印尼对华人的国籍政策，对华人的生存与发展有着重大的影响。
    战后初期，印尼刚独立，政府为了利用华人的资金技术和人才发展民族经济，放松了华人加入印尼籍的条件， 当时接受印尼籍的华人仅100万，还有100万人是中国籍或无国籍者。
    50年代中期，政府为了限制华人在各个领域的发展，颁布国籍法，限制华人取得印尼籍。此外，中国和印尼两国政府于1955年签订双重国籍条约，到1960年12月25日才生效，规定拥有双重国籍的华人必须在2年内选择印尼籍或中国籍，尽管有种种限制，当时有80万华人选择了印尼籍。
    苏哈托总统执政后，1969年印尼单方面废除了双重国籍条约，凡是要加入印尼籍的华人都要办归化手续。由于手续繁杂，费用昂贵，华人难于入籍。
    1980年苏哈托总统签署了关于国籍问题的2号法令和13号决定书， 简化和加速华人加入印尼籍，为恢复中印（尼）两国外交关系作准备。到1981年7月止，又有80万华人加入印籍。 仍保留中国籍和无国籍的华人剩下30万人，仅占华人总数600万的5%。
    据印尼《印度尼西亚日报》1990年11月1日报道，印尼仍有30 万华人的国籍身份未明，印尼内政部表示要与中国大使馆合作，加速解决印尼上述华人的国籍问题。
    另据中国与印尼两国政府1992 年5 月4 日签署的谅解备忘录， 因1959年受印尼总统10号法令返国未成而滞留印尼、国籍身份未明的华人，1993年给予重新登记，中国大使馆将发给中国公民护照。据统计，当时有14万华人已获返国准字，但只有4万人起程，仍有10万人未返国。〔1〕
    移民政策
    苏哈托总统执政后，采取了严厉禁止移民的政策。1967年6月7日公布《解决华人问题的基本政策》，第一章“中国侨民”明确指出：“原则上，印尼不再发准证予新的华人移民。不在此例的是在执行任务的外交人员及其家属，专家及他们合法的家眷（包括未成年的子女）。”
    印尼政府严禁非法移民入境，经常追查、拘捕从香港和中国内地伪造证件入境的非法移民，一经查出即加以监禁或驱逐出境。
    到1988年，印尼当局曾准许在印尼出生的香港印尼归侨返回印尼定居，条件是：“出6万港元可买到一张外侨证，限期一年。 一年到期后可延长一年，付1000港元。延长七次，到1995年住满七年，可入印尼籍，成为印尼公民。”〔2〕
    1990年中印（尼）复交后，中国内地非法移居印尼的人数不断增加，尤其以福建一些地区的非法移民为甚。印尼政府对非法移居者高度警惕，采取了严格限制措施。对中国内地往印尼探亲、旅游者，应由中国九大旅行社之一、印尼亲属和印尼旅行社三重担保。若发生非法移居者，他们要承担责任。
    另外，有一些中国公民以技术人员身份劳务输出到印尼，可居留一年。每年办证延长居留一年，连续居留五年者可获印尼公民权。
    经济政策
    苏哈托政府执政后，认识到了利用华人资本及其经营管理经验发展印尼经济的重要性，对华人经济采取了利用为主，限制为辅的政策。
    （1）1967年初，政府颁布《外国投资法》，鼓励外资企业与国内企业联合经营，规定凡投资250美元以上的企业，可免交所得税两年， 不限制投资者将利润汇寄国外。以美、日为主的外资迅速涌向印尼，乐于同华人企业联合经营。这一法令大大促进了华人经济的发展。
    （2）1968年7月，政府颁布了《国内投资法》，决定利用印尼本土所积累起来的资金发展民族经济。法令规定企业分为民族企业和外资企业两种，民族企业指印尼公民拥有51%股份的企业，未达到标准的称为外资企业，促使华人资本向工业领域转移。
    （3）1967年6月7日苏哈托总统签署了《解决华人问题的基本政策》的第37号法令，法令中指出：“与1967年第1 号法令所规定的‘外资’不同，在印尼本土累积起来的财富被列为‘国内外侨资金’。此资金实际上是在外侨手中的印尼民族财富，因此有必要加以动员，并且利用在发展与建设方面。”