12世纪末粮价上升，随着自营地再次集中经营，领主重新收回惯例和自由佃户世袭持有的自营地磨坊。1189年以后格拉斯顿伯里修道院庄园的非领主磨坊显著减少。在1189年记录的28个磨坊中，1260年时20个磨坊以惯例或自由租佃条件持有，在经历了13世纪最后几十年的戏剧性下降后，1300年后只有9个独立磨坊幸存下来。（51）另据1279年沃里克郡的百户区案卷，斯通利（Stoneleigh）和基雷顿（Kireton）百户区的70个磨坊中有48个位于自营地内，另外12个也是自营地磨坊，只有3个磨坊由佃户以世袭保有权持有，还有7个情况不明。1299年伍斯特主教地产也是如此，40个磨坊中只有7个由自由或惯例保有权持有。（52）
    13世纪至黑死病前，领主对自营地磨坊的控制进入黄金时代，常常交替或同时使用雇工和出租两种方法经营自营地磨坊。例如伊利主教在13世纪初雇佣磨坊主经营自营地磨坊，但1222年只有3个磨坊获得预期收入，领主迅速调整磨坊的经营方式。1251年49个磨坊中12个用来出租，1298年53个自营地磨坊除了3个外全部出租以便收取货币租金。（53）1290年伍斯特主教地产上的32个磨坊中一半直接经营，另一半出租。（54）无论采用哪种经营方式，磨坊的收入都要依赖收取加工费。一般来说，市场需求决定磨坊收入。但除此之外，中世纪的磨坊服务又带有强制性，磨坊义务（suit of mill，即法律要求佃户只能光顾自己领主的磨坊）对于获得较多的磨坊捐（multure，它是顾客用来支付磨面服务的谷物）十分重要，尽管精确地估计其影响或税率是困难的。（55）贝内特认为，按照13世纪《磨坊规章》的估计，磨坊捐一般“为谷物的二十分之一或二十四分之一，但是根据庄园账簿和其他文献的详细记载，平均起来更有可能为十六分之一。”自由人和农奴缴纳的磨坊捐的数量也不一样。在达勒姆各庄园，自由人只缴纳谷物的二十四分之一，而农奴却要交纳谷物的十三分之一。（56）
    自营地磨坊直接经营时领主要雇佣磨坊主，磨坊主作为自营地的雇工出现在庄园账簿中，其工资收入也被记录在案。13世纪80年代在温切斯特主教庄园，磨坊主平均每年获得6先令或者以下的现金，还有约5夸特的谷物津贴。1275年，格拉斯顿伯里修道院的米德尔佐（Middle Zoy）庄园的磨坊主的工资为6先令现金和4夸特1蒲式耳谷物津贴。磨坊主的收入与庄园仆人例如犁把式和车把式常常没有区别。1307年，剑桥郡的伯韦尔（Burwell）庄园两个磨坊的两位磨坊主每年各收到4先令6便士和4夸特谷物，磨坊主与犁把式的收入几乎相同，但后者5先令的现金收入稍高一些。磨坊主一般拥有一两个男孩作为自己的助手，1351年克兰菲尔德（Cranfield）的一个男孩每隔24周收到1夸特谷物作为工资。1211年温切斯特主教的萨瑟克（Southwark）磨坊付给2个仆人更高报酬，每人4先令，而磨坊主6先令。（57）雇工直接经营特别适合较大的城市磨坊，1300年布里斯托尔的4个王室磨坊收到70夸特或更多的小麦和黑麦作为磨坊捐，国王可以收入10-15英镑。农村小磨坊的利润更难确定，它们大多数同时可以磨面和碾碎麦芽和燕麦，通常将作为磨坊捐收来的麦芽和小麦出售，但大多数谷物作为实物津贴分配给庄园仆人。（58）
    领主将磨坊出租时磨坊承租人向领主缴纳固定租金。1250年，磨坊主勒瑞克（Leuric）在斯特敏斯特（Sturminster）庄园以惯例租佃条件持有一个磨坊，租金为16先令和提供若干条鳗鱼。像其他维兰一样，他拥有各种特权，如在圣诞节砍柴，参加领主的宴会，他和妻子以及他雇佣的磨坊主均可出席。他持有一个磨坊和半维尔格特土地，雇佣一个全职的磨坊主。像其他自营地雇工一样，13世纪末格拉斯顿伯里修道院的磨坊主每12周收到1夸特混合谷物的津贴，每年为4夸特2蒲式耳，以及每年6先令现金。在承租的8年间，勒瑞克获得的加工费（tollcorn）超过45夸特，绝大多数用于出售，得款6英镑12先令8便士。（59）有的小自由持有农也承租磨坊。1279年，在牛津郡的斯佩尔斯伯里（Spelsbury）庄园，科尔特姆德的威廉（William of Colthurm）是一个自由持有者，他持有一个磨坊和6英亩土地，每年缴纳20先令4便士的租金，除了参加一年两天的十户组督察外免除其他劳役。（60）从13世纪末以来，以一定年限甚至终生或几代出租磨坊的做法变得日益普遍。承租人每年支付固定租金，通常是现金，磨坊支出常常由他承担，尽管某些例外有时出现，但最常见的情况是领主仅提供维修用的木料。（61）
    领主磨坊利润的巅峰期是在13世纪至黑死病前。与1086年相比，这一时期磨坊租金经历了快速增长。1251年前伊利主教获得的大谢尔福尔（Great Shelford）庄园的水磨，1299年以每年5英镑出租，1322-1326年的租金上涨到10英镑，尽管1327年又回落到6英镑13先令4便士。即使如此，租金数量仍高于1299年的水平，并且是1086年大、小两个谢尔福尔磨坊租金的3倍。（62）13和14世纪上半叶，尽管磨坊收入在领主的租金或总收入中所占比例差别较大，但一般都达到各自的历史最高水平。北部地区领主磨坊收入一般较高，13世纪下半叶，达勒姆主教地产上的磨坊每年收到554英镑9先令4便士的租金，占其全部租金收入的1/4，或者总收入的10％。而同一时期，伍斯特主教地产磨坊在其全部租金和劳役收入中占6％，诺福克伯爵在诺福克郡、萨福克郡和埃塞克斯郡13个庄园磨坊的收入为58英镑9先令9.25便士，占其全部租金、劳役和相关支付的15％。（63）在上述利润中，水力磨坊、风力磨坊和漂洗磨的贡献各不相同。1299年伍斯特主教地产24个水力磨坊每年平均收入40先令9.5便士，2个风力磨坊每年收入各自为14先令2便士，漂洗机每年收入20先令。（64）
    黑死病后人口下降，磨坊收入急剧减少。以下降最为严重的风力磨坊为例，1342年格拉斯顿伯里修道院的沃尔顿（Walton）庄园风力磨坊的建筑支出总计为11英镑12先令11便士，租金每年3英镑。另据庄园账簿记载，该磨坊的维修费较少，1370年以前的5个年度没有提到维修费用，1370年支出2英镑购买木材。1374年前，这个磨坊的租金始终为3英镑，此后降至26先令8便士，成为磨坊利润下降和磨坊日益废弃的转折点。1380年，该磨坊再也无法找到承租人，领主支出2英镑的维修经费，1393年磨坊废弃不用。（65）中世纪末期，领主的磨坊收入进一步减少。15世纪初期伍斯特主教地产上的磨坊税收仅相当于1299年的40％-45％。（66）在修道院解散前夕，英国60个修道院的收入表明，磨坊税收仅占这些修道院世俗收入的2.25％，或者不足两个世纪前领主磨坊收入的一半。（67）