作为藏书家，陆心源“念自来藏书未能垂远”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。），为防后患，就将世所罕见的皕宋宝藏旧刻精钞，“辑其源委，仿贵与马氏、竹垞朱氏、月霄张氏例，成《藏书志》一百二十卷”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。），并交给李宗莲参定同异。当时的初稿有3 尺多厚，卷帙不菲。李宗莲经过长达10个月的繙缉疏录”、细致征核，方付梓成书。全书内容宏富，包含了经、史、子、集4大类，细分为 42类。《皕宋楼藏书续志》则于经部周易类、春秋类、四书类，子部儒家类，及医家类、谱录类、杂家类、术数类，集部别集类、总集类等增益之。
    集中了这么多类书籍的书目与序跋，如何做到全而不乱，聚而不散，陆心源着实费了一番心思，为《皕宋楼藏书志》细致地制定了体例、断限、入志原则及行文标准，以确保体例一致，断限明白，入志有因，行文规范。他在《皕宋楼藏书志·例言》中有详细说明。
    体例与断限仿张金吾《爱日精庐藏书志》体例，“载旧椠旧钞之流传罕见者……习见之书概不登载”。只是张氏之作以元代为断限，《皕宋楼藏书志》则因成书较后，遭遇兵燹，书籍亡佚更多，不得不略宽其例，断自明初。
    入志原则凡是阮元《四库未收书目提要》及张氏所收录的，均采二人之说；有二人所未见的，则仿晁公武《郡斋读书志》、陈振孙《直斋书录解题》之例，附解题以识流别。书目所载序跋，自马端临《文献通考·经籍考》始。“……凡世有刊本暨作者有专集通行，如北宋之二范、欧阳、曾、王、三苏，南宋之朱子、放翁、益公，元之剡源、清容、九灵之类，其序跋已载集中，及经部之见于《通志堂经解》、唐文之见于《全唐文》，并书已刊入《十万卷楼丛书》的，均不更录。”其余的备载全文，使“一书原委，灿然俱陈”。另外，前辈时贤的手迹题识可以帮助辨明古书源流，所以悉为登录。
    行文标准针对行文中遇到的各种情况，陆心源一一定下标准，处理起来简洁明快，读者亦能一目了然。如标题，一依原书旧式，所增时代及撰著者等字用阴文别之；又如前辈时贤手跋以“某氏手跋曰”五字冠之，若有陆心源自己的考识，则加“案”字以示区别；宋元刊本备载行款缺笔，以便考核；所载序跋或钞帙因辗转传写，类多舛{K3JA02.jpg}，有的椠本字迹蠹落，间有缺失，对无别本可据的“悉仍其旧，虽显然亥豕，不敢以一知半解妄下雌黄”；若“一书而两本俱胜者”，则仿《遂初堂书目》，将两者并存。行文在注重翔实的同时，亦十分简练，往往寥寥数语就将所收之书的卷数、版式、成书年代、作者等状况道明。
    对此，参与《皕宋楼藏书志》校对定稿的李宗莲由衷地发出“美哉备矣”的感叹，并说：“若吾乡富于典籍者，……近乾嘉间，石塚严氏芳{K3JA03.jpg}堂、南浔刘氏瞑琴山馆，皆以藏书名与杭州振绮堂汪氏、苏州滂熹园黄氏，埒为阮文达、钱竹汀两公所称。余尝见二家书目，著录寥寥，岂足与先生比长絜短哉！”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。）
    二、撰写题跋，精于校勘
    陆心源收藏之富，撰述之多，为晚清所罕见。张舜徽先生认为他“撰述虽博，而要以校书为最精”（注：张舜徽：《清人文集别录》第559页。）。这从《潜园总集》中众多群书题跋、序记可见一斑。 如《仪顾堂题跋》（以下简称《题跋》）16卷和《仪顾堂续跋》（以下简称《续跋》）16卷，各有317条和307条雅杂抄本、刊本、影印本的跋与后记等，意专群籍，名迹碑版，“刻源流，收藏姓氏，剖析异同，如指诸掌”（注：《仪顾堂题跋·潘祖荫序》，见《仪顾堂题跋》，中华书局1990年出版。）。这是陆心源在“富拥百城”的收藏，以及深识宏览四部七略、百宋千元的学识积累上的又一力作。
    （一）考源流、录板式、收藏姓氏
    《题跋》与《续跋》都详载所收书籍的刊刻源流、该本板式与作者姓名，有的将字体大小、版心所刻文字、有否刻工姓名、何字顶格、何处空格等一一写明，即使未见其书，亦可想见其格式。同时为取信于人，并方便读者查阅，还经常注明资料的出处。如《题跋》卷一《六经图跋》中，不仅有作者姓名：“宋杨甲撰，毛邦翰补”，还告诉读者杨甲写过《棣华小稿》，见于岳珂的《桯史》及《四川通志》；毛邦翰是衢州江山人、绍兴二十七年进士、乾道初官抚州学教授、终于转运判官，并指出这些都可参见《浙江通志》。
    （二）补书缺、正讹误、敢下断语
    陆心源的博物赡闻，使他在读书、题跋的过程中发现了许多不尽如人意的地方，如书中内容的脱漏错误、体例的不完善、标准的不统一等等。于是他不再满足于誊录笔抄，开始了极耗心力，极需耐力，极需魄力的校勘历程。
    首先，他在题跋中补充了各书遗缺的内容。如《题跋》卷五《宋元学案跋》，补充了《安定学案》中论及的潘及甫的生平，尤其是他在庆历中登第后的历官情况与他爱书如痴的表现。在《续跋》卷十四《影元抄玉山名胜集跋》中，陆心源分别指出此本与玉山草堂本、九卷本、玉山佳处九卷本相比，脱漏了好几首诗文，如良琦、顾瑛、于立七首，袁华七律一首等，并据实区别对待，有的依类补入，对已刻于鲍渌饮所辑《玉山逸藁》的则不再录。