那么，该清真寺是明代何时“敕修”的呢？在清康熙二十八年（公元1689年）的《重建清真寺碑记》中，有关于明时敕修年代和清初重修情况的记载。碑文说：“大梁清真寺在城之东南隅，乃教人礼拜祝国之所也。起于唐贞观二年，其众始入中国，时代修葺不圮。明永乐五年，敕赐增修，建（有）碑记。壬（午）流寇播乱，河伯助虐，凡楼阁台榭，俱委于洪涛浊浪中，而寺亦湮没。迨我朝定鼎，越数十纪，梁园景况尚是白茅满径，黄苇盈郊，官无驻节之地，民无棲身之所。大中丞张公来抚豫，心甚恻之，遂捐俸金，修城池，招哀鸿而安集之。于是二三居民，披荆棘，寻遗址，于寺基建草室数椽，因庐于侧，以朝夕拜祀不辍。顺治乙未，掌教曹明，教里人郭鹿鸣、李尚仁等，倡众募修，为正殿五楹，两廓六楹，门三楹，不数年间，门户垣墉，焕然一新。”（24）
    据此，可知开封的伊斯兰教礼拜寺是在明朝永乐五年（公元1407年）“敕赐增修”，而于清朝顺治十二年（公元1655年）又倡众重建的。同时我们还可以知道，既然该礼拜寺是在明永乐五年敕赐“增修”的，那么该寺的始建年代，肯定要在此之前。而从上述碑文看来，似乎早在唐朝贞观二年（公元628年），就已经开始建寺了。果若如此，则开封的这座伊斯兰教礼拜寺，应为中国伊斯兰教最早的礼拜寺之一了。但在明永乐五年时，该礼拜寺是否已称为“清真寺”，则从上述碑文中尚难以确知。
    在专记明代开封景况的《如梦录》一书中，有三处谈到了“回回”礼拜寺。其一说：“草三亭又名凤凰巷，俱回子居住，有礼拜寺。”（25）其二说：“至六府角，往西，染房、永宁王府。再西，有皮局，硝熟各样皮张，俱回回居住，有礼拜寺。”（26）其三说：西华门“北是八府园、五道街……迤西三街，都有庙宇，大小生意，亦有皮局，回子居住，有礼拜寺，西邻玉阳观，即杨六郎宅址。”（27）请注意，在上引的三处记述中，都将伊斯兰教的礼拜场所称作“礼拜寺”，而无一处称作“清真寺”者，这是否表明在明朝末年时，开封的伊斯兰教礼拜寺，尚没有出现“清真寺”的名称呢？
    在明末人李光壂所撰写的《守汴日志》中，曾出现有“清真营”、“回营”等称号。书中说：崇祯十四年（公元1641年）二月李自成第一次攻打开封解围后，“三月初一日丙子，各官募兵选将，添设营伍，为未雨绸缪之计。巡按高名衡添设清真营，选将陈济民、中军李文华领之。守道苏壮设道标营，中军赵世忠、哨官苏祯领之。”又说：同年十二月“二十四日乙丑，贼攻东北一面……北门月城为贼所据，有上至瓮城者。守北门回营加衔都司李耀率数十回兵，各持大柳椽，跃过瓮城，尽击贼落城下，王知县急掷火，尽焚之。”（28）
    上述记载中的“回营”所统辖的既然是“回兵”，当然无疑是由开封回民所组成的。问题是这“清真营”，到底是由开封犹太人组成的，还是由开封回民组成的呢？
    如前所述，早在元、明时期，开封犹太人就称自己的“一赐乐业”教礼拜寺为“清真寺”，并自称“清真后人”（29）。而且上述的“清真营”又与“回营”并列。如此看来，这“清真营”似应是由开封犹太人所组成的。但经进一步考查，其实不然。前面说过，当时的“清真营”是由“选将陈济民、中军李文华”率领的。而他们两个都不是开封犹太人而是回民。关于这一点，在回民所立康熙二十八年《重建清真寺碑记》中，说得非常明确。碑文说：“噫！清真教固大有裨于吾梁也！往者闯寇之乱，贼攻汴围城者五阅月，教人陈济民、李文华等请于官，为营以卫，城赖以不陷，岂非拜祝时有以养其义勇耶！”这就清楚地说明，明末农民起义军围攻开封时，河南巡按高名衡所添设的“清真营”，并非是由开封犹太人所组成，而同样是由开封回民所组成的。
    至此，我们可以得出一个结论，即既然在明朝崇祯末年时由开封回民组成的武装力量称作“清真营”，那么，当时开封的伊斯兰教肯定已以“清真”自称了。
    现在需要我们进一步解决的问题是，开封的伊斯兰教究竟最早是何时开始使用“清真”一词的。
    经查考，我们在开封的一座伊斯兰教清真寺里，发现一方长61公分、宽30公分的石额，上面由右向左横刻“清真寺”三个大字，右旁竖刻“万历甲辰岁夏五月吉立”一行小字（30）。按“万历甲辰岁”，即万历三十二年（公元1604年）。这是开封现存最早的刻有“清真”字样的伊斯兰教石刻。这说明，至迟在明朝万历三十二年时，开封的伊斯兰教礼拜寺，就已经开始称为“清真寺”了。这与全国范围内的中国伊斯兰教礼拜寺开始普遍称作“清真寺”，在时间上大体是相一致的。因此，我认为开封伊斯兰教之使用“清真”一词，即令不是从明朝万历年间起始的话，也可能不会在此之前早得太多。
    综上所述，可知中国伊斯兰教开始使用“清真”一词的时间，不论是就全国范围来说，还是就开封地区来说，都较中国“一赐乐业”教（犹太教）为晚。但这并不等于说中国伊斯兰教之称作“清真”，是因袭他人而来。恰恰相反，中国伊斯兰教后来称作“清真”教，完全是其自身名称发展的合乎逻辑的结果。只要我们看一看中国伊斯兰教早期的礼拜寺名称--“清净寺”、“真教寺”，我们就会自然地得出结论，这“清真寺”的名称完全是由先前的名称演化而来的。所以在赋予“清真”一词以宗教上的含义方面，中国伊斯兰教众同样也做出了自己的贡献。