诚然，《南北史》是有缺点的，但不是上述按世系编次列传之类。《南北史》的缺点，除了一般封建史书所固有的之外，突出的有如下三端：其一，是对“八书”删削过多，确实删掉了一些很有价值的史料。在删节过程中，有时由于疏忽，又造成文义不明，甚至史实错误。如将北周大臣尉迟迥、尉迟纲，减字省文为“尉迥”、“尉纲”之类。所载史料不如“八书”丰满，这是《南北史》不能取代“八书”的一个原因。其二，李延寿好述神怪。《南北史》中对符瑞谣谶、神奇故事的记述，层见叠出。其中有的是因袭“八书”，有的则是李延寿所特意增补，致使《南北史》的迷信色彩甚为浓厚。这是李延寿唯心史观的突出表现。其三，“延寿似未通南北朝官制，故诸传删省，多未得其要领”（29）。官名为专有名词，有其特定含义，宜据实书写，以反映当时官制。而李延寿为求文字简省，对官名亦作减字省句，致使失实而不明妥。此点钱大昕《廿二史考异》言之甚详，不复赘述。盖延寿精力集中于南北诸朝历史的会总贯通上，遂不暇对名物制度深加考据欤？
    注释：
    ①唐刘知几《史通》卷12《古今正史》。
    ②《北史》卷100《序传》。
    ③司马光《资治通鉴》卷198《唐纪·贞观21年》。
    ④《北史》卷93《僭伪附庸传·序》。
    ⑤《北史》卷93《僭伪附庸传·序》。
    ⑥《四库全书总目》卷66《史部·载记类·序》。
    ⑦《北史》卷100《序传》。
    ⑧《北史》卷100《序传》。
    ⑨《北史》卷100《序传》。
    ⑩赵翼《廿二史札记》卷13《南北史两国交兵不详载》条。
    （11）刘知几《史通》卷5《因习》。
    （12）郭沫若《序重印崖州志》。
    （13）赵翼《廿二史札记》卷13《南北史两国交兵不详载》条。
    （14）《南史》卷77《恩倖传·茹法亮》。
    （15）《北史》卷100《序传》。
    （16）刘知几《史通》卷10《杂述》。
    （17）鲁迅《华盖集·忽然想到》。
    （18）刘知几《史通》卷10《杂述》。
    （19）赵翼《廿二史札记》卷9《八朝史至宋始行》条。
    （20）刘知几《史通》卷11《史官建置》。
    （21）《全唐文》卷355赵匡《选举议》。
    （22）《温国文正司马公集》卷62《与刘道原书》。
    （23）王鸣盛《十七史商榷》卷53《新唐书过誉南北史》条。
    （24）王鸣盛《十七史商榷》卷59《以家为限断不以代为限断》条。
    （25）章学诚《文史通义》内篇四《申郑》。
    （26）《南史》卷1《宋本纪上》。
    （27）《南史》卷20《谢朏传》。
    （28）赵翼《廿二史札记》卷8、卷12。
    （29）钱大昕《廿二史考异》卷36。