同时，江南连续不断的反元斗争和南士的消极抵制也使元廷意识到，必须改善其统治方式，整饬吏治，笼络更多南士与之合作。忽必烈任命了一些文臣到江南，担任行御史台、按察司（廉访司）或州县官，如夹谷之奇、崔彧、张孔孙、张之翰、刘宣、魏初、王恽、胡祗遹等，这些人都有儒学素养，能兴学重士，保护其利益（如上述何梦桂受县尹凌辱，时任浙西按察司佥事的夹谷之奇得悉后即惩办了县尹），并多所荐拔，改善了元朝的形象及其与南士的关系。忽必烈还多次派人到江南搜求"好秀才"，先后吸纳了不少南士充任朝廷或地方官员。当这些人受到举荐，就有友朋作诗文祝贺，如方逢振因程钜夫举荐被授为淮西按察司佥事（未赴官）时，其友作诗贺之，有"春风吹喜自天来"，"庙堂正要栋梁才"之句；[79]赵孟頫应荐仕元，后出任江浙儒学提举，连退隐不仕的老资格故官牟谳也赠诗称道其才华和仕途显达。[80]可见元廷求贤江南之举对南士态度的改变发生了一定影响。
    对南士思想、态度变化起主要作用的当是尊儒重学和优待儒士政策的逐步实施。忽必烈早在潜邸时代就对儒学在汉地统治中的作用有所认识，即位后，"遵用汉法"建国立制，更需标榜"尊儒"以支持其作为中原正统皇朝继承者的地位。中统二年（1261），即诏立诸路提举学校官，兴复各地庙学；灭宋后，这一制度也推行于江南，南宋原有的学校和学田按政策均予保留。但战乱之后，各地学校受到不同程度的破坏，其兴复经历了曲折反复过程。至元十九年（1282），发生了浙东宣慰使石国秀等动议将江东、西和浙东、西四道学田十分之八献纳归官事件；次年，经御史中丞崔彧力陈利害，元廷下令将江南瞻学田粮仍归学校，用于春秋释奠、修茸祠庙、学官请俸、生员食供，以及养瞻耆宿名儒。[81]二十五年，桑哥又奏准将江南贡士庄田粮及有余的瞻学田粮尽数起解大都，遂遣官到各路"理算"，苦害儒生，以致学校遭破坏，一些学官被逼自杀；二十九年，元廷再次改正，将瞻学田粮"分付庙学依旧为主"，供给上述诸项用度，官司不必理问。[82]这两次关系江南儒学大局问题的处理，对各地学校的兴复起了很大作用，达到了崔彧所说"以美风化，以收士心"的一定效果，其间许多南士著文作诗，赞颂官府兴修学校、保护学田的德政，即可说明这一点。至元三十一年，成宗即位，不仅登位诏条内有一款专谕官府重视学校，还特别发布了"崇奉孔子"诏书，故有学者指出："元代实行尊孔崇儒，实际上是从成宗时才真正开始。"[83]也可以说，元朝的"尊儒"政策在世祖时期经过曲折发展，到成宗初始臻于确立。我们注意到，江南士人对元朝的态度也是在至元末和元贞间发生了很明显变化，表征之一就是许多坚持不仕元，为文"但书甲子"的南士，在这几年中大多先后采用了元朝年号。
    元朝对江南士人的优待政策，主要是儒户定籍和差役优免问题，也是经过了十余年的曲折过程才确定下来。灭宋后初置的归附人户籍册，只是根据坊里正的草草攒报汇集而成，不仅不全（淮东、西和浙东等处别无报省籍册），且所报儒户多有混乱、缺名者，实非儒籍，宋进士、举人、著名学者等多不在内。至元十八年浙西儒学提举叶李设置了儒籍，二十四年各道儒学提举司又分别置有儒户册（据各州县学官所报在学人员），十分混乱，其间多有富户冒入儒籍以规避差役，而真正的士人却未能入籍者。如上文所述，有不少儒士受役破家。至元二十七年，元朝对南宋旧境户口进行全面的重新抄籍，关于儒户，抄户局按尚书省指示只据归附初籍册查对，凡此后续收的一律籍入当差民户，而不理采抄户中儒户所具手状（理由是"江南秀才甚多，真伪难辨"）。因原籍混乱，查同者杭州九县四司只99户，信州一路只4户，贵德一路只2户，可见绝大多数儒士被"收系当差"。二十八年，因上诉者多，先后两次放宽，认定叶李所籍和二十四年各道儒学提举所置册上有的，可权作儒户抄数；但还有不少儒士被排除在外，于是最后决定按抄户中儒户所具手状核实后入籍。[84]萧启庆教授据现有不完全资料推算，定籍的江南儒户最高估计可能达到总户数的0.85%，约十万左右，如此则足可容纳南宋所有的科第之家了。定籍儒户可享受与佛、道、医等户同样的免除科差杂役待遇，虽然定籍后一两年内有些地方官府还照旧将儒户与民一体当差，但因有籍可依，经申诉得以改正。总之，到至元末，儒户的免役待遇大体得到落实。[85]此外，虽然当时不行科举，断了南士的登龙之望，但元朝也为儒人开了两条常川的入仕途径："岁贡儒吏"和充任教官；按规定的岁贡儒吏名额，"在数量上说，并不亚于宋金的科举。"[86]
    尊儒重学和优待儒户政策的实施对江南士人思想态度的变化起了很大作用。刘辰翁在《临江军新喻县学重修大成殿记》中赞扬江西廉访使的德政，"既定先圣弟子籍百又二十人，复其终身，常调不征，县旌别有加，命修学。"接着说了一通道理："儒道即君道，尧言、尧行即尧，夫子言、夫子行即夫子"，"干戈溃乱之出于宇宙，如雷霆风雨，危不可处，而天体霁然，不待明日光复其旧，必归于礼乐、性情、道德"等等；[87]舒岳祥在《宁海县学记》中也写道："皇帝既一南北，郡百蛮，乃尊孔氏，隆儒术，阐文治也。……凡有籍于学者，皆得免徭役；士无科举之累而务问学之实，郡岁贡一士……"并谓"自古一统天下之主，未有不尊孔氏、隆儒术也。"[88]看来，南士们在尊儒重士上找到了"认同"元朝的依据，承认元朝也是遵循古圣先王之道、合乎天理的正统之主。同时，元朝实现了分隔甚久的南北中国的统一，使南士得以纵游齐鲁燕赵，观览中原风物，一偿宿愿。按照能一天下者即可为正统的观点，也是"认同"元朝的一个方面。[89]