陆心源将宋元旧版藏于“皕宋楼”。“皕”即二百，以此为名，足见陆心源欲驾临“百宋一廛”之胆识。另有“十万卷楼”，专藏明以后的秘刻及精钞本、精校本。为了把珍本与一般书籍区分贮藏，他又在潜园建“守先阁”藏书楼，按《四库全书》书目编序，收藏明以后刊及寻常钞帙，附以优秀的近人著述，并对外开放。
    正因皕宋楼藏书不仅颇具规模，而且精品极富，后人把它与山东聊城杨绍和的“海源阁”、江苏常熟瞿镛的“铁琴铜剑楼”、杭州丁丙的“八千卷楼”合称为晚清四大藏书楼，历来评价极高。陆心源的同乡后学李宗莲甚至认为享有盛名的明代范钦的藏书楼--天一阁在藏书的总数、宋刊本的数量、择书的精纯、藏书楼的开放程度以及收藏的难度等5个方面，都不及皕宋楼。这种说法，虽有夸饰， 但在当时有一定的代表性。当然，也有人认为皕宋楼宋刊中有明仿宋本，有明初刻似宋本，有误元刻为辽、金本，有宋板明南监印本，“存真去伪，合计不过十之二三”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。）。更有如张篑斋者云：“陆心源自称皕宋，实则明本充宋者居多。”（注：杨立诚、金步瀛合编，俞运之校补：《中国藏书家考略》第237页，上海古籍出版社1987年4月出版。）不过，晚清著名学者俞樾在为陆心源所作的墓志铭中，又称陆心源藏有宋本200余种，元本400余种。这些争论，因皕宋楼藏书被陆氏子孙卖去日本，无从取证，难下定论。
    作为藏书家，陆心源“念自来藏书未能垂远”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。），为防后患，就将世所罕见的皕宋宝藏旧刻精钞，“辑其源委，仿贵与马氏、竹垞朱氏、月霄张氏例，成《藏书志》一百二十卷”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。），并交给李宗莲参定同异。当时的初稿有3 尺多厚，卷帙不菲。李宗莲经过长达10个月的繙缉疏录”、细致征核，方付梓成书。全书内容宏富，包含了经、史、子、集4大类，细分为 42类。《皕宋楼藏书续志》则于经部周易类、春秋类、四书类，子部儒家类，及医家类、谱录类、杂家类、术数类，集部别集类、总集类等增益之。
    集中了这么多类书籍的书目与序跋，如何做到全而不乱，聚而不散，陆心源着实费了一番心思，为《皕宋楼藏书志》细致地制定了体例、断限、入志原则及行文标准，以确保体例一致，断限明白，入志有因，行文规范。他在《皕宋楼藏书志·例言》中有详细说明。
    体例与断限仿张金吾《爱日精庐藏书志》体例，“载旧椠旧钞之流传罕见者……习见之书概不登载”。只是张氏之作以元代为断限，《皕宋楼藏书志》则因成书较后，遭遇兵燹，书籍亡佚更多，不得不略宽其例，断自明初。
    入志原则凡是阮元《四库未收书目提要》及张氏所收录的，均采二人之说；有二人所未见的，则仿晁公武《郡斋读书志》、陈振孙《直斋书录解题》之例，附解题以识流别。书目所载序跋，自马端临《文献通考·经籍考》始。“……凡世有刊本暨作者有专集通行，如北宋之二范、欧阳、曾、王、三苏，南宋之朱子、放翁、益公，元之剡源、清容、九灵之类，其序跋已载集中，及经部之见于《通志堂经解》、唐文之见于《全唐文》，并书已刊入《十万卷楼丛书》的，均不更录。”其余的备载全文，使“一书原委，灿然俱陈”。另外，前辈时贤的手迹题识可以帮助辨明古书源流，所以悉为登录。
    行文标准针对行文中遇到的各种情况，陆心源一一定下标准，处理起来简洁明快，读者亦能一目了然。如标题，一依原书旧式，所增时代及撰著者等字用阴文别之；又如前辈时贤手跋以“某氏手跋曰”五字冠之，若有陆心源自己的考识，则加“案”字以示区别；宋元刊本备载行款缺笔，以便考核；所载序跋或钞帙因辗转传写，类多舛，有的椠本字迹蠹落，间有缺失，对无别本可据的“悉仍其旧，虽显然亥豕，不敢以一知半解妄下雌黄”；若“一书而两本俱胜者”，则仿《遂初堂书目》，将两者并存。行文在注重翔实的同时，亦十分简练，往往寥寥数语就将所收之书的卷数、版式、成书年代、作者等状况道明。
    对此，参与《皕宋楼藏书志》校对定稿的李宗莲由衷地发出“美哉备矣”的感叹，并说：“若吾乡富于典籍者，……近乾嘉间，石塚严氏芳堂、南浔刘氏瞑琴山馆，皆以藏书名与杭州振绮堂汪氏、苏州滂熹园黄氏，埒为阮文达、钱竹汀两公所称。余尝见二家书目，著录寥寥，岂足与先生比长絜短哉！”（注：《皕宋楼藏书志·李宗莲序》，见《皕宋楼藏书志》，中华书局1990年出版。）