停战谈判与军事调处过程中，我方有得有失。在华北、山东开辟的部分新解放区取得了合法地位，但中原解放区的情况却相当不利。抗战胜利后，中央军委为适应新形势需要，于1945年10月将原新四军五师、八路军河南军区与南下的三五九旅合并组成中原军区，向鄂豫边的五师驻地集结。国民党当局调集大军包围并压缩中原军区根据地，到停战令公布时，中原军区5万余人被压缩在以宣化店为中心的罗山、光山、商城、经扶（今河南新县）、礼山（今湖北大悟）之间，纵横不足百里的狭小区域内。由于受到停战令的限制，我军既不能与国民党军作战，又不能机动转移，很快陷入困境。但是，中原军区的坚持牵制了近20万国民党军队，减轻了其他解放区的压力。
    停战谈判与军事调处的过程曲折，还与美方立场密切相关。但是中共本着和平的愿望，坚持有理、有利、有节的斗争，维护了和平局面和解放区的利益。正如周恩来在《一年来的谈判及前途》的讲话中说：“对中国人民来说，根据地比什么都重要。武装固然重要，但武装毕竟是保持根据地的工具，武装脱离了根据地就无法生存。蒋看清了这一点，他也特别懂得这个问题的重要性，因此，他无论如何不承认。”蒋介石则在《苏俄在中国》中写道：“（民国）三十五年这一年间，国际调处与政治协商，更是造成一种姑息妥协的气氛，使中立主义愈益猖狂。这中立与民主的伪装，掩蔽了‘共匪’的军事行动，申张了他的渗透工作，瓦解了反共的力量，最后破坏了政府动员勘乱的政策。这要比‘共匪’自己直接的活动，发生了更大的效力。”
    关于整军，《双十协定》根据“军队国家化”的原则，商定中共军队进行统编。1946年2月25日，周恩来、张治中、马歇尔共同签署了《关于军队整编及统编中共部队为国军之基本方案》。规定国共双方军队按五比一的比例整编，中共军队编为18个师。双方编余人员限期全部复员。这个方案对我方相当有利，一是实现了军队合法化；二是可能获得美式装备，提高我军的质量。周恩来指出：“整军方案是使中国人民武装受束缚的，但也受保障的，这有它的两面性。在数目上，五十比十，对我们是一个束缚，但也还不是主要的，主要的是规定要经过美国装备，我们十个师也包括在内。……整军方案还有他好的一面，这就是地方自治。人民的武装是地方自治的东西，六十个师只是用在国防上的。地方自治要依靠人民的武装的自卫，我们这里已经自治了，不再需要国家的军队来防匪了，这样就保障了我们解放区人民自己的武装不受国家军队的干涉。这样一看人民并不吃亏。”所以，中共中央认真地执行整军协议。1946年2月24日中央给各分局的指示电说：“现在我军各级建设即须执行将校尉的正规制度。……中央认为我党军事干部应该请求政府加委，取得正式官衔，以便将来在国防军中占有一定地位。……同时为了准备将来国民党内的反动派对我举行突然袭击时，我仍能有效地组织自卫斗争起见，中央决定除将二分之一的主力部队编为保安部队外，再保留一部（大约三分之一）好的军事政治干部在各解放区隐蔽起来，不要请求国民党加委，以免受军事法规的束缚及国民党的破坏，保持活动的自由。”[5]各军区都呈报了完整的部队编制表，由中央掌握进行整编。
    遵照中央指示，各解放区部队于1946年2月起开始了一期整编复员工作。复员的对象主要是老弱病残、机关多余人员和地方武装，比例约占总数的三分之一。整军复员的力度相当大。当时各军区复员的人数相当多。晋察冀军区复员10万人，占兵员总数的一半。中原军区因财政困难，中央指示从5万人中复员2万，以减轻压力。三五九旅准备复员部分超编干部到地方，大家都流着眼泪不愿意走。有的复员回家的人在半路被国民党军队抓去，钱被搜光，人遭拷打。王恩茂在日记中记录了这些情况，认为“在这种情况下，复员是值得考虑的；复员搞得不好，将会造成罪恶。”他的预言不久就得到了印证，当国民党军向解放区发动全面进攻后，我军因兵力太少，在战争初期处于明显的劣势。萧克总结晋察冀军区张家口保卫战失利的教训时也指出：“和平民主新阶段的提出，特别是停战协议生效后，有些同志滋长了和平麻痹思想，在战争爆发之前，边区部队复员转业约10万余人，占军区全部军队一半。战争一来，兵员不充实，有的兵工厂停产，甚至炮弹也停产了，这些都削弱了部队的战斗力。”[6]
    与此同时，国民党军也进行了整编。但蒋介石的目的是为发动内战，消灭解放区作准备。他在1946年6月7日的讲话中说：“我们在抗战结束的时候，因为经过这样长期苦斗，一般部队未免精神疲惫，内容空虚，战斗的力量和纪律皆不甚健全。这在当时平汉路与津浦路各战场剿匪的经过，可以明证。因此我们不能不有一个相当的时间休养整训，来充实我们军队的力量，必须有这样一个整备的时期，而后我们剿匪才能立于不败之地。”[4]（P,324）国民党军经过整编，撤并了杂牌部队，大大充实了嫡系部队，使其达到齐装满员，并配备了美式重型武器。尤其是整编第74师、第11师等“五大主力”，在内战初期起到了“拳头部队”的作用。
    因此，当1946年5月解放区完成一期整军复员后，国民党和美方不仅没有兑现当初的承诺，反而因东北战局的发展变得日益强硬。6月17日，蒋介石通过马歇尔向中共代表提出《东北整军及中共军队在关内外划地驻留之方案》，强迫我军退出哈尔滨，热河、察哈尔两省及山东的烟台、威海等地区，遭到我方拒绝。周恩来指出：“在停止东北战争、恢复交通、整军等问题上，都作了许多的让步，但结果还是破裂，中心问题仍是政权问题，根据地问题。”[7]国民党既然拒绝承认解放区和人民军队的合法性，整军也就无法继续下去。认清这个形势，中共中央从5月份向各解放区发出练兵备战的指示，准备在国民党全面破裂和发动内战时，进行自卫战争。