《日知录》的刻本有三个系统：一为康熙九年（1670年）顾炎武的自刻本，8卷。援庵先生称之为初刻本。一为康熙三十四年顾弟子潘耒整理的32卷本，此时顾已去世13年。一为道光十四年（1834年）黄汝成集释本，是在潘本的基础上集诸家相类文章于顾氏原文之后，也是32卷。后来通行的是黄氏集释本。除此之外，还有不同时期的抄本。潘本和集释本都没有处理顾氏原文与引文区分的问题。不但如此，还增加了一个新的问题，即把《日知录》所引书的注文与顾炎武自己的注文混淆了。潘本两种注文同用小字，集释本则一律加“原注”二字。《日知录校注》要解决的第二个问题，就是区分顾所引书的注文与顾的自注。
    总之，援庵先生作《日知录校注》，就是要“溯本追源，辨认其本来面目”，使读者正确了解《日知录》，并为学者研究顾炎武思想与学术提供帮助。为此，他将《日知录》所引书“全部找出，溯其史源，校其异同，注其起止，并正其偶误”，历时近30年，基本完成本书。但此时他已是年近八旬的老人，还承担着北京师范大学校长的重任，最终留下的仍是一部文稿。
    他所说的“溯其史源，注其起止”，就是把《日知录》所引之文，一一寻找或核实其出处，注出书名、卷数或篇名，标明起止。在现代规范的学术论著中，这些本来是对作者的基本要求，但古人引书很少注出处，更不会注明卷数、篇名，标明起止。《日知录》中就出现复杂的情况：有些引文根本不注出处；有的虽注出书名，但不注卷数，而像《册府元龟》这样一千卷近千万字的大书，仅注书名，读者很难查对；有的误注出处，如引自《通鉴》，注《旧唐书》；有的引文开首说某书云云，读者可知引文起首，但如果不查原书，往往不知道引文止于何处；有的在引文结束处注出书名，读者知道引文止于何处，却不知起于何处。援庵先生在作校注时强调，顾炎武所引之书，要尽行找出，与原书核对。因此，他解决了区分顾氏原文与引文的问题，也解决了潘本和集释本将顾氏自注与所引文的注文混淆的问题。
    所谓“校其异同”，主要是对《日知录》不同版本及各种抄本的校勘。援庵先生非常重视初刻本。初刻本虽然只有8卷，并且不是定稿（直到亭林去世，《日知录》仍然没有定稿），但是顾氏的自刻本，对了解、研究他的思想发展非常重要。援庵先生在目录中，在批注中，将潘刻本、集释本中初刻本原有的篇目一一标出，并注明两者在内容和文字方面的差异，特别是指出潘本、集释本因政治原因对清朝忌讳的“胡”、“虏”、“本朝”等文字所作的改动。
    所谓“正其偶误”，包括纠正顾炎武所注出处之误、引文之误、论断之误。
    通过上述几方面的工作，校注达到了原定目的，就是还《日知录》全书和顾炎武的思想以本来面目。
    《日知录校注》还有其他方面的重要内容。这与作者把《日知录》作为史源学实习课的教材密切相关。首先是对顾炎武的评论。这些评论既包括学术，也包括思想；既有高度的评价，也有尖锐的批判；既有解释，也有阐发。这些评论对理解、研究顾炎武的思想与学术很有帮助。其次是揭示考证的方法。《日知录》中有些条文注引文出处，有些不注出处，援庵先生在校注中不但给出正确的答案，而且在一些典型的事例中，还列出自己寻找答案的过程；在把这些校注扩充成文时，更阐明自己所用的方法，富有启发意义。援庵先生重视著作体例。他曾计划写一部关于著作体例的专著《广书林扬觯》，但后来只是编集了13册资料并拟了一个不完整的提纲。在《校注》中也有大量关于著作体例的内容，如果把它们辑录出来，并与他在其他著作中的有关论述，以及他的《广书林扬觯》提纲和在13册资料上的批语加以整合，就构成他关于著作体例的系统论述。他在这些论述中，提出了史学著作应该遵守的基本规范，以及根据著书宗旨，如何找到恰当的表达方式。同样的内容，是否有好的著述体例，效果不大一样。
    援庵先生校注《日知录》，是以批注的形式写在民国元年武昌官书处翻刻的粤刻集释本上的，它的底本是道光十四年黄汝成西豁草庐重刻定本集释本。在这部《日知录》的书眉上，有他前后20多年写的批语，也有少数是他让助手查找出处的记录，引文起止则在正文中用引号标明。如果照原样影印或排印他的批注，读者阅读、使用都不方便。他也曾设想过整理成文本时的版式，但没有定论。
    援庵先生是1971年6月逝世的。他去世后，先父乐素先生开始整理这部书稿，并完成了第1卷的样稿，将校注从书眉移到正文每段之后。1979年他转到广州暨南大学任教，又曾与叔父约之先生共同研讨过这部书稿。1983年，在先父老友杨向奎先生的推介下，由陈祖武先生过录、整理了前7卷。2003年《陈垣全集》的编辑工作开始进行，又由致易弟整理后面的25卷。我则做了全书的统稿、审订工作。至此，历经三代人80多年的努力，《日知录校注》全书终于得以和读者见面。
    因为许多工作是在援庵先生身后进行的，有必要将我们所做的工作向读者作一说明：
    一、将全书由眉批的形式改为校注，置于每条的每一段之后。
    二、原文只有断句，现加标点符号。