哈瓦斯在埃及考古方面的职业生涯，早在20世纪60年代末就已经开始了。他最初在图拉、马拉维担任中埃及地区文物督察，随后到埃德富、阿布辛拜勒、基泽金字塔等古迹地区工作。1987年，他从美国获得博士学位归国后，曾担任基泽金字塔、萨卡拉和巴哈里耶绿洲古迹总督察，主持埃及境内的重大考古发掘工程。1988年以来，哈瓦斯在世界各地的许多大学，讲授过埃及考古学、古埃及历史以及古埃及文化。在长达30余年的考古生涯中，哈瓦斯博士参加过埃及境内几乎所有重要考古现场的挖掘工作，取得过多次重大发现。
    从1996年起，哈瓦斯领导的一支考古队在位于开罗西南的巴哈里耶(Bahariya)绿洲开始发掘，寻找沙漠墓葬遗址。巴哈里耶距基泽金字塔地区大约360公里，是埃及西部沙漠绿洲中距离开罗最近的一个。1999年，哈瓦斯在这里发掘出土了多达10000具的古希腊罗马时期的木乃伊。(29)此次考古发现在国际考古学界产生了广泛的影响。埃及西部沙漠绿洲的考古也因此被纳入埃及考古学领域，并成为其中的一个重要组成部分。
    从20世纪70年代起，哈瓦斯就开始了在基泽大金字塔附近的考古工作。作为基泽金字塔地区的古迹管理负责人，哈瓦斯素有“金字塔卫士”之称。1991年，在他的主持下，在基泽地区狮身人面像的东南部发现了一片修建金字塔工人们的墓区。至1992年初，在这片墓区相继共发掘了159座坟墓。这些坟墓的发现，改写了人们以前认为金字塔是由广大的古埃及奴隶建造的认识。经过对大量的相关考古证据的研究之后，2008年8月4日，哈瓦斯在胡夫大金字塔脚下宣布：金字塔的建造者是古埃及平民，而不是奴隶。这一观点改写了长期以来学界所认为的古埃及金字塔由奴隶建造的历史。
    2002年9月17日，哈瓦斯主持了胡夫大金字塔“机器人探索之旅”的大型考古活动。美国福克斯电视台现场直播了全过程。直播期间，哈瓦斯在距离胡夫大金字塔不到1公里处的一座古墓石棺中，发现了一具4500年前的男性骨骸。这具骨骸保存完整。刻写在墓室外面的古埃及文字说明，这位沉睡了数千年的墓主，就是当年修建胡夫大金字塔的最高监工。该古墓的发掘资料，进一步印证了哈瓦斯提出的古埃及金字塔是由古埃及平民，而不是奴隶建造的观点的正确性。
    2005年3月，埃及最高文物委员会决定借助“CT”技术，对古埃及历史上英年早逝的国王图坦哈蒙的木乃伊进行检测。图坦哈蒙是新王国时期的一位年轻法老。他八九岁时继承埃及王位，十八九岁时却神秘地驾崩。这段历史给埃及学者带来众多的不解之谜。1922年，英国考古学家卡特发掘了该国王的坟墓。学者们期待通过对图坦哈蒙木乃伊的检测，为解读这段历史提供更多的线索。西方埃及学者相继对该国王的木乃伊进行了3次检测，但对国王的死因并没有达成共识。(30)哈瓦斯决定组织本土埃及学者，对图坦哈蒙的木乃伊进行新的检测。以哈瓦斯为领导专家组得出的结论认为，国王头部颅骨处的伤痕并非由于国王生前受外伤所致，而是在其木乃伊制作过程中，工匠师在摘取脑髓时所留下的。图坦哈蒙国王很可能由于生前腿部骨折导致感染，从而最终导致死亡。(31)这一观点具有很强的震撼力，在国际埃及学界产生了广泛影响。
    2006年3月，以哈瓦斯为领导的研究小组开展了确认古埃及历史上著名女王哈舍普苏特的木乃伊的活动。哈舍普苏特是新王国时期第18王朝的一位著名的女性统治者，是古埃及历史上统治时间最长的女性统治者。据古埃及历史的相关记载，在女王统治的第22年，她突然从历史上销声匿迹了。(32)接下来，遍布各地的建筑物上的女王名字和图像统统被抹掉。女王的下落究竟如何呢?她被谋杀了吗?抑或归隐某处?(33)这些问题都成为长期困惑埃及学家们的难解之谜。因此，寻找女王的木乃伊具有非常重要的意义。20世纪初，考古学者在位于现在埃及南部城市卢克索的帝王谷中找到了女王的陵墓。该陵墓里面发现了两具石棺，石棺上的铭文表明一具属于女王，另一具属于女王的父亲图特摩斯一世。但遗憾的是，两具石棺空空如也。不过，学者们倒是在该陵墓里面发现了刻有女王名字且装有其内脏的瓶罐。哈瓦斯领导下的埃及最高文物委员会启动了确认女王哈舍普苏特身份的计划。研究小组通过对开罗博物馆收藏的多具古埃及女性木乃伊，采用“CT”扫描和“DNA”鉴定技术进行比较检测，并以女王陵墓中瓶罐内的一颗牙齿为突破口，最终确认了女王哈舍普苏特的木乃伊。(34)2007年6月27日，哈瓦斯正式对外公布女王哈舍普苏特的木乃伊得到了成功确认。他称女王哈舍普苏特木乃伊身份的确认是“继图坦哈蒙墓考古发现以来埃及最重大的考古发现。”(35)2008年，在埃及最高文物委员会的领导下，埃及建立起了两座顶尖水准的DNA测序实验室。本土埃及学者们决定对图坦哈蒙以及另外10具其亲属的木乃伊进行DNA分析，试图采用最新的科技手段推动本土埃及学研究的进一步发展。2010年2月，埃及最高文物委员会宣布，DNA检测结果揭示了图坦哈蒙父母的真实身份，即埃赫那吞是图坦哈蒙的亲生父亲，埃赫那吞与自己的亲生姐妹结合生下了图坦哈蒙。(36)这一观点在国际埃及学界产生了巨大的冲击力，有一些西方埃及学者支持哈瓦斯的观点，但是更多的西方埃及学者并不以为然，他们认为哈瓦斯得出的结论过于草率。在长期的考古职业生涯中，哈瓦斯获得过无数的奖项和荣誉。1998年，埃及总统穆巴拉克授予他艺术与科技最高荣誉奖。2002年11月的火星探索任务中，哈瓦斯的名字被刻于光碟，放置在火星上。2005年8月，哈瓦斯被美国高中学生选为“世界最具冒险精神的先驱”之一，并列者有30名著名作家、科学家与诺贝尔得主。2006年5月，哈瓦斯被时代杂志选为“世界最有影响力的100人”之一。长期以来，哈瓦斯以一系列重要的考古发现，独到的学术观点和丰富的专业论著，被世界考古界公认为埃及学研究的权威之一。哈瓦斯作为一名本土埃及学者，领导的本土埃及学者们所进行的诸多努力，反映了埃及本土学者向西方发达国家争夺国际埃及学话语权的决心，也彰显了本土埃及学者跻身于国家埃及学前沿的信心。虽然本土埃及学者们的一些研究成果，尚未得到国际埃及学界的广泛认同，但随着时间的推移，本土埃及学者必将会在国际埃及学舞台产生更大的影响。