一般人认为汉军旗当时的内部组织，可能如同满洲旗一样，有固山额真、梅勒额真、甲喇额真、牛录额真等一应俱全，实际上并非如此。当年七月十八日，皇太极宣布改革兵制，去掉以将官员名字代替军队名称，“议设”每个固山额真下“两翼各设梅勒额真一员，每甲喇各设甲喇额真一员”。尽管甲喇额真名称在太祖晚期档案中就已出现，但多半是后世修吏者不慎所致，真正确立“甲喇”官职名称的时间是天聪五年七月十八日。认为汉兵六甲喇是从满洲八旗抽出来的意见是个严重错误。六甲喇是汉军旗设立的前身，开始是从李永芳、佟养性领导的“旧汉兵”中挑选熟练火器的部分汉兵，按十丁抽一组成。以佟养性为总兵官统领这“旧汉兵”。当年正月二十一日，命佟养性“凡汉人军民一切事务付尔总理”，到三月十三日，皇太极“阅新编汉兵”，证明在佟养性率领下汉人炮兵军团已经成立。这里的“新编汉兵”的兵源是“旧汉兵”，直到“汉军”正式名称出现，这“旧汉兵”与汉军旗不是一回事。但汉兵成为独立炮兵团，在清初军事史上是开天辟地的大事件。七月十八日，皇太极宣布“议设”每个固山额真下“两翼各设梅勒额真一员，每甲喇各设甲喇额真一员”。将“旧汉兵”炮兵团，按照六甲喇进行编制，仍由“总兵官佟养性管理”。可见，旧汉兵组成兵团，在六甲喇之前半年多。首任六甲喇的名单，是天聪六年正月二十一日见于史籍：“六甲喇额真副将石国柱、金玉和、高鸿中、金砺，游击李延庚，备御瞻图”。皇太极检阅新编汉兵时，是“守、战各兵分列两翼”。其中，“精兵(骑兵)额真副将石廷柱，步兵参将祝世昌”，各领一翼。从六甲喇官员状况可知，他们除石国柱有甲喇额真世职官衔外，各官实际官职分别是副将、游击和备御。六甲喇官衔是按军功和实际需要颁给敕书后的法定世袭职衔，在总兵官佟养性总理下，将抽调的旧汉兵，按照六甲喇组编而成。汉官宁完我在天聪五年十二月二十三日透露：“昨年副将高鸿中，除管家喇额真，臣曾具疏奏留”。可见，成立汉军六甲喇炮兵团，谋划于天聪四年(1630年)。所以，新编旧汉兵到甲喇官职确立，是半年时间；甲喇官职确立到六甲喇出现，即聪五年七月十八日到天聪六年正月二十一日，六甲喇名称及其具体官员名单出现，也是半年。这就不难断定甲喇官职及六甲喇都是皇太极时期的产物。
    “旧汉兵”是六甲喇的前身，继之六甲喇组织形式与“旧汉兵”内容相结合，是汉兵炮兵团继续。天聪七年(1633年)正月十二日以前只有“旧汉兵”、“汉营”、“六甲喇”等称呼，没有汉军旗之说。天聪六年二月，有“六甲喇汉军、八贝勒家发炮之人”；七年正月，有“六家喇善知炮火将官备御”；十二月有“今我国设立六部，设立书房，又分为六夹喇，八固山”(34) 等的记载都证明，六甲喇作为旧汉兵独立兵团的组织形式，并列于八贝勒、八固山，成为这一时期独立单位。因此从天聪五年正月二十一日到六年正月二十一日，是新编“旧汉兵”时期。这一年不存在汉军旗的问题，所有天聪五年汉军旗诞生的论断是个严重误解。
    3.汉军旗正名。汉军旗是在六甲喇基础上，经过扩编组织之后，成为正式“汉军”。这里所说的“汉军”并非单纯指汉人组成的军队，而是指加入旗籍的汉人军队。这个发展过程经过将近两年半时间。现在我们从六甲喇兵源、军队扩编开始研究。
    (1)旧汉兵。史称“总兵官额驸佟养性率旧汉兵”。所谓“旧汉兵”是六甲喇的基础兵源。他们来源于额驸佟养性、李永芳、石廷柱和包承先等家族和所部汉人，包括天聪三年永平等地投降的汉族大姓在内的汉人。“旧汉兵”的先驱是佟养性和李永芳的族属，朝鲜人说，李永芳的汉人为八旗“先锋”。太祖时期，佟、李两大额驸率领汉兵参战。天命六年八月，蟒古尔泰率领的“阵前攻战之四百汉人”和八年四月阿巴泰率领的“操炮汉兵八百”人，就是佟、李所部汉人，他们是“随旗行走”，并不是旗人。李永芳所部随满洲镶蓝旗，佟养性随满洲正蓝旗行走。当时称他们为“黑营”。如天命八年(1623年)二月十九日，出兵时“分编为白巴牙喇、红巴牙喇、黑营三队”。后来汉军“以黑色为旗帜”，就源于此。组编六甲喇时，以“旧汉兵”十丁抽一，即“十丁编兵一名”，共“新编汉兵马、步仅三千余”。这是六甲喇的军队基础，平均每甲喇有五百汉兵，加上总兵官“养性率兵五百”(35)，这“仅三千余”的实际兵额至多有三千五百人。“旧汉兵”名称直到“汉军”名称正式宣布，才不见于史。如天聪五年八月初七日有“总兵官佟养性率旧汉兵”，这是“旧汉兵”首次出现。十月初九日有“旧汉兵全军”。十二日有“参将祝世昌率旧汉兵一千六百人”(步兵)。十一月初十日有“佟养性率旧汉兵”，十七日有“旧汉官”。天聪六年正月二十一日有“新、旧汉官皆列坐”。天聪七年正月初一日有“旧汉官额驸佟养性、石廷柱等。新汉官马光远、麻登云、祖泽润等”。这五个月主要出现的是“旧汉兵”和“旧汉官”。同时，也出现“新汉官”。我们将进一步研究。
    (2)新汉兵。前文的“新编汉兵”是指“旧汉兵”团诞生的行为。现在所讲的“新汉兵”是指在六甲喇基础上新编入的大凌河投降的汉族官兵。大凌河投降官兵受到皇太极高度重视，进行过两次安置。开始时，将投降官员“分与各旗，每旗四员，暂行抚养”。天聪六年正月，皇太极考虑到“若归公中抚养，各官必受劳苦”，于是决定将各官“均分隶八旗”，所属汉民各“取之半”。这样，分隶正黄旗的是副将祖可法、祖泽润、祖泽洪男丁各50人，参将姜新、游击方一元各10人，姜奎2人，计172人。分隶镶黄旗的是副将韩大勋男丁50人，参将盛忠15人，游击李明时、陈变武、张怀良各10人，计95人。分隶正红旗的是副将刘天禄男丁50人、杨华征20人，参将张廉15人，游击吴奉成10人，计95人。分隶镶红旗的是副将孙定辽男丁50人，参将段学礼15人，游击涂应乾、刘武元各10人，计85人。分隶正蓝旗的是副将邓长春男丁40人、薛大湖20人，参将吴良辅15人，游击李一洪10人，计85人。分隶镶蓝旗的是副将张存仁男丁50人、陈邦选40人，参将高光辉15人，游击方献可10人，计115人。分隶镶白旗的是副将张洪谟男丁50人、李云40人，参将韩栋50人，游击刘良臣10人，计150人。分隶正白旗的是副将曹恭诚、裴国珍男丁各50人，参将刘士英15人，游击胡弘先10人，计125人。八旗总共副将15名，参将7名，游击9名，兵丁922名，分隶满洲八旗。这些分隶八旗的大凌河官兵，是随满洲旗行走，不是加入旗籍。
    天聪七年(1633年)正月，根据文馆汉官建议，从汉族官兵中“收选新、旧汉官备御及永平、大凌河炮手”，共计“二百余人”，皆“着落六家喇善知炮火将官备御定名管领”，即加入六甲喇为“新汉兵”(36)。大凌河官兵加入六甲喇的方式是，按户混编在“旧汉兵”中，以李永芳家族为例，嘉庆年间除本家族、亲戚、陪嫁公主人员、内务府及郡王府包衣等后裔外，值得注意的是有张七十等“三族，系民炮手入于旗下”。这是“旧汉兵”的重新组合，此外有“另户孔之璜一族，系大凌河人”(37)。显然，这是新、旧汉兵混编的证据。