当然，在博学深思之际，也不是没有“失眼”的。杨向奎先生就指出过几处，其一是批评：“万季野关于《古文尚书》的三篇考证，已在阎百诗《古文尚书疏证》后，他还是认为《古文尚书》不伪。”（48）同样，我们也能举出几条具体差错，这是不一一例举。
    综上所述，布衣万斯同把毕生心血献给祖国的史学事业，蔚然成为中国封建社会里正统史家中最后一群翘翘者之一；而在二十四史中，完全以在野之身，独当一面，超逸群伦，埋首于一史的修纂，惟他一人而已。这正如黄宗羲所深许的：“四方声价归明水，一代贤奸托布衣。”至于他整个道德文章，则名彪汗青，泽惠后世，被赞为：“学者尊之如泰山北斗，亲之如光风霁月。”（49）
    注释：
    ①②⑤⑦（14）《四明丛书》第四集《石园文集》刘坊《万季野先生行状》
    ③万斯同《石园文集》卷五《跋先世敕命后》
    ④⑧黄宗羲《南雷文定》前集卷六《万悔庵先生墓志铭》
    ⑥《石园文集》卷八《逸老堂记》
    ⑨（11）同上书卷一《述旧》诗
    ⑩（17）（31）全祖望《鲒埼亭集》卷二十八《万贞文先生传》
    （12）张寿镛《四明丛书》第四集《石园文集序》
    （13）李文胤《杲堂文钞》卷三《送万季野授经会稽序》
    （15）徐时栋光绪《鄞县志》卷四十一《人物传》十六《万斯同》
    （16）（49）曹秉仁雍正《宁波府志》卷二十五《儒林·万斯同》
    （17）《清史稿》卷二七一《徐乾学传》
    （18）（27）（45）《方苞集》卷十二《万季野墓表》
    （19）《杲堂文钞》卷二《万季野新乐府序》
    （20）（38）《石园文集》卷七《与从子贞一书》
    （21）《杲堂文钞》卷一《历代史表序》
    （22）朱彝尊《历代史表序》
    （23）《四库全书提要》《儒林宗派》条
    （24）《石园文集》卷七《寄范笔山书》
    （25）《清史稿》卷四八四《文苑一·彭孙遹传》
    （26）《清史稿》卷二五○《徐元文传》
    （28）《南雷文定》前集卷六《次公董公墓志铭》
    （29）黄宗羲《南雷诗历》卷二《送万季野、贞一北上》
    （30）《石园文集》杨无咎《万季野先生墓志铭》
    （32）《清朝野史大观》卷九《清朝艺苑》
    （33）梁启超《中国近三百年学术史》第八《清初史学之建设》
    （34）陈清泉等编《中国史学家评传》中册第895页阁清、葛增福《王鸿绪》
    （35）（46）《石园文集》卷七《读洪武实录》
    （36）张廷玉《呈进明史表》
    （37）《清史稿》卷二七一《王鸿绪传》
    （39）阮元《经史问答序》
    （40）（41）万斯同《宋季忠义录》卷一《恭帝本纪》、卷二《端宗、末帝本纪》
    （42）（43）香港《大公报》1988年5月7日方祖猷《万斯同修明史》
    （44）钱大昕《潜研堂文集》卷三八《万先生斯同传》
    （47）《石园文集》卷七《读弘治实录》
    （48）《中国史学家评传》中册第880页杨向奎《万斯同》