在元代杂剧中亦有不少中医看病的描写。如杂剧《萨真人夜断碧桃花》中，太医“把脉”后说：“这寸关尺三指脉微沉细，常是寒热往来”，“我下服建中汤，减了附子，加上官桂，就着他疾病痊可也”（注：作者佚名，《元曲选》第1692页。）。另一出杂剧《降桑椹蔡顺奉母》中，两个骗人的庸医，为病人诊治，“双双把脉”，一把左手，一把右手，诊断完全相反（注：刘唐卿作，《元曲选外编》第430页。）。杂剧《同乐院燕青博鱼》中，梁山好汉燕青因被罚气坏了眼睛，“会神针法灸”的燕二，用“金针”为燕青“下针”，配以口服药，便使他的眼睛“复旧如初”（注：李文蔚作：《元曲选》第233页。）。
    元代除了中医以外，还有回回医师。元代大批回回人（中亚和西南亚信仰伊斯兰教诸民族的成员）来中国定居，他们带来了伊斯兰文化，其中就有伊斯兰医学。元朝政府专门设立了广惠司，管理回回药物。当时大都（今北京）有“回回医官”为人治病，很可能就是在广惠司任职的（注：《辍耕录》卷二二《西域奇术》。）。还有“西域贾胡”“久客江南”卖药，能“痼疾跛癃”（注：王沂：《贾胡歌》，《伊滨集》卷六。）。所谓“贾胡”，指的显然是回回人。这一时期，还出现了《回回药方》这样的著作，系统介绍了伊斯兰医学的各种治疗方法。回回医师在治疗时主要使用“胡药”，以丸散膏丹为主。这些都和使用中药、以汤剂为主的中医形成鲜明的对比。此外在外科手术上也很有特色（注：《回回药方》原本三十六卷，现存残本四卷，关于它的成书年代有元代、元明之际、明初诸说，但其主要内容，应是元代传入的，则无异义，参看《伊斯兰与中国文化》第六章第六节（宁夏人民出版社1995年版。）。伊斯兰医学的传播是元代医疗方式不同于前代的一大变化。
    十三世纪初的蒙古人，没有专门的医生，人们患病时，不是听其自然，就是求助于上天或巫觋。但是长期的游牧和战斗生活的磨炼，使他们积累了某些特殊的医治方法，比较突出的是医治因外伤流血过多的方法。成吉思汗时期，将领布智儿身中数箭，血流遍体，昏迷不醒，成吉思汗“命取一牛，剖其腹，纳布智儿于牛腹，浸热血中，移时遂苏”（注：《元史》卷一二三《布智儿传》。）。成吉思汗之子斡（窝）阔台在一次战斗中中箭流血，有人将“凝住的血咂去”。成吉思汗又“用火将斡阔台箭疮烙了”（注：《蒙古秘史》卷六，第173节。）。咂血和用火烙便是蒙古人治箭（枪）伤的传统方法。在和王罕的战斗中，将领畏答儿受伤，“脑中流矢，疮甚”，成吉思汗“亲傅以善药”（注：《元史》卷一二一《畏答儿传》。）。可见已有医治疮伤的药物。当然，这些治疗方法和药物都是很有限的。随着不断向外扩展，蒙古人逐渐接触到其他民族的医学，开始请其他民族的医生看病。成吉思汗信用的契丹人耶律楚材，“博极群书”，兼通医、卜之术，“丙戌冬，从下灵武，诸将争取子女金帛，楚材独收遗书及大黄药材。既而士卒病疫，得大黄辄愈”（注：《元史》卷一四六《耶律楚材传》。）。这是蒙古人引进中医的较早的例子。而在窝阔台汗时期，宫廷中已经有汉人医生（注：姚燧：《郑龙冈先生挽诗序》，《牧庵集》卷三。）。大批蒙古人移居中原以后，每遇疾病仍求助于上天、巫觋，但请中医、回回医看病日趋普遍。
    在元代，汉族和受汉文化影响较深的民族（如契丹、女真族等）中，中医学知识传播较广。元代流行的日用百科全书型的民间类书《事林广记》便有“医学类”，详记各种疾病的症状和治疗的用药方法，各种药物的用途与加工方法，以及“药性反忌”、“解救药毒”等，目的显然是普及医疗知识，便于自行诊治（注：《事林广记》（后至元刻本）戊集下。按《事林广记》（日本元禄翻刻元泰定本）辛集亦有类似内容。以上两本均见《事林广记》（中华书局1999年版），《事林广记》（元至顺刻本，中华书局1963年影印本）无此项内容。）。当时医生数量有限，看病要收费，再加交通不便，有病请医生诊治并非易事。一般常见的病症，患者及其家属常采取自行购药服用的办法。罗天益的《卫生宝鉴》中便记录了不少这样的例子，如齐大哥“因感寒邪、头项强、身体痛”，先服用灵砂丹，后服通灵散；高郎中弟妇“产未满月，食冷酪、苦苣及新李数枚，渐觉腹中疼”，家人便以槟榔丸服之；等等（注：《卫生宝鉴》卷一《汗多亡阳》；卷三《妄投药戒》。）。但是，这种做法往往引起事故，导致病情的恶化，罗天益是不赞成的。
    以上讲的是医生治病和自行诊断吃药的一些情况。治病的另一种方式是向上天和神祇许愿祈祷。例如：“王荐，福宁人，性孝而好义。父尝疾甚，荐夜祷于天，愿减己年益父寿。父绝而复苏……疾遂愈。”“杨暤，扶风人。……[母]朱氏尝病剧，暤叩天求代，遂痊，如是者再。”“张旺舅，安丰霍丘人。……母病，伏枕数月，旺舅无赀命医，惟日夜痛哭，礼天求代，未几遂愈”（注：《元史》卷一九七《孝友传一》。）。以上是祈天的例子。在祈祷神祇方面，比较常见的是东岳神、城隍神、关羽等。
    向上天或神祇治病祈祷祛病消灾，通常都和许愿联系在一起的。从上面一些例子可以看出，许愿的主要内容是减寿或以身相代，此外，也有表示在自己或某人病愈以后贡献物品。元代杂剧中对此亦有描写。《降桑椹蔡顺奉母》一剧中，因母亲患病不起，蔡顺“对天祷告，愿将己身之寿，减一半与母亲”。果然他的行为“感动天地神灵”，在寒冬天气降生桑椹，其母食用后病愈（注：《元曲选外编》第416-447页。）。杂剧《小张屠焚儿救母》中，因母亲得病，张屠向东岳神许愿，以五岁孩儿作祭品，来救母亲一命（注：《元曲选外编》第716-724页。）。这种荒谬、野蛮的举动并非文学家的虚构，而是当时的实事（注：《元曲章》卷五七《刑部十九·杂禁·禁投醮舍身烧死赛愿》。）。
    祈天或祈神治病，常与“神水”有关。“王思聪，延安安塞人。……父尝病剧，思聪忧甚，拜祈于天，额膝皆成疮。得神泉饮之，愈”。“杨暤母朱氏”失明，暤登太白山取神泉洗之，复如故。“赵荣、扶风人，母强氏有疾，荣……负母登太白山，祷于神，得圣水饮之，乃痊”（注：《元史》卷一九七《孝友传一》。）。“神泉（水）”治病，在民间流传已久，元代仍然流行。某些泉水因传说与天、神有关，因而便蒙上了神秘的色彩，被认为有治病的特殊功能。
    治病还有一种方式是请巫觋施行巫术或道士施行法术。患病是由于鬼怪作祟的结果，施行巫术或法术。驱除作祟的鬼怪，可使病人恢复健康，这是当时各族群众中普遍存在的一种认识。关于道士施行法术治病，主要流行于汉族中间。元代道教中有不同派别，有的宗教强调个人修炼，有的宗教则擅长法术，施行符咒，自称能驱使鬼神、祈雨治疾。例如湖州道士莫月鼎，有疾患求治者，“或以蟹中黄篆符与之，或摘草木叶嘘气授之，无不立愈者”（注：宋濂：《宋文宪公全集》卷九《元莫月鼎传碑》。）。杂剧《萨真人夜断碧桃花》中，状元张道南及第后任潮阳知县，“染病在身，医药无效”，他的父亲认为“必有邪魔外道迷着”，便请萨真人救度。萨真人设一坛场，施行法术，驱使神将押到女鬼。张道南因此得愈（注：作者佚名，《元曲选》第1684-1701页。）。