英国占据尼泊尔后，又于1848、年至1860年之间出兵进攻哲孟雄（锡金），占其首府通朗(Toom long)。1861年3月29日，哲孟雄王被迫与东印度公司代表谈判，签署了一个使哲孟雄受英人控制又丧权辱国的《通朗条约》。英国由此打通了进入西藏的哲孟雄大门。清朝政府及其驻藏大臣对于英国在喜马拉雅诸山国的侵略活动，竟然无动于衷。英军入侵哲孟雄时，其王向驻藏大臣求救，驻藏大臣仅派一名委员前往江孜“探查”，不派一兵一卒援助，拱手将藩属哲孟雄让与英人，使之成为侵略不丹与西藏的桥头堡。
    不丹（史称“布鲁克巴”）为清朝的“藩属国”。从1841年开始，英国东印度公司派兵逐渐侵占不丹领土。1863年12月，英印总督派遣艾登赴不丹谈判，双方签署一个条约。条约规定英国归还所占不丹全部土地，今后互不侵犯等条款。然而不久，英印政府立即变卦，撕毁条约。在1864年9月至1865年之间英印政府又派兵侵入不丹，1865年11月，不丹被迫与英在新曲拉签订不平等条约十款。不丹由此失地丧权，逐步沦为英国控制下的一个属地，成为其侵略中国西藏的又一基地。
    驻藏大臣景纹等在（《新曲拉条约》）签订后，才于1866年初，以检阅“春操”为名赶到边境帕里，遵照清廷谕令，“不动声色，将各隘口密为防范”，“俾两解释旧怨，敛兵回巢，永息争端”。（注：《景纹驻藏奏稿》第43页。）就这样，到19世纪中叶，英国逐步控制了属于清朝“藩属”的喜马拉雅诸山国，形成了对西藏的包围。
    在中国西藏发生的这一严峻形势，直到1877年（光绪三年）才引起清朝统治者内部一些人的注意。四川总督丁宝桢上奏称：“英既占东南中三印度之半，窥伺后藏久矣。从前为布鲁克巴、廓尔喀之中界，哲孟雄部大山所阻，山极险峻，中通一线。道光年间，哲孟雄属于英，此山已为英所据……彼若此时将山开凿，即可长驱入藏。幸尚有布鲁克巴、廓尔喀界连前后藏足为我藩篱……今若不将布、廓两国极力笼络，英人必设法相与连合，则西藏一无屏蔽，而川省门户遂失……此时若将廓尔喀厚为羁縻，而密饬驻藏大臣，设法修好布鲁克巴，阴为外助，则自可以伐英人入藏之谋，此必然之势”。（注：《清季筹藏奏牍》第一辑，《丁宝桢奏牍》第3～4页。）但清朝政府的腐朽，自顾无暇，已经无力去保护其藩属的喜马拉雅诸山国了。
    （三）清政府被动应对廓尔喀入侵西藏的事件
    1850年，中国爆发的太平天国革命运动给清朝以沉重的打击。此时，依附于英国执掌了廓尔喀政权的忠格·巴哈杜尔看到清朝政府顾及不上西藏地方，遂于1852年在西藏边境樟木制造边界冲突，强行索要我边境樟木铁索桥附近樟木曲河外记尔巴及甲玉两地。
    驻藏大臣穆腾额等竟然奏请“将此二处地方嗣后归廓尔喀管理，以息争端。”（注：《清代藏事辑要》（一），第461～462页。）1854年（咸丰四年）初，廓尔喀国王向清廷呈递表文，提出派兵协助清朝攻打太平军。驻藏大臣谆龄一再延搁，未能及时将清廷拒绝廓尔喀派军“助剿”的上谕通知廓尔喀。廓尔喀藉口本国已动用军队“助剿”，军费无所出，“要唐古忒（西藏）代赔”；又指责西藏营官“不遵旧章征收税课，及欺负抢劫、伤毙该国民人等事”。（注：《清文宗实录》卷155。）同年3月和4月间，廓尔喀派遣军队数千侵入西藏，将吉隆和聂拉木两地占领。不久又侵占了宗喀（今吉隆）。
    清朝得奏，急令驻藏大臣赫特贺亲往后藏边境察看动静，要廓尔喀撤兵。同时清朝调动昌都、类乌齐等处兵士，并急调四川屯兵三千入藏。驻藏大臣赫特贺到达后藏协噶尔（今定日）时，闻廓尔喀继续进兵，相继攻占了补仁（今普兰）和绒辖（今定结）两地。在协噶尔赫特贺与廓尔喀官员进行“剖断”，议定将多收税米、阻挡商民及杀伤抢劫各案，“从分断，令唐古忒赔缴银一万五千余两”。廓尔喀官员亦称“所断极公”，然而却不肯“出具遵断图记”，也不退回所占5处中国西藏地方。（注：咸丰五年（1855年）五月十六日，“赫特贺奏报廓尔喀复占边地拟定断牌八款饬令遵断撤兵情形折”，见《一史馆藏军机处录副奏折》。）清朝鉴于廓尔喀不愿退还其侵占的中国西藏领土，决定再抽调四川、湖北等处军队赴藏。然而，因受太平军牵制，实难抽调川、鄂两省兵力入藏，甚至原调川军三千屯兵入藏，实际上也没有进藏。廓尔喀的入侵，激起了西藏军民的愤恨，西藏地方在噶伦的率领下，经过战斗从廓尔喀手中夺回了聂拉木附近的帕嘉岭，歼敌数百名。清朝闻报后，即从四川拨银五六万两以为“犒赏之需”，还调熟悉西藏事务的官员入藏协助。1854年底，藏军收复聂拉木，攻破宗喀外城，廓尔喀军队遭到重创。
    此后，廓尔喀军于1856年（咸丰六年）初又分两路进攻聂拉木和宗喀，将聂拉木再次占据。清廷又调派前藏僧俗官兵2000名赴通拉山（今定日西南）策垫军营。廓尔喀见清廷陆续增兵，加上天气严寒，于己不利，故要求和谈。清朝遂令驻藏大臣派遣西藏地方官员与廓尔喀议和。同年3月，双方终于签订了一个十款和约。清廷最终也居然批准这一条约。（注：该约内容共十款，主要内容包括：西藏年付廓尔喀馈金一万卢比。对廓尔喀商民，西藏不抽商税、路税及他项税捐。西藏和廓尔喀互相归还所俘人员和所劫财物。廓尔喀撤走布朗、绒辖、吉隆、宗喀、聂拉木、达尔结岭、拉孜各地的驻兵。廓尔喀派高级官员一员驻拉萨。廓尔喀准在拉萨开设店铺，任便售买各种物品。拉萨辖区内廓尔喀商民或加德满都回民如有争执，不容西藏官员审讯；西藏民人与廓尔喀民人如有争执，两方官员会同审讯；西藏民人罚款，归西藏官员，廓尔喀商民及回民罚款，归廓尔喀官员。双方应互交逃犯。西藏民人劫夺廓尔喀商民财产，西藏官员应予查究，责令归还原主。倘该犯不能归还原物，西藏官员令其立下甘结，限期偿还。廓尔喀民人劫夺西藏商民财产，廓尔喀官员应予查究，责令归还原主。倘该犯不能归还原物，廓尔喀官员应令其立下甘结，限期偿还。）
    这一条约是不平等的，西藏每年付与廓尔喀“馈金一万卢比”，这是廓尔喀统治者对西藏的勒索。该约之签订，使廓尔喀商民在西藏不抽商税的情况下可以任意开设店铺，买卖各种物品。从此廓尔喀商民为谋取商业利益大量进入西藏。廓尔喀高级官员驻拉萨，维护本国的利益，侦察西藏动静，留下了隐患。事实上，廓尔喀已沦为英国的附庸，成为英国侵略我西藏及喜马拉雅诸山国的帮凶。廓尔喀入侵西藏，实际上是近代英国执行侵略亚洲各国、挑拨它们之间关系之政策产生的恶果之一。
    （四）清朝处置森巴入侵西藏及所谓英国划界西藏、拉达克问题
    清朝政府的腐败与无能又一次表现在丧失我西藏领土拉达克的问题上。拉达克自古就是中国西藏地方所管辖的一部分领土。18世纪60年代，邻近西藏拉达克的克什米尔处于阿富汗杜兰尼族的统治之下，1819年克什米尔南查谟(Jamma)多格拉族（藏人称“森巴”）统治者古拉伯·辛格(Gulab Singh)帮助锡克人夺取了克什米尔等地，锡克人就让他当上了查谟土邦的总督，附属于锡克王国。