革命军统帅，授予他行政首脑的职权，并组成了以他为首的临时革命政府。因此，奇尔潘辛戈大会的召开，标志着墨西哥独立战争已经取得重大胜利，西班牙殖民统治正在全面瓦解，新的独立的墨西哥国家正在孕育诞生之中；莫雷洛斯开创的游击战和运动战的军事战略，为墨西哥独立战争的最后胜利奠定了基础。
    二、独立共和国的奠基者
    莫雷洛斯在政治上继承和发扬了希达尔戈所提出的“多洛雷斯呼声”中民族民主革命的精华，坚持主权直接来自人民，为墨西哥的独立和共和制度奠定了基础。莫雷洛斯主张建立墨西哥民族独立的主权国家，他指出：“要知道每个民族是自由的，有权建立对它合适的政权形式，不做另一个民族的奴隶”⑩。1813年9月，莫雷洛斯向奇尔潘辛戈大会提交的题为《民族意识》的纲领性文件中，完整地体现了他的民族革命思想。文件共二十三条，其中第一条实际上是总纲。这一条指出：“美洲是自由、独立的美洲，她不隶属于西班牙和其他任何民族、政府或王朝”（11）。这是当时墨西哥社会主要矛盾的反映，它符合时代的趋向。文件中提到，“只有美洲人才能获得（公职）工作”，“除有能力传授技艺而没有任何嫌疑的手工业者外，其他外国人概不接纳”。“我们的港口对友好国家开放；但无论如何友好，亦不准进入内地。除指定港口外，禁止外国人在其他任何口岸登陆，外国人在指定港口经商须缴纳10％的关税，以及其他商品税”。这都体现了民族国家主权的要求。文件第二十条还谨慎地规定，“外国军队或其它（西班牙美洲地区）国家军队不得踏入我国领土；即使是前来援助我们的，也不得进入最高洪达所在地，”以免外国军队干预本国的内政和主权。与此同时，文件也对墨西哥规定，“不对国家边界以外，尤其是不对海外进行远征”。（12）莫雷洛斯关于民族革命和主权在民的思想，反映了被压迫民族要求完全独立的愿望。1813年11月6日， 奇尔潘辛戈会议根据莫雷洛斯的思想所通过的独立宣言指出，新西班牙不再受西班牙的统治，她有权独立地决定自己的命运和同外国缔结条约；号召人民为建立主权国家，复兴社会经济而斗争，要求每个城市动员半数能够拿起武器的男子为独立而战。