帝国行政区划方案也通过这次帝国会议得到最终实现。马克西米利安一世皇帝和帝国各等级虽然此前就帝国行政区的划分问题达成一致，但“就行政区总督的任命权问题上却存在分歧，因此1512年所设立的帝国行政区并没有能够发挥作用”（36）。1521年的沃尔姆斯帝国议会上，查理五世皇帝和帝国各等级达成一致：整个帝国设10个行政区，帝国行政区由行政区最高长官负责。行政区最高长官由该行政区内最有地位的诸侯担任。帝国行政区执行部门受帝国侯爵的管理，在法兰肯尼亚、巴伐利亚、施瓦本、上莱茵、下莱茵和下萨克森6个行政区，每个行政区设置2名帝国侯爵、1名教会人士和1名世俗人士；在奥地利区、勃艮第区、莱茵选侯区、上萨克森区4个行政区，每个行政区设置1名帝国侯爵，负责领导行政区内的事务。此外，还授予帝国行政区协助帝国执政府执行《帝国和平条例》和《帝国最高法院条例》的权力，规定在帝国执政府遇到困难的情况下，可以通过帝国行政区来执行判决，行政区最高长官被授权对付那些破坏《帝国和平条例》的人。如果一个帝国行政区难以执行判决，就可以联合若干个行政区采取联合行动；如果5个行政区的联合行动还不能消除破坏帝国内部和平的危险举动，美茵茨选侯就应该召开帝国等级代表大会，共同决定应当采取的行动。事实证明，这种设置在保障帝国国内和平方面是有效的。（37）后来，帝国行政区还承担了征召帝国军队的重任，例如1530年和1542年，帝国行政区完成了募集对土耳其战争经费的重任；1544年，帝国军队的征集也是由行政区完成的。
    1521年的沃尔姆斯帝国议会还重新组建了“1502年被马克西米利安一世解散”（38）的帝国最高法院，各方同意以1495年帝国议会就帝国最高法院的组建方案为蓝本，并规定：除大法官外，帝国最高法院共有24名陪审法官；大法官由皇帝任命；在24名法官中，皇帝可以独自任命6名（其中4名来自他的领地，2名是精通法学的人，2名是骑士）；教会选侯和法兰肯尼亚、施瓦本和巴伐利亚行政区联合任命8名法官，他们必须是精通法学的人；世俗选侯及上莱茵、威斯特伐利亚和萨克森行政区联合任命8位骑士法官；皇帝和帝国等级联合任命2名出身为高级教士和地方领主的法官。此外，还规定：如果骑士法官没有受过大学法学教育，则至少应对法院判例有所研究并据此来判决，从而使法官们都变成了清一色的通达罗马法的专家。此外，还确定了帝国执政府和帝国最高法院的经费总额和征收办法。
    1521年的沃尔姆斯帝国议会还决定沿用“matricula”的帝国军队征召办法。在这次帝国议会上，查理五世要求各等级提供一支为期1年、包含4000名骑兵和2万名步兵的帝国军队，这支军队将和他本人的军队一起协助他完成到罗马的加冕之旅。经过讨论，帝国各等级最终同意根据“matricula”方式，由选侯和世俗侯爵、伯爵、男爵、大主教、主教、高级教士、帝国女修道院院长和帝国城市通过摊派组建这支军队。（40）而且，帝国议会还决定，必要时可以按照这样的分摊比例把帝国军队征召的数量增加到2倍、3倍或者多倍。（41）以后几个世纪，德意志帝国的军事征召就是在这个方案的基础上进行的。
    帝国议会依然召开，从1520年到1599年，每10年召开的次数依次分别为9次、3次、8次、4次、5次、3次、1次、2次。此外，帝国最高法院在16世纪后50年中审理的案件是前50年中审理案件的两倍，达到19300件之多。帝国行政区的建设也在1564年和1567年得到加强，为整个帝国的治安和反对土耳其人入侵提供了有效的军事和财政手段。帝国各等级不但慷慨缴纳帝国税，而且还要求自己的臣民也这样做。1566年还专门成立了帝国税务局，在1576年到1606年间，帝国税务局就征收到2400万古尔盾的帝国税。
    二、宗教改革运动对德意志帝国层面上国家构建的影响宗教改革运动在德意志地区的展开和发展，对德意志帝国层面上的国家构建产生了十分重大的影响。
    第一，宗教改革运动在制度构建方面并没有造成德意志帝国层面上国家构建的停滞，却使德意志帝国层面上国家构建的环境复杂化了，从而使得一些国家构建的措施难以真正得到推行，大大延缓了德意志帝国层面上国家构建的进展。
    宗教改革运动虽然使德意志的国家构建摆脱了罗马教廷的影响，但造成了德意志民族的分裂。这种分裂使得德意志的帝国构建失去了和平成长的环境。正如兰克所言：对当时的德意志帝国而言，最为重要的就是和平，只有在和平的环境下，那些还处于其发展初期的各种制度和机构才能够顺利成长，那些体现制度创新的举措才能够与帝国臣民们的习惯相符，那些很少得到认可的“服从原则”才能植根于人们的头脑中成为被人们接受的习惯。（44）虽然路德在沃尔姆斯帝国议会后被迫隐居瓦德堡，但德意志民众要求进行宗教改革的热情却没有停息。对自身生存状况及政治地位不满的骑士以支持宗教改革运动为借口，试图用武力改变整个帝国的政治结构，他们在1522年到1523年发动了“骑士暴动”（45）。深受多重压迫、并在转型过程中被完全忽略的农民，在受到路德宗教改革激励的情况下，试图通过“普通人的宗教改革”进行政治和社会改革，掀起了一场“普通人的大革命”（46）。“骑士暴动”、德国农民战争以及施瓦本同盟的镇压行动，给整个德意志地区造成了巨大的混乱，这是不利于德意志国家构建的。路德派在德意志帝国合法地位的取得也是经过国内战争（施马尔卡尔登战争以及德意志诸侯联合反对查理五世的战争）于1555年实现的；而加尔文教在德意志帝国合法性的取得则是通过国际战争（即三十年战争）于1648年才完成。从15世纪中后期就开始的帝国层面上的国家构建，直到三十年战争结束后才有了结果。