从崇祯二年(1629)崇祯帝的《赠官制书》中不难看出，将顾宪成从祀孔庙实际上不存在什么阻力，如果崇祯帝有时间行此祀典，后人对顾宪成的学统地位将不会有太多的争论。崇祯十四年(1641)以后，明王朝大厦将倾，朝廷已经无暇顾及从祀文庙之事。马世奇为恩师顾宪成写《泾皋藏稿》序文时，明朝尚未亡国，他略带遗憾地说“今所需两楹祔祀之典耳”；然而他坚信：“先生文具在，知必有援河津、新建诸君子例以请者。”(125)康熙年间为配合修史，《顾端文公年谱》的修撰者特意将崇祯皇帝的《赠官制书》全文刻录于开卷第一页，在其下，顾枢又结合崇祯十四年礼部开列从祀名单一事做了说明：
    先端文一生三奉恩纶，至是首称道统学宗，中推孔孟濂洛，其于圣真嫡系，正体真功三致意焉，末更谆谆俎豆褒崇之典。文庙从祀所需者，廷臣一疏上请耳。十四年礼曹始列公名并嘉靖以前诸儒，汇请增入两廡。上嫌开列人众，著候旨行。然追诵制词，曷敢忘异数也，敬用謄写，冠于编年。(126)
    在《年谱》卷后，撰者再次提及从祀一事，希望“崇儒钜典仍当百世以俟圣人云尔”(127)。
    弄明白顾宪成因明亡过早而没有来得及从祀孔庙，是为了证明崇祯帝及当时朝廷舆论完全承认顾宪成的道统学宗地位，而并非将东林之人视为党同伐异之群体。顺治、康熙两朝，《明史》处于纂修过程，雍正、乾隆时期，清廷对思想的禁锢逐渐加强，清高宗罔顾历史事实，借《四库全书》的编纂，公开否定了顾、高等人的历史作用，表明了不同于《明史》的褒贬原则。这不仅使顾宪成从祀孔庙变得完全没有可能，而且重新确立起来的政治价值观，更对后世产生了十分不良的影响。
    注释：
    ①[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》，光绪三年重刊泾里宗祠藏板。
    ②《明神宗实录》卷四九六，万历四十年六月甲申条，台北，中研院史语所校勘影印本，1965年，第9349页。
    ③[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    ④[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    ⑤万历《大明会典》卷一○一礼部五十九《丧礼六·恩卹》，《续修四库全书》第791册，上海，上海古籍出版社，2002年，第54页。
    ⑥[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。检讨为从七品，赞善为从六品，陈献章、罗洪先分别以检讨、赞善谥“文恭”。
    ⑦[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    ⑧《明神宗实录》卷五○三，万历四十年十二月甲午条，第9538页。
    ⑨康熙十四年，孙奇逢去世后，河南、河北学者“岁时奉祀百泉书院”，在他的家乡容城，则与刘因、杨继盛同祀，在保定则与孙承宗、鹿善继并祀于学宫(见方苞著，刘季高校点：《方苞集》卷八《传·孙徵君传》，上海，上海古籍出版社，1983年，第214页)，道光八年被准予从祀文庙。
    ⑩[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    (11)[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    (12)[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    (13)[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    (14)[清]刘宗周：《刘蕺山先生奏疏》卷八《奏疏一·修正学疏》，《四库禁毁书丛刊》史部第38册，北京，北京出版社，2000年，第599页。
    (15)[明]顾枢、顾贞观：《顾端文公年谱》卷四《谱后》。
    (16)金坛人于玉立是东林党中的重要的人物，登万历十一年进士，二十年七月以刑部员外郎疏陈时政阙失，言辞甚为激烈。后妖书案起，力庇郭正域。削籍后，与东林声气相通，凡“攻东林者，率谓玉立遥制朝权，以是诟病东林”(见[清]佚名：《明季烈臣传》第三册《于玉立传》，《孤本明代人物小传》，全国图书馆文献缩印中心影印本，2003年，第6册，第436页)，顾宪成病逝后，昆、宣党人加紧报复东林，“归狱于公玉立，丁公元荐等”(见刘汋：《刘忠介公年谱》上卷，《北京图书馆藏珍本年谱丛刊》第58册，北京，北京图书馆出版社，1998年，第193页)，因而于玉立一度成为东林的“替罪羊”。于玉立居家甚久，数被推荐，终不出。“天启初录先朝罪谴诸臣，玉立已前卒，赠尚宝卿”(见[清]佚名：《明季烈臣传》第三册《于玉立传》，《孤本明代人物小传》第6册，第436页)。赠官为恩卹之一，可视为盖棺定论，表明以往亓诗教等东林政敌对于玉立的不实之词均被推翻。以后魏忠贤又大兴党狱，于玉立虽然没有被列入《东林党人榜》，却被列入《东林同志录》和《盗柄东林夥》。于玉立在《盗柄东林夥》中被列在“东林盛”期，这一部分人被阉党说成是“入主出奴，渐移国柄”(见《东林别乘》，1958年广东省中山图书馆据澄海高氏稿本缮印)。另据《顾端文公年谱》载，万历四十年八月东林公奠顾宪成，同年、同社及后学门生于孔兼、钱一本、丁元荐、钱谦益等四十余人入泾拜奠。祭奠的规模并不大，参与者人数也有限，然而于玉立却在其中，足见他与东林的关系非同一般。清代有人辑录明代天顺至南明、永历年间烈臣千余人，成《明季烈臣传》一书，将《于玉立传》附于《丁元荐传》下。
    (17)《明神宗实录》卷五一三，万历四十一年十月戊子条，第9693页。