万历二年建成的关闸，其间似乎已被损坏，故至万历四十年时，两广总督张鸣岗提出建议：
    仍于塘基湾等处垒石为关，守以甲士四百人。（注：《明神宗实录》卷四九九万历四十年九月戊戌条。）塘基湾即塘基环，亦即莲花茎，田生金《条陈海防疏》：
    其上通香山，只有一路如臂，名曰塘基环，原设关一所。（注：（明）田生金《按粤疏稿》卷三《条陈海防疏》。）“原设关一所”，可知，至万历末，原关闸确已被毁，故张鸣岗建议在塘基环“垒石为关”，重新修建。据此可知，澳门关闸，始建于万历二年，至万历四十年时又重建。
    关于香山参将设立的时间，诸书所载各异。《明熹宗实录》卷十一天启元年六月丙子条之按语：
    万历四十二年，始设参将府于中路雍陌营，调千人守之。（注：《明熹宗实录》卷十一天启元年六月丙子条。）然据《明神宗实录》卷五七六万历四十六年十一月壬寅条：
    广东巡视海道副使罗之鼎言：香山濠镜澳为粤东第一要害，以一把总统兵六百防守，无禅弹压，可移罗定东西一将，抽兵六百，助守澳门。（注：《明神宗实录》卷五七六万历四十六年十一月壬寅条。）可见，至万历四十六年十一月时，澳门还是以把总统兵镇守。又载：
    布按二司谓：……宜以东山改设守卫，隶西山参将提调，移其兵四百于鹰儿浦，合原兵为一千，而以香山寨改为参将。增置营舍，大建旗鼓，以折乱萌。（注：《明神宗实录》卷五七六万历四十六年十一月壬寅条。）至万历四十六年十一月以后，布按二司才正式提出“以香山寨改为参将”。阮元《广东通志》卷二四二：
    王命璇……由新会令擢监察御史，出按粤，设澳门参戎以增防守。（注：（清）阮元《广东通志》卷二四二《宦绩》十二。）王命璇于万历四十五年任广东巡按御史，万历四十六年即与两广总督许弘纲共同上疏，要求裁撤海防同知，设香山参将。可见，香山参将的设立实际上是万历四十六年的事情。《熹宗实录》卷十一天启元年之按语称“万历四十二年，始设参将府于中路雍陌营”，这里很可能仅只是“议设”参将。据康熙《香山县志》卷九：
    雍陌营，在谷字都雍陌村，万历四十二年设，戊午红彝犯澳，移营鹰鱼浦，随请南头游师带兵四百名、哨船六只防守。（注：（清）申良翰《香山县志》卷九《兵防志》。）此处称万历四十二年设的只是“雍陌营”，并非“参将府”，戊午，即万历四十六年，可见，康熙《香山县志》认为是万历四十二年建雍陌营，万历四十六年将营兵移驻鹰儿浦并调南头兵四百，组建参将。《明史·佛郎机传》在万历四十二年张鸣岗上疏兵部并被批准后称：
    居三年，设参将于中路雍陌营。（注：（清）张廷玉《明史》卷三二五《佛郎机传》。）《明神宗实录》卷五二七载张鸣岗之上疏时间是万历四十二年十二月乙未，如果到兵部批复之后，至少在万历四十三年春季以后，然后再“居三年”，则亦是万历四十六年，亦与前引材料相合，故可证，香山参将的始设年代在万历四十六年。（注：戴裔煊：《明史·佛郎机传笺证》，中国社会科学出版社1984年版，第102～103页认为，《明史·佛郎机传》先载万历四十二年张鸣岗疏后三年改参将，故以万历四十五年为香山参将设立时间，不确。）康熙《香山县志》卷四记录的第一位香山参将名胡文烜，在万历四十八年任职，（注：（清）申良翰《香山县志》卷四《秩官志》。）明朝新设职官，晚一两年才正式出任者，亦为多见。至天启元年（1621年），又在前山设寨，“并改设参将于前山寨，陆兵七百名，把总二员，哨官四员，哨船大小五十号，分戍石龟潭、秋风角、茅湾口、桂椗角、横洲、深井、九洲洋、老万山、狐狸洲、金星门。”（注：（清）印光任、张汝霖《澳门记略》卷上《官守篇》。）明王朝对澳门的军事防御，逐渐周备严密，“终明之世无他虞”（注：（清）印光任、张汝霖《澳门记略》卷上《官守篇》。）。
    五、市舶提举驻于香山
    嘉靖四十四年（1565年）叶权在其《游岭南记》中记录了澳门有“抽分官”一职：
    今数千夷团聚一澳，……守澳武职及抽分官但以美言奖诱之。（注：（明）叶权《贤博编》附《游岭南记》。）抽分官，即负责抽分的官员，亦即对外商征税的官员。明初，对于外国来华进贡的国家都是不征税的，但由于许多外国商人借进贡之名，附带大批货物来华贸易，以获取巨额利润，故从明中叶起，开始对非进贡国家私商贸易实行“抽分”制。戴璟《广东通志初稿》载：
    我朝互市，立市舶提举司以主诸番入贡，……若国王、王妃、陪臣等附至货物，抽其十之五入官，其余官给之直。暹维、爪哇二国免抽，其番商私赍货物入为市易者，舟至水次，官悉封籍之，抽其十二，乃听贸易。（注：（明）戴璟《广东通志初稿》卷三十《番舶》。）明代掌管外商入华贸易的官员为市舶提举，而明初由于“内臣监镇市舶”（注：《明神宗实录》卷五七六万历四十六年十一月壬寅条。），市舶司官员并无实权。至嘉靖十年五月：