在竞选和当选总统前后，肯尼迪就反复提到古巴问题。他“明确表示我们不打算让苏联把古巴变成它在加勒比地区的基地”（11）。1961年4月，肯尼迪批准了由中央情报局训练的1453名古巴流亡者组成的突击队在猪湾侵入古巴南海岸，结果被击败并投降。这使肯尼迪总统“陷入深深的苦恼之中”（12）。人们开始怀疑肯尼迪的对外政策，把“新边疆”看成是一种冒牌货和诡计。“美国的威望在一天之内比在艾森豪威尔胆小而优柔寡断的8年中降得还要低”（13）。卡斯特罗再次肯定了与苏联的关系，并宣布，“我是一个马克思列宁主义者，而且直到我生命的最后一刻，我也将是马克思列宁主义者”（14）。猪湾失败对肯尼迪造成了强大的外在压力，要求他在国际范围内的某个地方取得成功。“当赫鲁晓夫愚蠢和莽撞地把导弹运进古巴时，他给了肯尼迪一个摊牌的机会”（15）。猪湾事件对苏联的对外政策也产生了重大影响，成了以后苏联人在古巴部署各种军备的理由。“严峻的事实使卡斯特罗和赫鲁晓夫确信--古巴处于来自美国的严重威胁之中”（16）。
    此外，肯尼迪政府从上届政府手中继承下来的外交问题也不是令人乐观的。在老挝、南越、柏林和古巴这些“第二次世界大战后出现在停战线上被打穿的”“四个关系重大的洞口”问题上（17），肯尼迪政府基本上没有取得大的进展。总之，迟至1962年秋，肯尼迪在就职近2年却继续处于一种令人困恼的境地，还远远没有在对外政策上得到一个美国公众视之为明白利落的成功（18）。这种政治处境以及民主党对即将进行的国会选举所抱的希望不容许美国遭受进一步的挫折。这就是赫鲁晓夫敢于冒险在古巴设置进攻性武器和肯尼迪敢于采取强硬立场迫使赫鲁晓夫撤出导弹的背景。
    苏联导弹运进古巴的决策分析1961年古巴导弹危机是围绕着苏联导弹运进古巴开始的，所以我们首先需要分析苏联的决策动机。
    （一）为了保卫古巴，以使古巴免遭美国进一步的侵略这一点是苏联官方所持的基本观点，也是赫鲁晓夫本人一贯的主要观点。他曾说：“我们确信美国人不会容忍古巴卡斯特罗政权的存在，他们害怕社会主义的古巴将会变成一块把其他拉美国家吸引到社会主义去的磁石，而这正是我们所希望的”（19）。这就突出了把古巴作为在拉美的社会主义广告牌的作用。而这正是美国所担心和反对的，艾德莱·史蒂文森就说，“共产主义在美洲的存在是不容谈判的”（20）。因此赫鲁晓夫认为，“我们有义务尽一切可能来保护古巴……如果我们不采取一些决定性的步骤来保卫古巴，我们很容易失去它”（21）。那么用什么办法来对付美国干涉古巴呢？他认为他在1962年5 月对保加利亚访问时“想到了在古巴装置核弹头导弹的主意”（22）。其具体想法是秘密设置，不让美国察觉，如果已装好并可发射时被美国发现，美国就不会轻举妄动，即便能毁掉一些，也不会是全部。就凭着这种一厢情愿的侥幸想法，苏联政府制定了在古巴设置中程导弹并供应可带核弹的伊尔-28型轰炸机的决策。仅仅为了保卫古巴而作出如此贸然的决策是有疑问的。为了保护古巴，苏联可以采取的措施就是把华沙条约的保证扩大到适用于古巴，但是苏联从未在国外部署过核武器。在这样离美国只有90英里的地方部署核导弹武器也不合常规。因此，保卫古巴只是导弹运进古巴决策的依据之一。
    （二）苏联试图通过在古巴设置导弹来达到与美国战略力量的平衡赫鲁晓夫承认“除了保护古巴，我们的导弹也可在达到西方所谓的‘均势’中起些作用”（23）。当时美国核力量在数量上和质量上的优势可能促使苏联出此下策。在1962年，美国拥有大约200至250枚洲际弹道导弹，苏联大约只有50-70枚。美国的北极星潜艇中还有约144枚导弹。美国有600架以上处于15分钟戒备的洲际轰炸机，苏联人只有约200架（24）。这样，为弥补洲际战略力量的不足，苏联采取了在古巴部署中近程中远程导弹的捷便办法，“事实上使苏联打击美国的能力增加了一倍”（25）。尽管如此，整个核力量对比仍然对美国有利。但是设置在古巴的这些导弹因为来自美国南面，可以逃过美国的预发警报系统，使美国在遭到袭击时的报警时间从15分钟缩短到3分钟。这些导弹的优点就是可以实施突然袭击，并把美国大部分国王纳入其可靠射程之内。由于这些导弹是缺乏伪装掩蔽易受攻击的，也只适于进行第一次打击。但这样做在战略上的好处是明显的。况且战略均势在表面上的重大变化还会对国民意志和世界领导地位这些问题产生影响，“导弹的设置必然会带来同所得的战略利益不相称的政治后果”（26）。事实上，美国后来主要的忧惧并采取强硬措施进行对抗就是因为这种表面变化带来的现实的变化。