马王堆1号汉墓女尸的肝脏和直肠组织中有血吸虫卵、蛲虫和鞭虫卵，(48)一个人感染如此多的寄生虫令今人惊讶不已。马王堆1号汉墓女主人生前是贵族，其卫生条件理当优于一般百姓，当地普通人和下层民众寄生虫感染状况可想而知。相对来说，长江流域及其以南地区的寄生虫种类更多，但在黄河流域，蛔虫和蛲虫对居民的困扰也颇严重。汉代文献常见“三虫”说法，如《论衡·商虫篇》云：“人腹中有三虫……三虫食肠。”《后汉书·方术列传·华佗》谓华佗授樊阿漆叶青散，“言久服去三虫”。《神农本草经》“天门冬”和“薏苡仁”条说这两种药可杀灭“三虫”。《诸病源候论》卷一八《三虫候》对“三虫”的解释是长虫、赤虫和蛲虫。其中蛲虫与今意相同。临菑汜里女子薄吾患有严重的蛲虫感染，排出蛲虫有数升之多。(49)长虫即蛔虫，又称“蛟蛔”，是历史悠久的人体寄生虫，在舞阳贾湖新石器时期遗址中已发现此类证据。(50)现代医学观察，寄生于人体内的蛔虫一般为数十条，严重者可并发胆道蛔虫病，出现腹痛、呕吐、吐出蛔虫的症状，这与《金匮要略·趺蹶手指臂肿转筋狐疝蚘虫病脉证治》所说的“自吐蚘”的“蚘厥”，以及《素问·咳论篇》所说的“胃咳之状，咳而呕，呕甚则长虫出”相同。
    寄生虫不仅来自卫生条件，也与饮食习惯有关。秦汉人喜食生鱼生肉，使得感染包括华支睾吸虫、绦虫、蛔虫、蛲虫、鞭虫在内的寄生虫病的可能性大为提高。《金匮要略·禽兽鱼虫禁忌并治》说：“食脍，饮乳酪，令人腹中生虫”、“鲙食之，在心胸不化，吐复不出，速下除之，久成癥病”，“鲙食多，不消，结为癥病”，《龙鱼河图》说“犬、狗、鱼、鸟不熟，食之成瘕痛”，(51)正是对因生食鱼、肉而发生的寄生虫感染的经验总结。
    《三国志·魏书·管宁传》注引《魏略》云，京兆人扈累在汉献帝建安十六年(211)“三辅乱”时“入汉中”，“汉中坏”，扈累之妻“随徙民诣邺，遭疾疫丧其妇”。建安十六年“三辅乱”是指马超起兵反曹；“汉中坏”徙民指建安二十年(215)曹操平定汉中后，迁徙当地居民8万余口于邺都、洛阳。扈累之妻显然是死于建安二十二年(217)的那场影响颇大的传染病。关于这次大疫的出现季节，《三国志·魏书·武帝纪》注引《魏书》载建安二十三年(219)曹操令曰：“去冬天降疫疠，民有凋伤。”关于这次瘟疫性质，近人陈方之认为是鼠疫，且与“欧洲的发生史年代亦相符合”。戚学文也持类似说法。(52)马伯英根据文献关于这次瘟疫多出现在社会下层的记载，推测这次流行性传染病“不大可能是鼠疫”，疫源可能与贫民居住环境及野外劳作有关，大概是流行性出血热、斑疹伤寒或钩端螺旋体病。(53)李文旭、赖文、李永宸则认为此次瘟疫可能是流行性感冒。(54)鼠疫在汉代尚未出现，汉代医学文献没有类似出血热症状记录，出血热在汉代出现的可能性也不大。钩端螺旋体病可为一说。斑疹伤寒流行和流行性感冒背景和严重程度也与史载建安二十二年瘟疫有相合之处，故也存在这两种疾病爆发流行的可能。总之，较为严重的传染病的爆发流行，总能让一些女人和男人过早离开人世。
    《金匮要略·血痹虚劳病脉证并治》述说的一些症状与现代医学所说的神经衰弱类似，其中也有女性患者：“男子失精，女子梦交，桂枝加龙骨牡蛎汤主之。”《素问·阳明脉解篇》有“病甚则弃衣而走，登高而歌，或至不食数日，逾垣上屋，所上之处，皆非其素所能也”的描述近似精神分裂症或躁狂症，汉代女子中也有此类疾病。西汉后期黄门郎程伟娶方术家之女，妻子能烧银，程伟贪心不足，不断逼问烧银之术，“妻乃发狂，裸而走，以泥自涂，遂卒”。(55)这大概是长期受到刺激后引发的精神疾患。王莽时有长安狂女子名碧者呼道中曰：“高皇帝大怒，趣归我国。不者，九月必杀汝！”(56)碧可能平日听到过类似说法，在疾病发作时无意识流露出来。
    长沙走马楼吴简有一些记录精神疾患的简文(“狂病”)，包括男性4例，女性2例，余3例不明。(57)前文指出中国古代医学文献通常以“癫”和“狂”区分精神疾患，“狂”症之表现多能与精神分裂症或躁狂症相对应。走马楼吴简之“狂病”不外两种含义：或泛指精神疾患，或专指“狂”症。精神疾患与年龄和性别有程度不等的关联，如80％左右的癫痫初发年龄在20岁以前，精神分裂症的发病年龄以20-40岁居多，躁狂症的发病年龄多在16-30岁之间，前两种疾病的性别没有明显差异，躁狂症女性较多。(58)从年龄和性别上看，走马楼吴简所记录的“狂”病应是对精神疾患的泛指。
    《金匮要略·妇人杂病脉证并治》云：“妇人咽中如有炙脔”；“妇人脏躁，喜悲伤欲哭，象如神灵所作，数欠伸”。《灵枢经·忧恚无言》云：“人之卒然忧恚，而言无音者。”所谓“如有炙脔”是说感觉有而实际上并没有，“喜悲伤欲哭”说明的是精神方面障碍。这些症状与癔病相类。癔病特点是感觉异常，患者咽喉梗阻，仿佛有球形物体上下移动，实则并无躯体异常，现代精神病学称“癔病球”。此病另一个特点是患者情感反应强烈，常以夸张动作和生动表情表达体验，且伴随哭泣；或突然失音。可知汉代人已能相当真确地认知癔病的表现。
    对现代人健康造成严重威胁的肿瘤，在中国境内早期人骨鉴定中已有发现，其中的一些肿瘤发生者的性别是女性。如河南禹州瓦店龙山文化遗址一中年女性额骨上有总数10个多发性骨瘤，最大者达26×23毫米。(59)河南舞阳贾湖新石器时代遗址所见人体骨骼有多例肿瘤痕迹，其中M220成年男性胫骨上有骨瘤两个，M365青年女性右侧股骨有骨样骨瘤。(60)秦汉时期医学文献的一些描写可能反映了女性肿瘤。《灵枢经·水胀》述肠覃云：“其始生也，大如鸡卵，稍以益大。至其成也，如怀子之状，久者离岁，按之则坚，推之则移，月事以时下，此其候也。”这个表现与卵巢肿瘤相似。同篇述石瘕云：“恶血当泻不泻，衃以留止，日以益大，状如怀子，月事不以时下，皆生于女子。”其症象与子宫肿瘤相仿。