袁树勋根据局外条规中允许战国兵船修补损伤的规定，不赞同日本和外务部提出的“拆卸”和“修理”不能并论的意见，同意俄船于竣工后24小时内出口，否则拆卸军械，同时根据条规交战国船只的修理仅以驶至最近口岸为度的规定，要求俄船的修理限于水面下船壳及机器，舱面上凡关乎战用者，均不得修理，修理时间由船厂工程师开具清单确定。（注：《收上海道致外务部电》（七月初五日）、《收沪道致外务部电》（七月初八日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第7、13页。）19日在船厂工程师报告俄舰的修理分别需要18和28天，以及日总领事小田七的照会抗议之后，袁树勋的态度有所转变，认为工程师出具的修理清单和时间，可以使俄舰恢复作战能力，违背中立条规的规定，转而支持日领的意见，照会俄领并电请外务部照会俄使，要求俄舰必须在48小时内修竣，24小时内出口，其中雷艇1小时尚能行15海里，损伤不大，须于24小时内出口，否则即拆卸军械，停止修理。但同时明确表示这一做法“与日使所称修理拆卸不能并论者有别，仍是遵照中立条规办法”，（注：《收上海道致外务部电》（七月初九日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第15-16页。）强调“俄舰固不能任意增修，日本亦不应强行干预”。（注：《收沪道致外务部电》（七月初九日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第15页。）20日，外务部也根据沪道袁树勋电请，照会俄使，提出同样要求。（注：《外务部发雷使照会》（光绪三十年七月初八日），《清季中日韩关系史料》第9卷，第5926页。）同时，沪道袁树勋又照会驻上海领事团领袖领事，向各国领事通报与俄舰的交涉情况，指责俄领事破坏中国中立，声明由此所产生的一切后果“均系俄国担其责任，而与中国无涉”，试图通过各国施加压力，以使俄舰就范。（注：《沪道袁树勋致沪领袖领事俄舰不守中立条规请转致公会照会》（七月初十日），《清季外交史料》卷184，第1-3页。）
    21日，袁继续照会俄领，声明根据局外中立条规，工程修理期限应由中国地方官酌定，不能由交战国自行决定；俄如不遵守中立章程，不听中立国约束，中国将不承担保护责任。并将上海交涉情况电告外务部，电请外务部照会俄使，电令俄领同意拆卸军械，指出：“俄领见我不但责任，日兵又复逼迫，或可不待竣工而遵起军械；倘公会有人仗义执言，俄人转圜，则尤幸甚。事已到此，非步步紧逼，不能自立地步。”（注：《收沪道致外务部电》（七月十一日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第22页。）为配合袁道的交涉，21、22日外务部连日照会俄使，催促饬令俄领事通知俄舰在48小时内出口，否则赶紧拆卸。（注：《外务部发俄雷使照会》（光绪三十年七月十一、十二日），《清季中日韩关系史料》第9卷，第5931页。）
    在要求俄舰出口的限期过后，23日沪道袁树勋再与俄领谈判，对俄舰的维修时间又展限5天，宣布28日12时为俄舰修竣出口的最后期限。对中方的这一决定，日使内田表示强烈抗议，指责中方未与日方商量，擅自允许俄舰展限出口，“无乃将本国政府所提办法视同弁髦然”，要求中方承担由此所产生的一切责任。（注：《外务部收日本内田使照会》（光绪三十年七月十四日），《清季中日韩关系史料》第9卷，第5936页。）然而，就在日本提出强烈抗议之际，俄领事突然接到本国政府的指示，于24日向沪道声明愿意解除俄舰武装，两船将于当晚7时一律下旗，撤退守护兵丁，请沪道知照税务司与本总领事会商两船拆卸具体事宜；在俄舰“格罗苏福意”号和“阿斯科”号卸去军器、守护兵丁撤退后，其修理工程仍将续行照修；两船的水手则按“满洲”号办法，一部分遣送回国。（注：《收沪道致外务部电》（七月十四日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第29页。）沪道袁树勋当即将这一情况通报各国领事，并由外务部通知日使内田。（注：《沪道袁树勋致沪领袖领事起卸俄舰军械机器照会》（七月十四日），《清季外交史料》卷184，第6-7页；《外务部发日本内田使照会》（光绪三十年七月十五日），《清季中日韩关系史料》第9卷，第5937页。）此后，交涉的焦点便转到续修和俄舰兵弁留沪安置还是遣返回国两事上。
    在俄舰续修问题上，日方坚决反对，认为“俄船既定拆卸，决无任其续修之理”。27日，日使内田在致外务部关于俄舰卸去军械的6条要求中，明确表示“续加修工，乃系恢复战力，故断不可任其续修”。（注：《日使内田致外部酌拟俄舰卸去军装办法六条请切实施行照会》，《清季外交史料》卷184，第9页。）沪道袁树勋也认为应该停修，不但多次与俄领事交涉，而且还照会英国领事配合，令英国船厂停修，同时电请外务部与俄使直接交涉。但俄领事拒不停修，声称拆卸机械，船仍续修，系为俄皇指示，断不能擅自更改，（注：《收沪道致外务部电》（七月十七日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第33页。）并表示日俄开战不知何日结束，如果停修，将来俄舰久冻浦江，若有险失，舰值数百万，须由中国负责。（注：《收沪道致外务部电》（七月二十一日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第37页。）而英国领事为使英国船厂获得一笔颇丰的修船费，对沪道的照会也迟迟不予回答，直至9月2日才复文，称据耶松船厂禀复，俄舰船底损坏，不能乘此潮汛补竣，若必限定停工，则该船将不得不留于坞中，其租坞费不得不向中国索偿。（注：《收上海道致外务部电》（七月二十三日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第39页。）结果，俄巡洋舰“阿斯科”号直至9月10日修竣，才由拖船拖至东清码头靠泊，经海关人员完成卸械工作。（注：《俄船出坞》，《申报》1904年9月11日（光绪三十年八月初二日）。按：俄雷艇“格罗苏福意号”则于此前的8月30日完成卸械工作，见《收沪道致外务部电》（七月二十日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第37页。）
    在俄舰兵弁留沪安置还是遣返回国问题上，沪道和外务部考虑到此次俄船兵丁人数众多，巡洋舰“阿斯科”号计有542人（其中武员21人，兵丁水手等521人），雷艇“格罗苏福意”号计有55人（其中武员4人，兵丁水手等51人），（注：《收上海道致外务部电》（七月二十七日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第44页。）若将他们全部留沪，势必增加上海负担，易生不测，因此赞成俄方意见，亦主张按照“满洲”号办法解决，允许部分俄兵乘中立国船只回国。但日方坚决反对，认为“将俄船员兵遣送回国一事，乃系增加俄国战力”（注：《日使内田致外务部酌拟俄舰卸去军装办法六条切实施行照会》（七月十七日），《清季外交史料》卷184，第9页。），坚持两舰艇员弁兵丁在战争结束之前不得回国，必须上岸圈禁，由中国管押。为此，沪道和外务部与日方多方交涉，希望日方能予通融，按照“满洲”号办法解决，允许俄兵回国，指出：“查沪埠为各国通商要口，人烟最为稠密，与胶州、威海地方迥不相同。兹据沪道电称前因，亦实有为难情形。若将俄兵多名留置岸上，万一滋生事端，谅亦非贵国政府之所愿也。”（注：《外务部发日本内田使照会》（光绪三十年七月十八日），《清季中日韩关系史料》第9卷，第5943-5944页。）对此，日方表示如上海不便安置，可移置别处甚至内地拘束。（注：《收上海道致外务部电》（七月十九日）、《收驻日本杨大臣致外务部电》（七月二十三日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第35、40页。）经多次协商，考虑到俄舰已被解除武装，日方仅同意将俄员弁兵丁留置舰上管押，但为防止俄兵逃逸，日领又向沪道提出以下3条：一、俄官兵均留船，不许散逸；二、中国派兵常川停泊俄船之旁，严密看管；三、令地方官及关卡一并稽查，遇有俄官兵潜逃者，勒令回船，毋任漏网。（注：《收江海关道致外务部电》（七月三十日），《清光绪朝中日交涉史料》卷79，第47页。）另一方面，为防俄兵在上海滋事，沪道袁树勋也与俄领反复交涉，约法四章：一、查取“阿斯科”号巡洋舰和“格罗苏福意”号鱼雷艇员弁兵丁人数；二、另具非中国允准不得擅离上海切结，由俄领加印送上海道台；三、该艇舰停靠浦东东清码头；四、员弁水手每日准在码头左近道胜银行空地体操，并在浦滩散步，不得再往别处闲游，即偶至租界地方，亦应限定人数、时刻，另委派妥当之人巡察。（注：《江督周馥咨外部据沪道禀拟约束俄兵七条请照会俄使饬遵文》（十二月十一日），《清季外交史料》卷186，第9页。）尽管如此，还是没有能够完全避免因俄兵置留沪上而发生的事端。