第三，海军一味强调舰队决战解决问题，平时大力发展决战兵力--以战列舰、航母为核心的强大水面舰队，将护航置于无足轻重的地位。战争爆发后，船队护航名义上由海军镇守府、警备府和联合舰队分担，实则是以有限兵力分兵把守，有其名而无其实。至1943年11月15日，日本已损失船舶250余万总吨， 才成立“海上护卫总司令部”，但护航兵力仍屈指可数。海军的反潜学则到1944年3月24 日方宣告成立。
    最后，过低估计美国潜艇的作战能力，错误地认为美国在太平洋战争中使用潜艇破坏日本海上交通的可能性是微乎其微的。对美国投放大量水雷封锁日本的港口、海峡和航道，更是日本没有想到的。
    附表：
    日本船舶损失统计（1941年12月8日至1945年8月15日）损失 原因潜艇击毁航空兵炸毁水雷炸毁海上事故等合计
    年份艘 总吨艘总吨艘总吨艘总吨 艘 总吨
    1941年631,6733 16,9012 6,58511 55,159
    1942年142609,925 43206,424 1142,10329119,475225977,927
    1943年2931,312,353 115 320,127 9 17,64446117,5004631,767,624
    1944年5672,388,709 400 1,256,509 1533,62496144,6431078 3,823,485
    1945年145420,826 344 802,656 214 468,225 88117,4877911,809,194
    合计1153 4,763,486 905 2,602,617 249 561,596 261 505,6902568 8,433,389
    日本船舶运营会关于100总吨以上的船舶统计
    注释：
    ①《海上护卫战》，〔战史丛书（46）〕，防卫厅防卫研修所战史室著，朝云新闻社发行，1971年5月，第2页。
    ②《太平洋战争》（5），〔现代史资料（39）〕，三铃书房发行，1975年3月，第791页。
    ③④《太平洋战争》（5），第793、560页。
    ⑤《海上护卫战》，第549页；《太平洋战争》（5），第826页。
    ⑥《海上护卫战》，第181-182、287-288、407-408及543-545页。
    ⑦同上书；《太平洋战争》（5），第550页。
    ⑧⑨《海上护卫战》，第555页。
    ⑩（11）（12）（13）同上书，第543、556、557、558页。
    （14）同上书，第558页；《太平洋战争》（5），第595页。
    （15）（16）（17）《海上护卫战》序言
    （18）（19）（20）同上书，第62-66页。
    （21）（22）（23）《太平洋战争》（5），第527、545、546页
    （24）同上书，第33页。
    （25）《美国战略轰炸调查报告》。
    （26）（27）《太平洋战争》（5），第33、34页。
    （28）《支那事变陆军作战》（3），〔战史丛书（90）〕，防卫厅防卫研修所战史室著，朝云新闻社发行，1975年，第153页。
    （29）《海上护卫战》，第562页。