从《明史》这段记载可知，喃加巴藏卜的来朝，使明朝初年对整个藏族地区的经略有了实质性变化，使明朝对乌思藏等藏区的行政建置初具规模。喃加巴藏卜偕同一批乌思藏过去接受元朝封敕国公、司徒等的上层人物一起入贡朝觐。他们一方面表示忠心归顺，同时也请求朝廷给他们封敕新的官职。于是明朝廷依从喃加巴藏卜等人的举荐，将其所举荐的六十人分别授予不同级别的官职。至此原来的元代的行政区划如吐蕃等路宣慰使司都元帅府、乌斯藏纳里速古鲁孙等三路宣慰使司都元帅府也自行取消，代之以明朝的行政建置：乌斯藏卫指挥使司和朵甘卫指挥使司，下面还设有两个宣慰司、一个元帅府、四个招讨司、十三个万户府、四个千户所等。但文献记载只有这些行政建置的数字，没有详记其具体治所在什么地方。看来明初在藏区建置方面，地方最高一级由元时的宣慰使司都元帅府改为卫指挥使司，一部分基层机构还沿用元代的名称。卫指挥使司一级的职官名称是指挥使、指挥同知、佥事等。喃加巴藏卜所举荐的六十人分别被授予指挥同知、佥事及宣慰使、同知、副使、元帅、招讨、万户等职位。
    洪武六年一次就封授乌斯藏和朵甘思六十人以各种官职，使明朝奉行的“广行招谕”的治藏政策大见成效，但还有相当一部分更偏远地区的藏区首领没有归附，朝廷的招抚工作还在继续。明太祖以此次封授为契机，进一步颁敕诏命，希望广大藏区的各部首领一一来朝归附。《明实录》载：
    “（上）仍遣诏谕朵甘、乌思藏等处曰：‘我国家受天明命，统驭万方，恩抚善良，武威不服，凡在幅员之内，咸推一视同仁。近者摄帝师喃加巴藏卜以所举乌思藏、朵甘思地面故元国公、司徒、各宣慰司、招讨司、元帅府、万户、千户等官，自远来朝，陈请职名，以安各族。朕嘉其诚达天命，慕义来庭，不劳师旅之征，俱效职方之贡，宜从所请，以绥远人。”[10]
    喃加巴藏卜以故元摄帝师身份来朝，明太祖对喃加巴藏卜隆重封赏，封其为“炽盛佛宝国师”，赐给玉印。明太祖对封赏之事十分重视，甚至亲自过问督办刻造玉印之事，“初，玉人造赐喃迦巴藏卜印即成，以进，上观其玉未美，亟命工易之”，直到工艺达到完美要求。明太祖虽对喃加巴藏卜优礼有加，但并未仿效元朝宫廷授给帝师那种至高无比的地位。喃加巴藏卜受封国师，标志着元朝帝师制度的正式废止。
    喃加巴藏卜朝觐结束后，朝廷一方面派人护送他返归乌斯（恩）藏，同时也是随同这些受封的地方首领进一步招抚未归附的各部首领。至洪武八年初，炽盛佛宝国师喃加巴藏卜及朵甘行都指挥同知锁南兀即尔等再次来朝，再次奏举地方土官赏竺监藏等五十六人。明朝廷为安排这第二批前来归附的藏区头人，又增设了一些新的行政建置：
    “诏增置朵甘思宣慰司及诏讨等司。诏讨司六：曰朵甘思、曰朵甘笼答、曰朵甘丹、曰朵甘仓溏、曰朵甘川、曰磨儿朵甘勘。万户府四：曰沙儿可、曰乃竹、曰罗思端、曰刊思麻。千户所十七：曰朵甘司、曰剌宗、曰孛里加、曰长河西、曰朵甘思多八参孙等处、曰加巴、曰兆日、曰纳竹、曰伦答、曰沙里可哈思的、曰勃里加思东、曰果由、曰参卜郎、曰剌错牙、曰泄里坝、曰阔侧鲁孙、曰撒里土儿干。”[11]
    对喃加巴藏卜所举荐的五十六位头人也都封授任命以各种地方官职：
    “以赏竹监藏等七人为朵甘都指挥同知，南哥思丹八亦监藏等三人为乌思藏都指挥司同知，星吉监藏等十一人为朵甘宣慰司使，川搠藏卜等八人为朵甘思等六招讨司官，管者藏卜等五人为沙儿可等万户府万户，管卜儿监藏等十八人为朵甘思等一十七千户所千户，速令一人为伦卜卒曰四族都管，监藏令占等三人为朵甘巡检司巡检。”
    明所设置的地方行政区划名称仍然沿袭宣慰司、招讨司、万户及千户等元代的旧有名称，但也有少量的官职及区划名称有所更改，例如将元代的“伦卜卒”改为“四族”；“达鲁花赤”改为“都管”；朵甘“捕盗司”为“巡检司”。
    朝廷对所封授的五十六人分别颁敕诰书和印信之物，同时还分别赏赐衣帽等物品，并派遣朝廷使臣许允德前往各地将诰印等赐予受封者。诰书文本上说：
    “朕受天明命，君主华夷。凡诸施设，期在安民。是以四夷之长，有能抚其众而悦天心者，莫不因其慕义，与之爵赏，以福斯民。曩者，西番效顺，为置乌思藏行都指挥使司，以官其长，使绥镇一方，安辑众庶。今复遣使修贡请官。朕如其请，特以赏竺监藏等为某官，尔其恪修厥职，毋怠。”[11]
    诰书中明确了朝廷在藏区设官建置的要旨，即是让这些地方首领“绥镇一方，安辑众庶”，同时要求他们恪尽职守，不得怠慢。
    洪武八年对藏区五十六位首领的敕封较两年前更加明确，见于记录的六个招讨司都有确切地点、名称，其中五个都带有“朵甘”字样：“朵甘思”、“朵甘笼答”、“朵甘仓溏”、“朵甘丹”及“朵甘川”。据考证，“朵甘丹”招讨司应在今四川甘孜藏族自治州邓柯县一带，“磨儿勘”招讨司应在今巴塘县以西及西藏自治区芒康县境；此外，万户府有四个，千户所有十七个，也都有确定的地点、名称，但其中绝大多数的准确地望都难以考定。看起来，这片地区大体上相当于元代吐蕃等路宣慰使司都元帅府的辖境，大致相当于今天四川省甘孜藏族自治州金沙江东西两岸地带。
    3.章阳沙加来朝
    随着甘、青藏族地区的归附，明朝的影响进一步深入到朵甘思、乌思藏地区。当时乌思藏地区最大的两股政治势力：一是正在兴盛的帕木竹巴政权；二是虽日渐衰落，但仍具相当大实力的萨迦政权。前面所叙述的故元摄帝师喃加巴藏卜应是萨迦政权派系的代表人物。而帕木竹巴政权当时是大司徒绛曲坚赞的侄子释迦坚赞（《明实录》作章阳沙加）任第悉，他曾被元朝封为灌顶国师。明朝经略乌思藏地区，尽快招抚帕木竹巴僧俗首领来朝归附具有举足轻重的意义。
    早在洪武五年，朝廷略定河州地区以后，就从河州藏族首领那里得知有关章阳沙加监藏的情况。
    河州卫言：“乌思藏帕木竹巴故元灌顶国师章阳沙加，人所信服。今朵甘赏竺监藏与管兀儿相仇杀，朝廷若以章阳沙加招抚之，则朵甘必内附矣。”[36]
    当中书省官员把这一重要信息禀奏朝廷，朝廷十分重视，知道不仅帕木竹巴势力强大，而且其首领章阳沙加监藏在乌思藏及朵甘地区颇有影响。明太祖立即颁敕诏书，继续封章阳沙加为灌顶国师名号，特制玉印，并且派遣特使前往乌思藏送去玉印，这是明朝建立后派行人入藏赐予印信的第一次，由此看出朝廷对当时藏区影响最大的地方实力集团帕木竹巴的另眼相看。朝廷的诚信礼遇使章阳沙加监藏表示倾心归附朝廷，第二年，即洪武六年，章阳沙加监藏派遣帕竹的一个名叫锁南藏卜的酋长为使者携佛像、经典、佛舍利等物品来朝廷入贡，接受了新的君臣隶属关系。章阳沙加监藏不久去世，他的侄子札巴绛曲监藏（《明史》译作吉剌思巴赏竺藏）继任帕竹首领，对于新上任的首领，朝廷也没有慢待，特意让来朝返藏的喃加巴藏卜等人带去朝廷赏赐的文绮等礼物，札巴绛曲监藏也于洪武八年初遣使“进表及方物”，明朝也沿袭元朝旧制，恢复帕木竹巴万户府的地位。