1939年，苏军乘德军入侵波兰之机，将从1920年起属于波兰的乌克兰和白俄罗斯西部兼并过来，1940年，兼并了波罗的海三国，以及比萨拉比亚，建立起所谓的“东方战线”，苏联西部国界向西推移了150-400公里，使得原先驻扎西部的苏军大部分重新部署，重新部署打乱了当西部发生战争时，苏军已有的动员和展开计划，到战前未能及时制定新的完整计划，直接影响到苏军的战斗准备和战斗力。
    苏军重新部署在新兼并地区，战略展开时在这里得不到必要的人力和物力补充，不得不靠遥远的苏联后方提供。新兼并地区的道路、机场和运输能力不足，尤其是铁路不发达，部队集结需要20-30天才能完成，而德军可在10-15天完成此举，这里现有机场数只能部署西部地区苏军空军飞机的一半，因此很多机场要部署两个飞行团（每团120架以上飞机），正常情况下这样一个团需要2-3个机场[11]这种情况直接影响飞机训练和起飞，导致战争伊始德军空军将部署在这里苏军飞机的绝大多数击毁在地面上。
    在新兼并地区苏军部署了二百万军队，这里物质条件无力满足这么多人的正常生活和训练，军队不得不为正常生活和训练所需要的一切绞尽脑汁，结果战前一年半时间里军队每天训练不超过2-4小时。[12]军队所需的弹药、燃料，甚至纸张都严重缺乏。连队训练的时间表竟要写在报纸或纸制枪靶的背面。战前，统帅部预备队中的空军、坦克、反坦克部队以及内务部队的训练更差，如苏军飞行员放飞时间为30-180小时，而德军飞行员则为450小时，差距十分明显。[13]
    德军野战部队军龄最短的士兵是1940年秋应征入伍的，1941年春天应征入伍的新兵则作为军队的预备役。而苏军1941年3-4月应征入伍的新兵马上编入野战军，苏军边防军中一年期士兵占战前普通士兵总数的2/3以上，其中一年期士兵里，1941年应征入伍者居半数。更有甚者，很多人到战前尚未来得及履行宣誓仪式，[14]因而，到敌人进攻时尚未真正武装起来。
    从1941年2月重新组建起来的机械化军兵种，其前身既有坦克师，也有骑兵师和步兵师，因而对骑兵和步兵部队的军官需要重新培训，学习机械化作战的知识。例如，西部特别军区新组建5个坦克师，计划派800名少尉赴列宁格勒、奥勒尔和喀山接受为期三个半月的专门培训，1500名军官就地在各师重新培训，然而到战争开始前，他们仅学习了一个多月，[15]西部地区其他部队情况与此类似。
    苏军军事建设方面漏洞百出，使其战斗力大打折扣，在强敌突然攻击面前，既无招架之功，更无还手之力，是不难理解的。
    三
    苏军军事建设方面的失误由于战略失当而加重。斯大林囿于第一次世界大战时的经验，认为德国和苏联这样的大国间进行的战争，还会象第一次世界大战一样，掩护主力部队的军事冲突在前，双方主力行动在后，只有双方主力动员集结后，决战时刻才会到来。苏军总参谋部坚持认为，德军在集中和展开方面所需时间与苏联相当。苏联军事领导完全忽视了1939-1940年德军在西欧战场上的战略战术变化。
    苏军作战计划未能充分考虑敌人充分动员、力求初战告捷的战略方针。苏军边防军甚至保持和平时间编制，边界附近部署的部队（第一战斗梯队）按战时编制展开需要3昼夜，全军后方动员应在交战后的5-7昼夜内完成，在战争发生地区军队充分展开应在30日内完成。这种计划完全抵御不住德军的密集分割夹击。如第一战斗梯队部署在离边界10-20公里的地方，它应在发生进攻威胁时进入防御阵地到6月22日清晨，苏军多数边防师离自己的防御阵地，比敌人还远。
    苏联的军事理论将进攻置于优先地位，作为彻底击垮敌人的唯一手段，一切都立足于进攻。1941年5月，在朱可夫领导下总参谋部制定的边境掩护计划中，未要求担任第二、第三作战梯队的部队构筑防御工事，其任务是准备反击。只有担任第一作战梯队的部队构筑防御工事和准备防御，在这种思想支配下，对于其他作战方案，如遭遇战，不得已的退却行动，被包围时的战斗行动，都未做认真研究。
    苏军领导首先立足于进攻的主张产生了不良后果。各级指挥员都没有进行艰苦防御以对付强敌的足够心理准备。1941年6月25日，苏军总参谋部承受不住西北和西方面军惨败的压力，下达了放弃进攻向后撤退的命令，6月29日前，西南方面军曾试图组织反攻，没有成功，7月初，朱可夫曾严令南方面军指挥官死守比萨拉比亚，[16]也未能如愿。
    斯大林对德军战略主攻方向的估计也不正确，他认为，乌克兰盛产粮食、原料、燃料，工业发达，希特勒只有先夺取乌克兰，才能与苏联长期作战。因此判断德军主攻方向将是乌克兰。然而德军将其最强大的陆军和空军集中在西部的白俄罗斯方向，战争爆发后，苏军不得不把原先集结在乌克兰的一部分军队调往西部方向，使数十万军队处于在行进间投入战斗的被动局面，这是抵制敌人纵深突破措施受阻的原因。斯大林对德军的兵力部署的估计也不正确，他认为，被西方战场拖住的德军空军、陆军不会少于半数，其实，苏德战争爆发时，德军留在西方战场的陆军和空军只有1/3，而且是战斗力最差的部队。
    苏军总参谋部认为，在即将开始的战争中，必须使物质技术器材更加靠近部队，一般说来这种思想是正确的。可是未估计到闪电战、快速分割战略所带来的一系列问题。战争爆发后，苏联边境地区有近200个燃料、军用物资和武器库落到了德军手中，打乱了苏军的后勤补给体系，直接影响到苏军组织有效的反击。